FuNGI

A0A178ABF0

Protein Details

Accession

A0A178ABF0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
605-625	LWTLETGRRRKRMRGHGKGGI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
612-622	RRRKRMRGHGK

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 6, mito 5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR006594 LisH IPR007582 TFIID_NTD2 IPR037264 TFIID_NTD2_sf IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003743 F:translation initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF08513 LisH PF04494 TFIID_NTD2 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50896 LISH PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd08044 TAF5_NTD2 cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MSGPPNGGGPARAMSVGNGPPSAGLPPHNAMASQQGPPPAGASGPQSQQNLNQIVLEYLSKKGYVRTEAMLRKESEPQANGQTLGSQSNEAGGSKATKAFELLRKYTEDNLDIYKPELRKLLWPVFVYSFLDLVKEYYTKDAENFFAAYQNLFEREHEEDVKTLRQVRLQAHLTESRIAKLYLDNRYRVTLTNMPFFNLMQFLESKLWEGGQALMDVLRDHMNIVTVDRTATAERSLAAILAGGQGDDDLPAEDEGIPGHNPGHPLTTRHDPEADASRIRLTLGPYPQEQELQEDVRAALQDEDAKAAPRPGQPTLVDEFEQRIKREPTDDVPSRDTVPLPPSLARDVSMEVQKIIEHRDRYKMEGRTGGVGPAVSVTMYTFHNTYDSVNCIDFSGDNTLVAAGMAESYIRVWSMDGSPLASPDDAPNTQPSSSRRLIGHSGPVYAVSFSPSTANPDPSGPPTSSQCLLSCSEDKTVRLWSLDTFTCLVAYRGHDNPIWDLQWGPYGHYFLTGSNDRTARLWSTDHIEPLRIYVGHDADVDCVAFHPNNLYVFTGSCDRTVRMWHISGGNCLRLFTGHTGNITAIACSPDGKTLATADDAGNIILWTLETGRRRKRMRGHGKGGIWSLSWSVESSVLVSSGADKTVRVWDVLQETSEKEGNKPATDGALTTKGASGQTVTAKKPAKETGVSADQISVFPTKESPVYKVQFTRMNLVLAGGAYLPQRH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.2
3	0.22
4	0.22
5	0.2
6	0.19
7	0.18
8	0.19
9	0.2
10	0.15
11	0.15
12	0.18
13	0.2
14	0.22
15	0.22
16	0.21
17	0.2
18	0.26
19	0.26
20	0.24
21	0.24
22	0.25
23	0.26
24	0.26
25	0.26
26	0.19
27	0.16
28	0.15
29	0.17
30	0.2
31	0.22
32	0.27
33	0.28
34	0.29
35	0.33
36	0.39
37	0.37
38	0.32
39	0.29
40	0.25
41	0.23
42	0.23
43	0.21
44	0.15
45	0.15
46	0.15
47	0.16
48	0.16
49	0.2
50	0.24
51	0.27
52	0.29
53	0.31
54	0.39
55	0.44
56	0.49
57	0.5
58	0.47
59	0.45
60	0.49
61	0.5
62	0.47
63	0.43
64	0.41
65	0.42
66	0.41
67	0.39
68	0.31
69	0.28
70	0.23
71	0.23
72	0.2
73	0.15
74	0.13
75	0.15
76	0.15
77	0.13
78	0.12
79	0.12
80	0.13
81	0.14
82	0.18
83	0.16
84	0.15
85	0.17
86	0.23
87	0.29
88	0.34
89	0.35
90	0.34
91	0.37
92	0.4
93	0.42
94	0.4
95	0.35
96	0.3
97	0.31
98	0.3
99	0.28
100	0.27
101	0.27
102	0.24
103	0.25
104	0.26
105	0.23
106	0.27
107	0.34
108	0.39
109	0.39
110	0.4
111	0.4
112	0.39
113	0.4
114	0.35
115	0.28
116	0.22
117	0.16
118	0.16
119	0.12
120	0.12
121	0.12
122	0.11
123	0.11
124	0.14
125	0.15
126	0.15
127	0.17
128	0.19
129	0.18
130	0.19
