FuNGI

A0A178AFG6

Protein Details

Accession

A0A178AFG6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1153-1185	TVNTQATRKTSKNKRREERKRARGKKGTVYEEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1160-1178	RKTSKNKRREERKRARGKK

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 6, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006849 Elp1
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0033588 C:elongator holoenzyme complex GO:0005634 C:nucleus GO:0002098 P:tRNA wobble uridine modification
Pfam	View protein in Pfam PF04762 IKI3

Amino Acid Sequences

MRNLKIAGRSLLRFSGEDPLPLTATAWDAASNALICAFGPSESRATIELKRLHYSRDNTQDRLESIAAWDAPCPLPSLTHDSILSLHHFSDSAASCLVLAGGDIILVREQPLQNEELVEIVGSVDAGIVAAAWSPDEELLAIVTLANTLLLMSRDIDNIASIELTAEDVNVSTHVSVGWGKKETQFKGKRARALQDPTVPESIDEGVLSAYDDRSVTISWRGDGAYFAVSKVEEERRRMIRVYSREGQLDSVTEPVDGLEGALSWRPSGNLIASLRRSNENVEVVFFERNGLRHGQFDLRLTTEEMDGIRTSPTLKWNSDSSALSVVFSDRVQLWTMSNYHYYLKQELLLPESTSQTAYCTWHAERPLTLAISTPSALQILDYVSTVAVGSTAPPNDFGMVASIDGLSLKLTPLRLANVPPPMAFQTIPLQQKAIDVAISKSGSRLAVLSNNDLAMYALEMDKRPIPQPVLLWRSDAIKNHCPRHVAFFGDSQVFCLTDNWDDDESSLWKAENDDVTCLGPVIDTDGVSSLVSDVDYQMLCIQSQTGALHSIGTTGGSLDLPPQTSVICNLPSHAPEVKMVTFEDNTLVFGLTKNGILFANGRTLVRNCTSFAITSAHLIFTTTQHLLKFVHLANPDDLEIPLDEPQKDERCRSIERGAKIVTVMPTNFAVVLQMPRGNLETVHPRALVLAAIRRNIEKEQYDVAFLACRNQRVDMNILHDHDPSRFLASIDKIINQIKRIEHIDLLLSQLRNEDVSETMYKETLKMKELETKSKLSTEQIDNKVNRICDAFLTVLEQREYKDEHLQNIITAHVSKVPPALETGLEMIGRLQASQDPLTDKAAEHISFLADVNQLYDTSLGLYNLDLALLIAQQSQKDPREYLPHLQSLQDLPLTRRKYQIDDQLGRRNKALMHLKDLQVFEEVTDYVQKHVLYTEALALYQYDTVHMKQIMQLYADHLRDTNKNKEAAMAYEYLGDHVSAWPCYRSANLWRESLSCATLANSSSDELQALASSLAEGLAEAKDYLGAASITRDYLSDPAAAARLLCRGCYFAEAVRIVTFSKQPELIIEVVDAGLVERSADMTEFLADMKGQLLAQVPRLQELRTKKAEDPMAFYEGMDDGAANIPDNISLAPTDTTSGGTFMTRYTNQTGTVNTQATRKTSKNKRREERKRARGKKGTVYEEEYLTNSIERLIERINSMQDEIERLIEGLMKRGMRERADAVSSAVEGVIEQCRSAINEVYESGSGTIGDAVATNGGPETIEGVNGDMSKPTGGDATLWNSLQEVGKKREPPVVKAFTRLSLLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.35
3	0.3
4	0.29
5	0.27
6	0.25
7	0.24
8	0.23
9	0.22
10	0.14
11	0.15
12	0.13
13	0.12
14	0.1
15	0.09
16	0.1
17	0.11
18	0.1
19	0.08
20	0.08
21	0.08
22	0.07
23	0.09
24	0.09
25	0.08
26	0.1
27	0.13
28	0.15
29	0.16
30	0.17
31	0.17
32	0.21
33	0.24
34	0.31
35	0.35
36	0.36
37	0.43
38	0.43
39	0.47
40	0.52
41	0.54
42	0.55
43	0.59
44	0.61
45	0.56
46	0.6
47	0.58
48	0.51
49	0.5
50	0.41
51	0.3
52	0.26
53	0.28
54	0.24
55	0.2
56	0.19
57	0.18
58	0.18
59	0.18
60	0.19
61	0.14
62	0.15
63	0.19
64	0.27
65	0.25
66	0.28
67	0.27
68	0.26
69	0.27
70	0.27
71	0.27
72	0.19
73	0.18
74	0.15
75	0.15
76	0.14
77	0.2
78	0.19
79	0.17
80	0.16
81	0.16
82	0.15
83	0.15
84	0.14
85	0.07
86	0.06
87	0.05
88	0.04
89	0.04
90	0.04
91	0.05
92	0.05
93	0.06
94	0.07
95	0.12
96	0.13
97	0.15
98	0.18
99	0.18
100	0.19
101	0.19
102	0.18
103	0.13
104	0.13
105	0.1
106	0.08
