Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ASQ6

Protein Details
Accession A0A178ASQ6    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-52SYQSTVTKQRRLPQPPKAAQKQLIQHydrophilic
447-469GAFVMPKKRGRPKKRSPVVIAPEHydrophilic
580-605LEAAEDKPKKPKQKRKHNRMGDGSVLBasic
614-636AEAAHKMLKKRSKQFSNHINYDRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
453-461KKRGRPKKR
586-598KPKKPKQKRKHNR
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
Amino Acid Sequences MSAAVGPRTGRAPRLKSIVASSKTPTISYQSTVTKQRRLPQPPKAAQKQLIQCCENPNISSDDGSIICYNCGMEHEKLDIVSEVTFGETAGGAAMVEGGFIGENQRHANSMGGTMRGLGGMASREQSEMLGRQEIEKIGSSLLVQQAVRDQALSWYKLAMNHGFVQGRRMRNVAAVAIYMAARRQKGNTLMLMDLAEKVQVNVWALGDTYKAFLKMLSERDPAQLAGNTAVQEIEPLMLKYCRKLEFAEASHKVANDACKILRRMNRDWMVQGRQPAGLCGACIILAARMNNFRRTVREVVYVVKVADSTINSRLYEYRQTPSSVLTINQFREFGERLKVTTQPPAIWRREQKEERREKRRQADSAALEESDEGEAEAGATTAPVRTSKRRKANSGTPQEVVPSDELSDTLAIDGLDVAALDGNDEELIGALGDAVEHSVDHGAEDGAFVMPKKRGRPKKRSPVVIAPEDLEIEQEIESELTDTIKDWEATFKEFTQNEQHPLLKATGWTAQQMARAHLDQRDIPVNDSPDIDEDEFDDDPDVANCILGPEEVRRKELIWITENEEWLRAQQKKLLEAELEAAEDKPKKPKQKRKHNRMGDGSVLEGQPAASAAEAAHKMLKKRSKQFSNHINYDRLKELFPGGTTASSPSGTGSGQGASPAASQAVQTPPIMPVPDNDAEGDEEEEEEEQVDYEEEEGNYLSDEEEGFGGYDDDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.51
3 0.49
4 0.54
5 0.56
6 0.51
7 0.49
8 0.46
9 0.45
10 0.44
11 0.42
12 0.36
13 0.33
14 0.32
15 0.31
16 0.34
17 0.34
18 0.39
19 0.48
20 0.52
21 0.54
22 0.57
23 0.64
24 0.68
25 0.72
26 0.75
27 0.76
28 0.81
29 0.81
30 0.86
31 0.86
32 0.84
33 0.8
34 0.8
35 0.79
36 0.76
37 0.75
38 0.67
39 0.62
40 0.59
41 0.58
42 0.52
43 0.43
44 0.36
45 0.32
46 0.3
47 0.28
48 0.23
49 0.2
50 0.18
51 0.2
52 0.19
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.14
57 0.11
58 0.14
59 0.16
60 0.15
61 0.17
62 0.19
63 0.2
64 0.19
65 0.2
66 0.18
67 0.14
68 0.13
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.06
89 0.07
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.14
95 0.16
96 0.15
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.13
104 0.12
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.14
116 0.15
117 0.17
118 0.17
119 0.18
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.18
124 0.16
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.13
129 0.14
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.15
137 0.13
138 0.17
139 0.21
140 0.22
141 0.19
142 0.19
143 0.2
144 0.22
145 0.26
146 0.22
147 0.21
148 0.21
149 0.26
150 0.26
151 0.25
152 0.3
153 0.33
154 0.34
155 0.33
156 0.32
157 0.29
158 0.28
159 0.3
160 0.24
161 0.18
162 0.14
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.09
167 0.1
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.15
172 0.19
173 0.24
174 0.27
175 0.28
176 0.27
177 0.26
178 0.25
179 0.24
180 0.19
181 0.15
182 0.12
183 0.1
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.11
202 0.14
203 0.19
204 0.23
205 0.24
206 0.25
207 0.27
208 0.28
209 0.25
210 0.23
211 0.19
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.12
216 0.11
217 0.11
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.07
225 0.1
226 0.11
227 0.13
228 0.18
229 0.2
230 0.21
231 0.22
232 0.26
233 0.3
234 0.33
235 0.39
236 0.36
237 0.36
238 0.36
239 0.34
240 0.29
241 0.24
242 0.24
243 0.17
244 0.17
245 0.16
246 0.2
247 0.22
248 0.28
249 0.31
250 0.35
251 0.37
252 0.44
253 0.47
254 0.44
255 0.46
256 0.45
257 0.45
258 0.4
259 0.39
260 0.31
261 0.28
262 0.27
263 0.23
264 0.19
265 0.15
266 0.12
267 0.09
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.14
277 0.16
278 0.2
279 0.22
280 0.22
281 0.24
282 0.3
283 0.32
284 0.28
