Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A178AZ91

Protein Details
Accession A0A178AZ91    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-177IPNKLLGARKTKKKGGTRKKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-177GARKTKKKGGTRKKA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
IPR038846  RPC9  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MHIKNPQSALLSNHEVLLHLRKELAEYTGNDDTGRKRAQPSGLGHMLRDGIAYLETTDYTVDNLATTHPTRPMTLYKGEHSLFRKLAPKYRLNKAEYLQLYNLRPTSQVMLELIIEEAGTRFTEEQLLDILEICRAVFEEDEAEIPDDAEFKYIEPIPNKLLGARKTKKKGGTRKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.25
4 0.28
5 0.22
6 0.18
7 0.18
8 0.17
9 0.19
10 0.2
11 0.2
12 0.17
13 0.18
14 0.24
15 0.25
16 0.25
17 0.24
18 0.25
19 0.24
20 0.26
21 0.27
22 0.23
23 0.24
24 0.29
25 0.33
26 0.38
27 0.39
28 0.41
29 0.45
30 0.43
31 0.39
32 0.36
33 0.32
34 0.24
35 0.2
36 0.12
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.06
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.13
56 0.14
57 0.15
58 0.17
59 0.19
60 0.19
61 0.24
62 0.25
63 0.23
64 0.27
65 0.27
66 0.29
67 0.29
68 0.3
69 0.25
70 0.25
71 0.3
72 0.27
73 0.33
74 0.34
75 0.4
76 0.41
77 0.48
78 0.52
79 0.48
80 0.5
81 0.44
82 0.46
83 0.4
84 0.37
85 0.31
86 0.28
87 0.26
88 0.25
89 0.24
90 0.17
91 0.16
92 0.14
93 0.15
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.06
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.11
140 0.14
141 0.19
142 0.2
143 0.24
144 0.25
145 0.28
146 0.28
147 0.28
148 0.33
149 0.34
150 0.43
151 0.49
152 0.56
153 0.62
154 0.69
155 0.74
156 0.77
157 0.82