Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B708

Protein Details
Accession A0A178B708    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-208SEEEEREARRERRRKRRRRKDGDESEDASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
186-199EARRERRRKRRRRK
Subcellular Location(s) nucl 7.5, cyto_nucl 7, mito 6, cyto 5.5, plas 2, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012860  Afi1_N  
IPR037516  Tripartite_DENN  
Pfam View protein in Pfam  
PF07792  Afi1  
PF08616  SPA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50211  DENN  
Amino Acid Sequences MDTIAFAAMHVAAQRPHPPSSANASSPSLSSAQAQQPPVSLQRQPSFSSFPSSRSPSSISLRNDRKARSPQPPMLREALLPEDVDSVHSSQGSEQQSDLAMPSASTSRLRSQYPPDAIENHVEYILVASFDIDRGSIMEHQYPAAISGDETMLAELMLPDQAHMRNQDWTIFFLHKDTSSEEEEREARRERRRKRRRRKDGDESEDASGAEDVDGEDDDEDGEYDTASEDEGDPDGPPLVYVLNLVNTKLDTTVKRGSIVKAMAICTRHSFLHIYKPLLLLALEEYFRAPVVETLASLYNALNAMDLSLLPRLSLLENFVLSASDAKDMFIEKFEQMVRQQKKIDAQRDSLETRRKKTYALPRDTHEFESKINYNGIPIPVKIPTALSAETVGDFSLIKLIQTFSTTHATQPQPFALHPHLTTNGAYTHPIIVLVNALLTQKRIIFLGHNRPSGEVAEAVLAACALASGGILRGFVRHAFPYTDLTKVDDLLKVPGFIAGVTNPAFSYKPEWWDLLCDLPTGRMKISNKIEAAAPTEGSLFFQQQGIQVNGPNGAGPDNKAGIDTTGDNAFMDSLLQAIANRHGENAIRAKWRSWVLKFTRITAAFEETVYGASALYIGSHDYDHGAYGVSGHGYVWPDENSRMKELAVNVHRIEGWRNTRSYYSCVQDLARSWSKRPMRGLDFAHQHDKLRYLKLSHDASAAIYLALAKCVEDAGGASESISIPELDENMQSLTLANDPERKPGPQLQYDTILQLLCVMPDSNAGLFYLSLGLFHPRLDVRMAVVKLLERIMDHPAGRLLWANLGRFAKLAFFRVKREEAHGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.27
4 0.28
5 0.29
6 0.31
7 0.39
8 0.42
9 0.37
10 0.37
11 0.38
12 0.37
13 0.36
14 0.34
15 0.26
16 0.21
17 0.2
18 0.23
19 0.28
20 0.32
21 0.34
22 0.32
23 0.33
24 0.35
25 0.39
26 0.37
27 0.34
28 0.36
29 0.4
30 0.43
31 0.44
32 0.45
33 0.45
34 0.42
35 0.46
36 0.4
37 0.38
38 0.42
39 0.44
40 0.42
41 0.4
42 0.43
43 0.4
44 0.45
45 0.49
46 0.48
47 0.52
48 0.58
49 0.63
50 0.65
51 0.63
52 0.65
53 0.67
54 0.7
55 0.7
56 0.71
57 0.72
58 0.76
59 0.76
60 0.72
61 0.66
62 0.59
63 0.49
64 0.44
65 0.38
66 0.29
67 0.25
68 0.21
69 0.18
70 0.16
71 0.18
72 0.16
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.2
79 0.22
80 0.21
81 0.2
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.13
87 0.1
88 0.08
89 0.1
90 0.1
91 0.12
92 0.14
93 0.17
94 0.22
95 0.27
96 0.3
97 0.33
98 0.4
99 0.47
100 0.5
101 0.5
102 0.46
103 0.45
104 0.44
105 0.44
106 0.38
107 0.29
108 0.24
109 0.2
110 0.17
111 0.15
112 0.14
113 0.09
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.08
123 0.1
124 0.13
125 0.15
126 0.16
127 0.16
128 0.16
129 0.16
130 0.15
131 0.13
132 0.11
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.09
148 0.1
149 0.13
150 0.16
151 0.17
152 0.2
153 0.21
154 0.25
155 0.23
156 0.24
157 0.25
158 0.24
159 0.22
160 0.2
161 0.21
162 0.17
163 0.18
164 0.19
165 0.2
166 0.23
167 0.24
168 0.23
169 0.25
170 0.28
171 0.28
172 0.31
173 0.34
174 0.37
175 0.46
176 0.55
177 0.62
178 0.7
179 0.79
180 0.85
181 0.89
182 0.93
183 0.94
184 0.96
185 0.96
186 0.96
187 0.95
188 0.92
189 0.88
190 0.79
191 0.69
192 0.58
193 0.48
194 0.37
195 0.26
196 0.18
197 0.1
198 0.07
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.14
238 0.12
239 0.17
240 0.22
241 0.23
242 0.25
243 0.27
244 0.27
245 0.29
246 0.28
247 0.25
248 0.21
249 0.22
250 0.22
251 0.21
252 0.21
253 0.19
254 0.2
255 0.18
256 0.18
257 0.19
258 0.18
259 0.27
260 0.29
261 0.29
262 0.28
263 0.29
264 0.27
265 0.24
266 0.22
267 0.13
268 0.1
269 0.1
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.09
320 0.11
321 0.11
322 0.13
323 0.15
324 0.25
325 0.27
326 0.29
327 0.31
328 0.31
329 0.39
330 0.44
331 0.48
332 0.42
333 0.42
334 0.41
335 0.43
336 0.43
337 0.41
338 0.43
339 0.4
340 0.4
341 0.43
342 0.41
343 0.38
344 0.44
345 0.49
346 0.51
347 0.55
348 0.53
349 0.5
350 0.55
351 0.56
352 0.51
353 0.43
354 0.33
355 0.25
356 0.28
357 0.26
358 0.22
359 0.21
360 0.17
361 0.15
362 0.16
363 0.17
364 0.13
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.13