285 0.3
286 0.28
287 0.28
288 0.29
289 0.26
290 0.2
291 0.17
292 0.14
293 0.1
294 0.11
295 0.09
296 0.09
297 0.12
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.16
302 0.17
303 0.22
304 0.22
305 0.21
306 0.21
307 0.23
308 0.22
309 0.22
310 0.21
311 0.16
312 0.14
313 0.15
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.17
318 0.15
319 0.17
320 0.18
321 0.16
322 0.17
323 0.16
324 0.16
325 0.18
326 0.21
327 0.19
328 0.23
329 0.22
330 0.19
331 0.24
332 0.3
333 0.31
334 0.33
335 0.38
336 0.37
337 0.46
338 0.51
339 0.55
340 0.59
341 0.67
342 0.71
343 0.75
344 0.78
345 0.77
346 0.79
347 0.78
348 0.7
349 0.63
350 0.61
351 0.53
352 0.48
353 0.4
354 0.3
355 0.23
356 0.2
357 0.16
358 0.09
359 0.07
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.02
367 0.02
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.06
372 0.09
373 0.18
374 0.27
375 0.36
376 0.46
377 0.51
378 0.57
379 0.62
380 0.69
381 0.71
382 0.71
383 0.65
384 0.56
385 0.51
386 0.46
387 0.38
388 0.3
389 0.2
390 0.11
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.02
415 0.03
416 0.02
417 0.02
418 0.02
419 0.02
420 0.02
421 0.02
422 0.02
423 0.02
424 0.02
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.04
435 0.05
436 0.05
437 0.07
438 0.11
439 0.14
440 0.22
441 0.31
442 0.42
443 0.52
444 0.63
445 0.72
446 0.8
447 0.85
448 0.86
449 0.83
450 0.82
451 0.78
452 0.71
453 0.6
454 0.5
455 0.42
456 0.34
457 0.27
458 0.17
459 0.11
460 0.08
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.07
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.13
476 0.14
477 0.17
478 0.19
479 0.18
480 0.23
481 0.23
482 0.25
483 0.29
484 0.31
485 0.32
486 0.34
487 0.34
488 0.28
489 0.3
490 0.28
491 0.2
492 0.17
493 0.16
494 0.17
495 0.16
496 0.16
497 0.16
498 0.17
499 0.21
500 0.22
501 0.22
502 0.2
503 0.21
504 0.22
505 0.22
506 0.24
507 0.2
508 0.22
509 0.27
510 0.25
511 0.26
512 0.27
513 0.27
514 0.25
515 0.25
516 0.22
517 0.16
518 0.19
519 0.17
520 0.14
521 0.12
522 0.14
523 0.14
524 0.13
525 0.12
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.07
537 0.12
538 0.2
539 0.22
540 0.24
541 0.25
542 0.25
543 0.31
544 0.34
545 0.34
546 0.3
547 0.31
548 0.35
549 0.36
550 0.37
551 0.32
552 0.28
553 0.23
554 0.22
555 0.27
556 0.24
557 0.23
558 0.26
559 0.29
560 0.33
561 0.35
562 0.35
563 0.27
564 0.25
565 0.26
566 0.23
567 0.2
568 0.16
569 0.14
570 0.16
571 0.18
572 0.19
573 0.26
574 0.33
575 0.43
576 0.53
577 0.64
578 0.71
579 0.8
580 0.89
581 0.91
582 0.95
583 0.94
584 0.94
585 0.91
586 0.85
587 0.79
588 0.69
589 0.6
590 0.52
591 0.41
592 0.31
593 0.22
594 0.16
595 0.1
596 0.1
597 0.08
598 0.04
599 0.05
600 0.05
601 0.1
602 0.1
603 0.11
604 0.16
605 0.19
606 0.22
607 0.31
608 0.39
609 0.44
610 0.53
611 0.63
612 0.68
613 0.74
614 0.8
615 0.83
616 0.84
617 0.84
618 0.79
619 0.76
620 0.69
621 0.65
622 0.6
623 0.5
624 0.41
625 0.34
626 0.32
627 0.27
628 0.25
629 0.23
630 0.19
631 0.18
632 0.18
633 0.19
634 0.17
635 0.15
636 0.14
637 0.13
638 0.13
639 0.12
640 0.13
641 0.12
642 0.11
643 0.11
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.09
649 0.09
650 0.08
651 0.08
652 0.12
653 0.15
654 0.16
655 0.16
656 0.17
657 0.18
658 0.2
659 0.22
660 0.18
661 0.16
662 0.22
663 0.23
664 0.23
665 0.22
666 0.2
667 0.2
668 0.21
669 0.21
670 0.14
671 0.12
672 0.12
673 0.12
674 0.1
675 0.1
676 0.08
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.08
682 0.1
683 0.09
684 0.1
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.08
691 0.08
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.08
696 0.08