107	0.06
108	0.05
109	0.04
110	0.04
111	0.03
112	0.03
113	0.03
114	0.03
115	0.03
116	0.03
117	0.03
118	0.03
119	0.04
120	0.04
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.05
125	0.05
126	0.05
127	0.06
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.04
133	0.04
134	0.04
135	0.03
136	0.05
137	0.06
138	0.07
139	0.08
140	0.09
141	0.1
142	0.11
143	0.11
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.08
148	0.07
149	0.06
150	0.06
151	0.07
152	0.06
153	0.06
154	0.05
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.07
163	0.11
164	0.14
165	0.18
166	0.2
167	0.22
168	0.28
169	0.37
170	0.39
171	0.46
172	0.52
173	0.55
174	0.64
175	0.69
176	0.71
177	0.69
178	0.71
179	0.69
180	0.68
181	0.67
182	0.63
183	0.61
184	0.56
185	0.52
186	0.45
187	0.36
188	0.3
189	0.25
190	0.17
191	0.13
192	0.1
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.07
197	0.06
198	0.07
199	0.07
200	0.07
201	0.09
202	0.09
203	0.11
204	0.16
205	0.17
206	0.16
207	0.18
208	0.17
209	0.16
210	0.16
211	0.16
212	0.13
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.16
219	0.24
220	0.26
221	0.3
222	0.37
223	0.41
224	0.44
225	0.45
226	0.46
227	0.46
228	0.48
229	0.52
230	0.51
231	0.5
232	0.48
233	0.48
234	0.43
235	0.35
236	0.29
237	0.22
238	0.17
239	0.14
240	0.11
241	0.1
242	0.09
243	0.08
244	0.07
245	0.06
246	0.04
247	0.04
248	0.05
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.09
255	0.11
256	0.11
257	0.15
258	0.17
259	0.22
260	0.25
261	0.28
262	0.29
263	0.3
264	0.3
265	0.27
266	0.3
267	0.28
268	0.25
269	0.23
270	0.23
271	0.22
272	0.22
273	0.18
274	0.16
275	0.14
276	0.14
277	0.16
278	0.18
279	0.17
280	0.18
281	0.21
282	0.23
283	0.24
284	0.25
285	0.25
286	0.23
287	0.23
288	0.23
289	0.21
290	0.17
291	0.16
292	0.14
293	0.13
294	0.12
295	0.11
296	0.1
297	0.09
298	0.11
299	0.12
300	0.18
301	0.21
302	0.23
303	0.25
304	0.27
305	0.29
306	0.32
307	0.3
308	0.25
309	0.25
310	0.23
311	0.21
312	0.19
313	0.16
314	0.14
315	0.13
316	0.13
317	0.09
318	0.1
319	0.11
320	0.11
321	0.12
322	0.14
323	0.15
324	0.16
325	0.17
326	0.17
327	0.18
328	0.2
329	0.21
330	0.2
331	0.2
332	0.19
333	0.21
334	0.21
335	0.22
336	0.21
337	0.19
338	0.18
339	0.19
340	0.18
341	0.15
342	0.14
343	0.12
344	0.13
345	0.14
346	0.14
347	0.16
348	0.17
349	0.21
350	0.23
351	0.23
352	0.22
353	0.22
354	0.23
355	0.19
356	0.18
357	0.15
358	0.14
359	0.14
360	0.13
361	0.11
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.04
376	0.03
377	0.05
378	0.07
379	0.08
380	0.08
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.09
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.05
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.06
398	0.06
399	0.08
400	0.09
401	0.11
402	0.12
403	0.15
404	0.19
405	0.21
406	0.22
407	0.21
408	0.22
409	0.21
410	0.21
411	0.19
412	0.16
413	0.17
