Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AAV5

Protein Details
Accession A0A178AAV5    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-90DIEDKDSRRKRDRDDRGHERKRRKLAGEBasic
242-262QAQLKRSKEDKKKWAAERDREBasic
268-295ATQEREDRRSRHHKRKRRDDVVERSSLDBasic
301-363DGSRSAKHKHHDRRESHSGTRDRSDRKSSHRHDRGRDRSRSRERDRDRERHHKHSSSRVYREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-86SRRKRDRDDRGHERKRRK
155-161EKEKRRK
246-285KRSKEDKKKWAAERDRELRELRATQEREDRRSRHHKRKRR
304-357RSAKHKHHDRRESHSGTRDRSDRKSSHRHDRGRDRSRSRERDRDRERHHKHSSS
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 2, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPLHLLGKKSWNVYNAANIARVKADEEAAAAREAADEQRMQEIDAARRAAILRGQTPPPLPDDIEDKDSRRKRDRDDRGHERKRRKLAGEDDTDMDIRLAASASAPSGDKDEDSRVLRLRNTKIDAPLTDHAGNIDLFPVDMKEAIKREKNAEVEKEKRRKERAFEDQYTMRFSNAAGKDGLESPWYAAQQKPTRQPEEEAAALDAGFENKNVWGNEDPRRKEREQARIMSNDPFAFMQQAQAQLKRSKEDKKKWAAERDRELRELRATQEREDRRSRHHKRKRRDDVVERSSLDSERHVDGSRSAKHKHHDRRESHSGTRDRSDRKSSHRHDRGRDRSRSRERDRDRERHHKHSSSRVYREEGYPREAEHGDRRRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.37
4 0.38
5 0.34
6 0.33
7 0.3
8 0.28
9 0.23
10 0.19
11 0.18
12 0.13
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.13
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.11
22 0.12
23 0.11
24 0.12
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.2
29 0.23
30 0.25
31 0.29
32 0.29
33 0.24
34 0.25
35 0.26
36 0.24
37 0.22
38 0.22
39 0.21
40 0.25
41 0.27
42 0.29
43 0.3
44 0.29
45 0.29
46 0.28
47 0.25
48 0.22
49 0.25
50 0.25
51 0.29
52 0.31
53 0.31
54 0.38
55 0.44
56 0.51
57 0.55
58 0.58
59 0.62
60 0.7
61 0.78
62 0.79
63 0.83
64 0.86
65 0.88
66 0.92
67 0.9
68 0.9
69 0.88
70 0.86
71 0.84
72 0.78
73 0.75
74 0.74
75 0.74
76 0.7
77 0.63
78 0.55
79 0.49
80 0.44
81 0.35
82 0.26
83 0.17
84 0.11
85 0.08
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.13
99 0.17
100 0.19
101 0.22
102 0.23
103 0.25
104 0.28
105 0.34
106 0.36
107 0.38
108 0.4
109 0.4
110 0.41
111 0.41
112 0.38
113 0.37
114 0.33
115 0.32
116 0.28
117 0.25
118 0.21
119 0.19
120 0.18
121 0.12
122 0.11
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.08
131 0.12
132 0.17
133 0.21
134 0.23
135 0.26
136 0.3
137 0.35
138 0.36
139 0.4
140 0.43
141 0.47
142 0.55
143 0.6
144 0.61
145 0.64
146 0.68
147 0.66
148 0.65
149 0.66
150 0.67
151 0.67
152 0.64
153 0.61
154 0.56
155 0.52
156 0.5
157 0.41
158 0.3
159 0.21
160 0.19
161 0.22
162 0.19
163 0.2
164 0.15
165 0.15
166 0.16
167 0.17
168 0.17
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.17
177 0.22
178 0.27
179 0.35
180 0.39
181 0.42
182 0.42
183 0.43
184 0.38
185 0.36
186 0.31
187 0.23
188 0.18
189 0.14
190 0.13
191 0.11
192 0.08
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.13
202 0.18
203 0.27
204 0.35
205 0.38
206 0.4
207 0.47
208 0.45
209 0.5
210 0.54
211 0.56
212 0.54
213 0.57
214 0.56
215 0.52
216 0.53
217 0.48
218 0.42
219 0.31
220 0.25
221 0.19
222 0.15
223 0.14
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.17
228 0.17
229 0.2
230 0.24
231 0.26
232 0.28
233 0.3
234 0.34
235 0.38
236 0.47
237 0.54
238 0.6
239 0.66
240 0.73
241 0.77
242 0.82
243 0.81
244 0.8
245 0.8
246 0.78
247 0.72
248 0.67
249 0.61
250 0.53
251 0.48
252 0.42
253 0.36
254 0.36
255 0.34
256 0.34
257 0.42
258 0.44
259 0.46
260 0.52
261 0.51
262 0.52
263 0.61
264 0.68
265 0.7
266 0.76
267 0.8
268 0.83
269 0.91
270 0.93
271 0.92
272 0.92
273 0.91
274 0.91
275 0.88
276 0.83
277 0.73
278 0.64
279 0.55
280 0.46
281 0.37
282 0.28
283 0.24
284 0.2
285 0.21
286 0.2
287 0.19
288 0.22
289 0.28
290 0.33
291 0.35
292 0.38
293 0.41
294 0.48
295 0.58
296 0.64
297 0.68
298 0.72
299 0.73
300 0.77
301 0.82
302 0.8
303 0.76
304 0.75
305 0.71
306 0.65
307 0.66
308 0.65
309 0.61
310 0.61
311 0.63
312 0.61
313 0.63
314 0.69
315 0.71
316 0.74
317 0.78
318 0.8
319 0.82
320 0.86
321 0.88
322 0.87
323 0.89
324 0.86
325 0.87
326 0.89
327 0.9
328 0.88
329 0.88
330 0.86
331 0.87
332 0.89
333 0.89
334 0.87
335 0.88
336 0.87
337 0.86
338 0.87
339 0.85
340 0.82
341 0.82
342 0.84
343 0.82
344 0.82
345 0.78
346 0.73
347 0.68
348 0.68
349 0.66
350 0.59
351 0.54
352 0.48
353 0.44
354 0.43
355 0.41
356 0.39
357 0.41