Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178BCE1

Protein Details
Accession A0A178BCE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MPRKKPRFHSLKKLNVRQDWSRHydrophilic
56-78HGEHIQEKKWKRQFKRNLPAVVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-214RRITKEKAAARAEEREKNPVRP
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito_nucl 11, mito 9.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MPRKKPRFHSLKKLNVRQDWSRWSLYSIAQLRPPNVTTKTYFQQKWAAKAGTRAYHGEHIQEKKWKRQFKRNLPAVVPMDHKYLARNDGSEQAAGRGMGADSEDKKRSPPMTPYMQMTYYPLERRLDTAIFRALFASSVRQAHQFVVHGLVKVNGKKMQFPGYQLNPGDMFQVDPSSVMFATGAQKTRSGLARRITKEKAAARAEEREKNPVRPPPKTHATESTRDEPTPTELKKHLQTMMEQVDDVLAEDVKAKDKQKFRAFRQTVKKAIGLWRSANPETISTLDAQFDFLKTQIAEKSPTASPSRDASASAEPLISAEDQAKLRSAFEKLRLETEHTSAWNRRNPTAPYATPWRPRDYMSAFAFIPRYLEVNQNICAAVYLRHPVARPGLAEVPTPFHIETGQLAFNWYLRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.86
3 0.84
4 0.8
5 0.77
6 0.74
7 0.69
8 0.64
9 0.55
10 0.49
11 0.45
12 0.4
13 0.41
14 0.38
15 0.36
16 0.38
17 0.41
18 0.4
19 0.41
20 0.41
21 0.38
22 0.37
23 0.38
24 0.36
25 0.39
26 0.45
27 0.51
28 0.5
29 0.48
30 0.54
31 0.53
32 0.56
33 0.57
34 0.53
35 0.45
36 0.51
37 0.53
38 0.49
39 0.47
40 0.43
41 0.39
42 0.41
43 0.4
44 0.39
45 0.39
46 0.39
47 0.42
48 0.49
49 0.5
50 0.55
51 0.63
52 0.67
53 0.68
54 0.74
55 0.8
56 0.82
57 0.88
58 0.86
59 0.85
60 0.77
61 0.76
62 0.68
63 0.61
64 0.53
65 0.44
66 0.39
67 0.33
68 0.31
69 0.25
70 0.26
71 0.27
72 0.24
73 0.23
74 0.22
75 0.26
76 0.27
77 0.25
78 0.22
79 0.18
80 0.18
81 0.16
82 0.15
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.1
88 0.12
89 0.18
90 0.2
91 0.2
92 0.22
93 0.27
94 0.29
95 0.31
96 0.35
97 0.37
98 0.42
99 0.44
100 0.47
101 0.44
102 0.42
103 0.38
104 0.33
105 0.29
106 0.26
107 0.25
108 0.25
109 0.24
110 0.23
111 0.25
112 0.26
113 0.25
114 0.22
115 0.22
116 0.23
117 0.21
118 0.21
119 0.2
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.14
124 0.12
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.17
129 0.18
130 0.19
131 0.17
132 0.14
133 0.18
134 0.18
135 0.16
136 0.15
137 0.17
138 0.19
139 0.2
140 0.22
141 0.21
142 0.2
143 0.23
144 0.26
145 0.3
146 0.28
147 0.31
148 0.35
149 0.34
150 0.38
151 0.35
152 0.34
153 0.27
154 0.26
155 0.23
156 0.15
157 0.13
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.09
169 0.11
170 0.13
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.16
175 0.21
176 0.21
177 0.24
178 0.29
179 0.36
180 0.39
181 0.45
182 0.43
183 0.4
184 0.43
185 0.41
186 0.42
187 0.36
188 0.35
189 0.32
190 0.37
191 0.4
192 0.4
193 0.37
194 0.38
195 0.38
196 0.4
197 0.42
198 0.42
199 0.43
200 0.42
201 0.46
202 0.45
203 0.51
204 0.51
205 0.49
206 0.51
207 0.51
208 0.51
209 0.5
210 0.48
211 0.42
212 0.38
213 0.36
214 0.28
215 0.27
216 0.28
217 0.24
218 0.22
219 0.23
220 0.27
221 0.29
222 0.31
223 0.3
224 0.25
225 0.26
226 0.28
227 0.29
228 0.25
229 0.22
230 0.19
231 0.15
232 0.14
233 0.13
234 0.07
235 0.04
236 0.04
237 0.06
238 0.06
239 0.09
240 0.13
241 0.15
242 0.22
243 0.28
244 0.37
245 0.45
246 0.53
247 0.57
248 0.65
249 0.66
250 0.69
251 0.74
252 0.72
253 0.68
254 0.62
255 0.57
256 0.49
257 0.52
258 0.48
259 0.4
260 0.35
261 0.34
262 0.37
263 0.36
264 0.36
265 0.29
266 0.25
267 0.23
268 0.22
269 0.18
270 0.14
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.11
280 0.1
281 0.12
282 0.14
283 0.15
284 0.17
285 0.17
286 0.21
287 0.2
288 0.24
289 0.25
290 0.23
291 0.24
292 0.23
293 0.26
294 0.22
295 0.22
296 0.22
297 0.22
298 0.22
299 0.2
300 0.17
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.11
305 0.08
306 0.08
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.15
311 0.14
312 0.15
313 0.17
314 0.2
315 0.21
316 0.28
317 0.35
318 0.34
319 0.38
320 0.39
321 0.42
322 0.41
323 0.39
324 0.35
325 0.3
326 0.34
327 0.35
328 0.4
329 0.41
330 0.42
331 0.42
332 0.46
333 0.47
334 0.49
335 0.51
336 0.45
337 0.45
338 0.5
339 0.55
340 0.57
341 0.58
342 0.57
343 0.51
344 0.51
345 0.54
346 0.5
347 0.5
348 0.44
349 0.43
350 0.37
351 0.38
352 0.37
353 0.28
354 0.25
355 0.18
356 0.17
357 0.16
358 0.22
359 0.24
360 0.26
361 0.28
362 0.28
363 0.27
364 0.24
365 0.23
366 0.18
367 0.15
368 0.15
369 0.17
370 0.18
371 0.21
372 0.21
373 0.24
374 0.29
375 0.3
376 0.28
377 0.29
378 0.32
379 0.31
380 0.33
381 0.3
382 0.3
383 0.29
384 0.31
385 0.25
386 0.2
387 0.2
388 0.18
389 0.2
390 0.19
391 0.19
392 0.16
393 0.18
394 0.18
395 0.21