414	0.23
415	0.25
416	0.23
417	0.22
418	0.2
419	0.21
420	0.2
421	0.16
422	0.1
423	0.09
424	0.09
425	0.12
426	0.13
427	0.12
428	0.11
429	0.12
430	0.11
431	0.11
432	0.11
433	0.09
434	0.13
435	0.15
436	0.16
437	0.15
438	0.15
439	0.15
440	0.14
441	0.13
442	0.08
443	0.06
444	0.05
445	0.05
446	0.06
447	0.06
448	0.08
449	0.1
450	0.11
451	0.12
452	0.14
453	0.15
454	0.16
455	0.19
456	0.27
457	0.29
458	0.28
459	0.28
460	0.26
461	0.28
462	0.29
463	0.31
464	0.29
465	0.33
466	0.39
467	0.42
468	0.44
469	0.42
470	0.4
471	0.43
472	0.38
473	0.33
474	0.28
475	0.26
476	0.26
477	0.26
478	0.25
479	0.19
480	0.17
481	0.14
482	0.13
483	0.12
484	0.11
485	0.1
486	0.11
487	0.12
488	0.12
489	0.12
490	0.12
491	0.13
492	0.13
493	0.12
494	0.11
495	0.09
496	0.08
497	0.09
498	0.11
499	0.13
500	0.13
501	0.13
502	0.13
503	0.14
504	0.13
505	0.12
506	0.1
507	0.06
508	0.05
509	0.07
510	0.06
511	0.05
512	0.06
513	0.06
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.05
518	0.04
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.06
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.05
531	0.07
532	0.06
533	0.06
534	0.07
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.06
540	0.06
541	0.05
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.05
547	0.06
548	0.06
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.09
557	0.11
558	0.12
559	0.12
560	0.15
561	0.14
562	0.13
563	0.12
564	0.15
565	0.14
566	0.14
567	0.13
568	0.12
569	0.11
570	0.11
571	0.11
572	0.09
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.06
577	0.06
578	0.07
579	0.06
580	0.07
581	0.06
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.08
586	0.08
587	0.1
588	0.1
589	0.11
590	0.11
591	0.12
592	0.14
593	0.15
594	0.15
595	0.13
596	0.14
597	0.15
598	0.13
599	0.14
600	0.13
601	0.12
602	0.12
603	0.12
604	0.1
605	0.09
606	0.1
607	0.08
608	0.07
609	0.1
610	0.1
611	0.1
612	0.1
613	0.12
614	0.12
615	0.12
616	0.14
617	0.11
618	0.15
619	0.15
620	0.17
621	0.16
622	0.16
623	0.16
624	0.14
625	0.13
626	0.09
627	0.08
628	0.07
629	0.09
630	0.1
631	0.1
632	0.1
633	0.14
634	0.19
635	0.21
636	0.22
637	0.22
638	0.25
639	0.27
640	0.3
641	0.34
642	0.33
643	0.33
644	0.35
645	0.33
646	0.28
647	0.26
648	0.24
649	0.18
650	0.14
651	0.13
652	0.1
653	0.09
654	0.09
655	0.09
656	0.07
657	0.06
658	0.05
659	0.06
660	0.06
661	0.07
662	0.07
663	0.07
664	0.09
665	0.08
666	0.08
667	0.09
668	0.15
669	0.16
670	0.17
671	0.16
672	0.15
673	0.15
674	0.15
675	0.14
676	0.08
677	0.11
678	0.11
679	0.12
680	0.13
681	0.13
682	0.15
683	0.15
684	0.18
685	0.14
686	0.15
687	0.17
688	0.16
689	0.17
690	0.15
691	0.14
692	0.12
693	0.12
694	0.15
695	0.14
696	0.15
697	0.15
698	0.16
699	0.17
700	0.17
701	0.21
702	0.17
703	0.21
704	0.21
705	0.22
706	0.22
707	0.22
708	0.2
709	0.18
710	0.17
711	0.13
712	0.12
713	0.11