131	0.19
132	0.16
133	0.17
134	0.17
135	0.15
136	0.14
137	0.14
138	0.15
139	0.14
140	0.14
141	0.15
142	0.18
143	0.22
144	0.22
145	0.22
146	0.21
147	0.23
148	0.26
149	0.25
150	0.27
151	0.25
152	0.26
153	0.31
154	0.31
155	0.37
156	0.37
157	0.36
158	0.35
159	0.37
160	0.36
161	0.36
162	0.34
163	0.27
164	0.25
165	0.24
166	0.2
167	0.21
168	0.26
169	0.3
170	0.34
171	0.35
172	0.35
173	0.38
174	0.38
175	0.34
176	0.34
177	0.31
178	0.3
179	0.34
180	0.33
181	0.31
182	0.31
183	0.29
184	0.24
185	0.19
186	0.15
187	0.1
188	0.1
189	0.11
190	0.12
191	0.12
192	0.12
193	0.11
194	0.11
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.09
199	0.09
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.07
204	0.08
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.08
211	0.09
212	0.09
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.1
217	0.09
218	0.1
219	0.09
220	0.09
221	0.09
222	0.1
223	0.09
224	0.08
225	0.07
226	0.06
227	0.05
228	0.06
229	0.05
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.03
237	0.04
238	0.04
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.07
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.13
251	0.13
252	0.15
253	0.19
254	0.27
255	0.28
256	0.28
257	0.28
258	0.25
259	0.27
260	0.31
261	0.29
262	0.21
263	0.2
264	0.19
265	0.18
266	0.19
267	0.18
268	0.13
269	0.16
270	0.18
271	0.2
272	0.2
273	0.22
274	0.22
275	0.22
276	0.2
277	0.18
278	0.17
279	0.16
280	0.16
281	0.14
282	0.14
283	0.12
284	0.12
285	0.09
286	0.07
287	0.07
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.1
295	0.13
296	0.14
297	0.17
298	0.16
299	0.19
300	0.19
301	0.22
302	0.23
303	0.22
304	0.19
305	0.17
306	0.18
307	0.2
308	0.23
309	0.2
310	0.23
311	0.23
312	0.23
313	0.25
314	0.26
315	0.24
316	0.3
317	0.33
318	0.32
319	0.32
320	0.32
321	0.31
322	0.3
323	0.26
324	0.19
325	0.17
326	0.15
327	0.14
328	0.14
329	0.14
330	0.15
331	0.14
332	0.13
333	0.12
334	0.12
335	0.13
336	0.14
337	0.13
338	0.11
339	0.11
340	0.11
341	0.11
342	0.13
343	0.15
344	0.16
345	0.18
346	0.25
347	0.26
348	0.3
349	0.37
350	0.36
351	0.34
352	0.34
353	0.33
354	0.29
355	0.28
356	0.24
357	0.17
358	0.14
359	0.11
360	0.08
361	0.07
362	0.04
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.06
390	0.02
391	0.02
392	0.02
393	0.02
394	0.02
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.05
401	0.06
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.08
406	0.09
407	0.09
408	0.08
409	0.08
410	0.07
411	0.11
412	0.1
413	0.11
414	0.13
415	0.14
416	0.15
417	0.18
418	0.19
419	0.23
420	0.24
421	0.26
422	0.24
423	0.26
424	0.29
425	0.27
426	0.32
427	0.26
428	0.25