393 0.14
394 0.14
395 0.2
396 0.21
397 0.21
398 0.22
399 0.2
400 0.17
401 0.17
402 0.2
403 0.16
404 0.17
405 0.16
406 0.16
407 0.16
408 0.16
409 0.16
410 0.14
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.1
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.07
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.04
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.07
432 0.1
433 0.16
434 0.27
435 0.31
436 0.33
437 0.33
438 0.33
439 0.33
440 0.3
441 0.25
442 0.14
443 0.09
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.05
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.04
461 0.05
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.1
467 0.12
468 0.16
469 0.16
470 0.17
471 0.16
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.16
476 0.13
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.12
481 0.11
482 0.11
483 0.09
484 0.08
485 0.08
486 0.05
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.07
491 0.08
492 0.09
493 0.08
494 0.13
495 0.13
496 0.16
497 0.18
498 0.19
499 0.17
500 0.2
501 0.2
502 0.18
503 0.17
504 0.14
505 0.12
506 0.14
507 0.16
508 0.15
509 0.14
510 0.18
511 0.19
512 0.26
513 0.31
514 0.33
515 0.31
516 0.31
517 0.32
518 0.27
519 0.29
520 0.21
521 0.17
522 0.12
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.09
528 0.08
529 0.09
530 0.09
531 0.11
532 0.14
533 0.14
534 0.14
535 0.14
536 0.14
537 0.14
538 0.14
539 0.12
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.09
544 0.1
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.1
550 0.11
551 0.1
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.08
558 0.06
559 0.06
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.06
566 0.09
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.13
571 0.14
572 0.17
573 0.21
574 0.22
575 0.26
576 0.27
577 0.27
578 0.31
579 0.37
580 0.4
581 0.37
582 0.42
583 0.42
584 0.5
585 0.5
586 0.49
587 0.51
588 0.45
589 0.44
590 0.37
591 0.35
592 0.27
593 0.26
594 0.23
595 0.15
596 0.14
597 0.12
598 0.1
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.05
607 0.05
608 0.06
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.07
613 0.07
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.06
618 0.06
619 0.05
620 0.07
621 0.08
622 0.09
623 0.11
624 0.12
625 0.13
626 0.18
627 0.23
628 0.24
629 0.26
630 0.26
631 0.24
632 0.26
633 0.26
634 0.31
635 0.3
636 0.32
637 0.29
638 0.29
639 0.3
640 0.28
641 0.29
642 0.28
643 0.32
644 0.32
645 0.33
646 0.34
647 0.37
648 0.39
649 0.4
650 0.37
651 0.34
652 0.31
653 0.32
654 0.31
655 0.29
656 0.29
657 0.33
658 0.36
659 0.34
660 0.34
661 0.42
662 0.47
663 0.5
664 0.54
665 0.54
666 0.51
667 0.56
668 0.59
669 0.58
670 0.59
671 0.58
672 0.59
673 0.52
674 0.49
675 0.44
676 0.44
677 0.4
678 0.39
679 0.38
680 0.33
681 0.36
682 0.42
683 0.43
684 0.38
685 0.35
686 0.3
687 0.27
688 0.26
689 0.21
690 0.13
691 0.09
692 0.1
693 0.08
694 0.09
695 0.08
696 0.07
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.05
701 0.06
702 0.08
703 0.09
704 0.08
705 0.08
706 0.09
707 0.09
708 0.1
709 0.1
710 0.07
711 0.07
712 0.08
713 0.09
714 0.09
715 0.1
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.1
723 0.11
724 0.13
725 0.2
726 0.21
727 0.28
728 0.3
729 0.31
730 0.34
731 0.41
732 0.46
733 0.46
734 0.51
735 0.48
736 0.5
737 0.5
738 0.45
739 0.39
740 0.31
741 0.23
742 0.19
743 0.16
744 0.11
745 0.11
746 0.1
747 0.09
748 0.11
749 0.13
750 0.11
751 0.11
752 0.11
753 0.1
754 0.09
755 0.1
756 0.1
757 0.08
758 0.08
759 0.09
760 0.13
761 0.13
762 0.13
763 0.16
764 0.15
765 0.17
766 0.19
767 0.19
768 0.18
769 0.25
770 0.26
771 0.23
772 0.24
773 0.23
774 0.23
775 0.23
776 0.21
777 0.14
778 0.16
779 0.2
780 0.23
781 0.22
782 0.22
783 0.24
784 0.23
785 0.23
786 0.24
787 0.19
788 0.22
789 0.26
790 0.25
791 0.29
792 0.3
793 0.3
794 0.27
795 0.27
796 0.26
797 0.24
798 0.29
799 0.32
800 0.34
801 0.4
802 0.47
803 0.5
804 0.47