714	0.1
715	0.13
716	0.13
717	0.17
718	0.16
719	0.16
720	0.17
721	0.2
722	0.21
723	0.19
724	0.22
725	0.18
726	0.2
727	0.22
728	0.21
729	0.18
730	0.17
731	0.16
732	0.13
733	0.15
734	0.15
735	0.12
736	0.11
737	0.11
738	0.11
739	0.1
740	0.1
741	0.08
742	0.06
743	0.08
744	0.09
745	0.1
746	0.1
747	0.11
748	0.11
749	0.12
750	0.16
751	0.15
752	0.17
753	0.17
754	0.18
755	0.26
756	0.29
757	0.35
758	0.34
759	0.35
760	0.33
761	0.34
762	0.33
763	0.26
764	0.29
765	0.28
766	0.33
767	0.35
768	0.41
769	0.4
770	0.42
771	0.43
772	0.37
773	0.32
774	0.24
775	0.2
776	0.13
777	0.15
778	0.12
779	0.1
780	0.12
781	0.13
782	0.13
783	0.13
784	0.13
785	0.11
786	0.13
787	0.15
788	0.15
789	0.22
790	0.23
791	0.24
792	0.26
793	0.26
794	0.24
795	0.23
796	0.21
797	0.13
798	0.11
799	0.1
800	0.11
801	0.11
802	0.11
803	0.12
804	0.12
805	0.12
806	0.12
807	0.13
808	0.09
809	0.09
810	0.1
811	0.09
812	0.08
813	0.08
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.07
818	0.06
819	0.07
820	0.09
821	0.1
822	0.11
823	0.12
824	0.13
825	0.15
826	0.15
827	0.13
828	0.13
829	0.16
830	0.15
831	0.14
832	0.13
833	0.11
834	0.11
835	0.11
836	0.11
837	0.08
838	0.08
839	0.08
840	0.08
841	0.08
842	0.07
843	0.07
844	0.06
845	0.07
846	0.07
847	0.06
848	0.06
849	0.06
850	0.06
851	0.06
852	0.06
853	0.04
854	0.03
855	0.04
856	0.03
857	0.04
858	0.05
859	0.06
860	0.06
861	0.08
862	0.14
863	0.16
864	0.19
865	0.2
866	0.22
867	0.29
868	0.32
869	0.38
870	0.37
871	0.38
872	0.37
873	0.36
874	0.34
875	0.28
876	0.25
877	0.2
878	0.17
879	0.16
880	0.23
881	0.26
882	0.27
883	0.31
884	0.32
885	0.36
886	0.41
887	0.47
888	0.49
889	0.52
890	0.56
891	0.6
892	0.64
893	0.59
894	0.53
895	0.45
896	0.36
897	0.38
898	0.42
899	0.34
900	0.36
901	0.4
902	0.41
903	0.44
904	0.44
905	0.36
906	0.28
907	0.25
908	0.18
909	0.14
910	0.13
911	0.08
912	0.12
913	0.11
914	0.11
915	0.13
916	0.13
917	0.12
918	0.12
919	0.13
920	0.1
921	0.1
922	0.12
923	0.09
924	0.09
925	0.09
926	0.09
927	0.09
928	0.09
929	0.09
930	0.08
931	0.09
932	0.1
933	0.14
934	0.14
935	0.14
936	0.15
937	0.2
938	0.19
939	0.18
940	0.18
941	0.18
942	0.24
943	0.24
944	0.21
945	0.18
946	0.2
947	0.25
948	0.31
949	0.36
950	0.34
951	0.36
952	0.35
953	0.38
954	0.36
955	0.32
956	0.29
957	0.22
958	0.18
959	0.18
960	0.18
961	0.15
962	0.14
963	0.12
964	0.09
965	0.11
966	0.12
967	0.1
968	0.12
969	0.12
970	0.12
971	0.13
972	0.13
973	0.15
974	0.22
975	0.29
976	0.31
977	0.33
978	0.34
979	0.34
980	0.36
981	0.34
982	0.26
983	0.18
984	0.15
985	0.14
986	0.14
987	0.14
988	0.12
989	0.11
990	0.11
991	0.12
992	0.11
993	0.1
994	0.09
995	0.08
996	0.07
997	0.07
998	0.06
999	0.05
1000	0.05
1001	0.05
1002	0.04
1003	0.04
1004	0.04
1005	0.04
1006	0.04
1007	0.05
1008	0.05
1009	0.05
1010	0.05
1011	0.05
1012	0.05
1013	0.05
1014	0.05
1015	0.05
1016	0.07
1017	0.08
1018	0.08