429	0.22
430	0.22
431	0.18
432	0.15
433	0.13
434	0.08
435	0.08
436	0.07
437	0.09
438	0.09
439	0.15
440	0.16
441	0.18
442	0.17
443	0.18
444	0.2
445	0.21
446	0.24
447	0.18
448	0.18
449	0.19
450	0.21
451	0.21
452	0.21
453	0.18
454	0.18
455	0.19
456	0.21
457	0.2
458	0.19
459	0.23
460	0.23
461	0.23
462	0.22
463	0.23
464	0.21
465	0.19
466	0.18
467	0.15
468	0.17
469	0.17
470	0.17
471	0.15
472	0.14
473	0.14
474	0.13
475	0.13
476	0.11
477	0.13
478	0.15
479	0.16
480	0.18
481	0.19
482	0.19
483	0.21
484	0.22
485	0.2
486	0.16
487	0.15
488	0.13
489	0.18
490	0.17
491	0.16
492	0.15
493	0.16
494	0.15
495	0.16
496	0.16
497	0.11
498	0.17
499	0.18
500	0.18
501	0.21
502	0.22
503	0.21
504	0.22
505	0.23
506	0.19
507	0.19
508	0.18
509	0.15
510	0.2
511	0.21
512	0.25
513	0.23
514	0.23
515	0.21
516	0.21
517	0.22
518	0.16
519	0.15
520	0.15
521	0.15
522	0.14
523	0.15
524	0.14
525	0.13
526	0.13
527	0.12
528	0.08
529	0.08
530	0.09
531	0.08
532	0.08
533	0.09
534	0.11
535	0.12
536	0.13
537	0.14
538	0.12
539	0.13
540	0.15
541	0.17
542	0.16
543	0.17
544	0.17
545	0.18
546	0.18
547	0.22
548	0.24
549	0.24
550	0.25
551	0.26
552	0.29
553	0.29
554	0.34
555	0.33
556	0.34
557	0.29
558	0.28
559	0.25
560	0.21
561	0.22
562	0.19
563	0.22
564	0.19
565	0.19
566	0.2
567	0.2
568	0.22
569	0.19
570	0.16
571	0.11
572	0.11
573	0.11
574	0.11
575	0.12
576	0.11
577	0.12
578	0.12
579	0.12
580	0.12
581	0.13
582	0.13
583	0.13
584	0.11
585	0.12
586	0.12
587	0.11
588	0.1
589	0.09
590	0.07
591	0.06
592	0.06
593	0.04
594	0.06
595	0.11
596	0.17
597	0.26
598	0.35
599	0.44
600	0.49
601	0.58
602	0.66
603	0.73
604	0.78
605	0.8
606	0.81
607	0.8
608	0.79
609	0.75
610	0.67
611	0.57
612	0.46
613	0.36
614	0.28
615	0.2
616	0.17
617	0.13
618	0.12
619	0.11
620	0.11
621	0.11
622	0.1
623	0.09
624	0.09
625	0.08
626	0.09
627	0.09
628	0.11
629	0.1
630	0.1
631	0.12
632	0.18
633	0.19
634	0.18
635	0.17
636	0.21
637	0.25
638	0.26
639	0.25
640	0.2
641	0.21
642	0.24
643	0.26
644	0.23
645	0.2
646	0.27
647	0.29
648	0.29
649	0.29
650	0.26
651	0.25
652	0.25
653	0.24
654	0.21
655	0.22
656	0.21
657	0.21
658	0.21
659	0.19
660	0.19
661	0.19
662	0.15
663	0.14
664	0.22
665	0.26
666	0.27
667	0.34
668	0.39
669	0.4
670	0.45
671	0.47
672	0.45
673	0.43
674	0.45
675	0.44
676	0.45
677	0.45
678	0.39
679	0.35
680	0.3
681	0.27
682	0.26
683	0.2
684	0.14
685	0.14
686	0.15
687	0.15
688	0.2
689	0.23
690	0.25
691	0.32
692	0.36
693	0.41
694	0.44
695	0.48
696	0.5
697	0.5
698	0.52
699	0.45
700	0.43
701	0.37
702	0.33
703	0.28
704	0.2
705	0.18
706	0.11
707	0.1

A0A178ABF0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer