Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AYK8

Protein Details
Accession A0A178AYK8    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-50HNNLRDNRRGGRKRTITRNQYEGRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9.5, mito_nucl 9, nucl 7.5, cyto 6, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006591  RNAP_P/RPABC4  
IPR039747  RPABC4  
IPR029040  RPABC4/Spt4  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF03604  DNA_RNApol_7kD  
Amino Acid Sequences MPPRTPSLFSTILALLLPPCLRADDDHNNLRDNRRGGRKRTITRNQYEGRIYLRPIMPVATRRRSRLIVEEGGKRVDGGGSMERVDSARVDEGDKGDVLDLDRDKTAGGRVENMGRNRNVREEAEGDIPRLQRAKQRTFSMEMHDALEALHREEEDTEISPDDSVIREEEENSDEDTDSDSSSPALEIDEGTDNSSPSAPSDANPNAKEDKANVEEKEKNDEPPRAVPMPAPAPLRPSVAVTSHTPIQRSDFYYQAPTNAHPSLVPGRDRWAVEYICGKCEHKVLVRQGEPIRCRECGGMFLWKTRTKTMMQFEAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.11
6 0.11
7 0.12
8 0.13
9 0.15
10 0.23
11 0.29
12 0.36
13 0.42
14 0.44
15 0.47
16 0.5
17 0.52
18 0.51
19 0.46
20 0.48
21 0.52
22 0.58
23 0.61
24 0.68
25 0.73
26 0.76
27 0.82
28 0.84
29 0.83
30 0.81
31 0.83
32 0.76
33 0.72
34 0.65
35 0.57
36 0.51
37 0.44
38 0.39
39 0.37
40 0.34
41 0.29
42 0.27
43 0.27
44 0.26
45 0.3
46 0.37
47 0.4
48 0.43
49 0.46
50 0.5
51 0.51
52 0.5
53 0.5
54 0.49
55 0.46
56 0.47
57 0.49
58 0.46
59 0.44
60 0.4
61 0.33
62 0.26
63 0.18
64 0.14
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.1
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.13
97 0.15
98 0.21
99 0.26
100 0.28
101 0.31
102 0.29
103 0.32
104 0.31
105 0.33
106 0.3
107 0.26
108 0.26
109 0.23
110 0.23
111 0.26
112 0.25
113 0.22
114 0.22
115 0.22
116 0.2
117 0.2
118 0.19
119 0.18
120 0.26
121 0.32
122 0.34
123 0.38
124 0.4
125 0.44
126 0.44
127 0.44
128 0.39
129 0.32
130 0.28
131 0.24
132 0.2
133 0.15
134 0.15
135 0.1
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.08
184 0.07
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.14
189 0.18
190 0.23
191 0.24
192 0.26
193 0.26
194 0.27
195 0.27
196 0.22
197 0.24
198 0.23
199 0.27
200 0.25
201 0.29
202 0.33
203 0.34
204 0.41
205 0.36
206 0.37
207 0.38
208 0.4
209 0.37
210 0.36
211 0.41
212 0.34
213 0.33
214 0.29
215 0.28
216 0.27
217 0.28
218 0.27
219 0.22
220 0.24
221 0.25
222 0.26
223 0.22
224 0.22
225 0.2
226 0.19
227 0.21
228 0.2
229 0.22
230 0.25
231 0.26
232 0.25
233 0.24
234 0.26
235 0.28
236 0.3
237 0.29
238 0.26
239 0.27
240 0.32
241 0.32
242 0.31
243 0.29
244 0.26
245 0.29
246 0.27
247 0.25
248 0.19
249 0.22
250 0.26
251 0.28
252 0.29
253 0.24
254 0.29
255 0.33
256 0.34
257 0.32
258 0.31
259 0.27
260 0.28
261 0.35
262 0.31
263 0.3
264 0.32
265 0.31
266 0.27
267 0.3
268 0.32
269 0.31
270 0.37
271 0.43
272 0.49
273 0.5
274 0.56
275 0.59
276 0.62
277 0.59
278 0.58
279 0.54
280 0.45
281 0.45
282 0.41
283 0.36
284 0.3
285 0.3
286 0.33
287 0.31
288 0.36
289 0.41
290 0.43
291 0.45
292 0.46
293 0.47
294 0.42
295 0.48
296 0.51