1019	0.08
1020	0.08
1021	0.08
1022	0.1
1023	0.11
1024	0.1
1025	0.09
1026	0.1
1027	0.11
1028	0.1
1029	0.09
1030	0.09
1031	0.13
1032	0.12
1033	0.13
1034	0.13
1035	0.13
1036	0.14
1037	0.16
1038	0.17
1039	0.13
1040	0.19
1041	0.19
1042	0.19
1043	0.18
1044	0.18
1045	0.17
1046	0.18
1047	0.19
1048	0.16
1049	0.18
1050	0.18
1051	0.17
1052	0.18
1053	0.2
1054	0.18
1055	0.16
1056	0.14
1057	0.11
1058	0.1
1059	0.09
1060	0.08
1061	0.05
1062	0.05
1063	0.04
1064	0.04
1065	0.04
1066	0.04
1067	0.05
1068	0.05
1069	0.06
1070	0.06
1071	0.07
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.07
1076	0.07
1077	0.07
1078	0.07
1079	0.06
1080	0.07
1081	0.11
1082	0.12
1083	0.16
1084	0.2
1085	0.2
1086	0.23
1087	0.24
1088	0.24
1089	0.26
1090	0.33
1091	0.37
1092	0.39
1093	0.44
1094	0.43
1095	0.49
1096	0.56
1097	0.51
1098	0.5
1099	0.45
1100	0.43
1101	0.38
1102	0.35
1103	0.29
1104	0.21
1105	0.2
1106	0.13
1107	0.09
1108	0.06
1109	0.09
1110	0.09
1111	0.08
1112	0.08
1113	0.08
1114	0.08
1115	0.09
1116	0.07
1117	0.06
1118	0.06
1119	0.07
1120	0.08
1121	0.08
1122	0.1
1123	0.1
1124	0.11
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.1
1128	0.1
1129	0.1
1130	0.1
1131	0.15
1132	0.15
1133	0.19
1134	0.23
1135	0.24
1136	0.25
1137	0.27
1138	0.29
1139	0.28
1140	0.32
1141	0.31
1142	0.28
1143	0.31
1144	0.31
1145	0.34
1146	0.38
1147	0.39
1148	0.44
1149	0.52
1150	0.62
1151	0.68
1152	0.76
1153	0.82
1154	0.87
1155	0.93
1156	0.94
1157	0.94
1158	0.95
1159	0.96
1160	0.95
1161	0.95
1162	0.93
1163	0.9
1164	0.89
1165	0.87
1166	0.83
1167	0.77
1168	0.73
1169	0.65
1170	0.57
1171	0.5
1172	0.41
1173	0.33
1174	0.26
1175	0.21
1176	0.15
1177	0.13
1178	0.13
1179	0.12
1180	0.13
1181	0.14
1182	0.15
1183	0.18
1184	0.21
1185	0.23
1186	0.23
1187	0.23
1188	0.22
1189	0.21
1190	0.22
1191	0.21
1192	0.19
1193	0.16
1194	0.14
1195	0.14
1196	0.16
1197	0.15
1198	0.16
1199	0.2
1200	0.19
1201	0.21
1202	0.27
1203	0.33
1204	0.31
1205	0.35
1206	0.34
1207	0.35
1208	0.36
1209	0.36
1210	0.31
1211	0.26
1212	0.23
1213	0.19
1214	0.15
1215	0.1
1216	0.08
1217	0.09
1218	0.12
1219	0.11
1220	0.11
1221	0.11
1222	0.12
1223	0.14
1224	0.17
1225	0.19
1226	0.16
1227	0.18
1228	0.19
1229	0.22
1230	0.21
1231	0.2
1232	0.18
1233	0.14
1234	0.12
1235	0.1
1236	0.1
1237	0.07
1238	0.07
1239	0.06
1240	0.06
1241	0.07
1242	0.07
1243	0.06
1244	0.06
1245	0.06
1246	0.06
1247	0.06
1248	0.09
1249	0.08
1250	0.09
1251	0.09
1252	0.1
1253	0.12
1254	0.12
1255	0.13
1256	0.1
1257	0.11
1258	0.11
1259	0.11
1260	0.11
1261	0.1
1262	0.1
1263	0.11
1264	0.14
1265	0.18
1266	0.22
1267	0.22
1268	0.21
1269	0.2
1270	0.22
1271	0.25
1272	0.28
1273	0.31
1274	0.34
1275	0.41
1276	0.46
1277	0.48
1278	0.55
1279	0.55
1280	0.56
1281	0.58
1282	0.61
1283	0.55
1284	0.57
1285	0.57
1286	0.51

A0A178AFG6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer