FuNGI

A0A178B864

Protein Details

Accession

A0A178B864

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
434-455	SKVPSKEKRAGRAQGRHSRERL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
440-445	EKRAGR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1 IPR001005 SANT/Myb
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50090 MYB_LIKE

Amino Acid Sequences

MVGPGVNLATTKDGGTYNKLQRPADYLSLQTNALPKDAPTVDDMLSTSASKRKRGNEDTITNQKRSRVDPNRADGTRSRTGARDVGKLRNVDGGMRALLPGLDDDGFSSDEGSTSEALAYLRNVRSEALAIPDLLVARTTSSHDHENNSHQVLFREGTYIAVDDYDTEAASGQGSSELPSLPGPQERQAELLLKRFHALRATLAAATNNRDLPSTQETSALARSLRRRREWSNIINQQFPKLDLVLQLDNAAVYHGLESCAENIERTTSISAYVSCWVWTLLALVGDVGTLDNDRVDCIRSLGRMAHVLSARLRQDNCSTQTNVEGDSPRDGSLLVQAEGDLEEGEERELDDTGEVQATCDGPKDEPIQADADRIEKTPIENGLTDPTSDAEMAISEEEDLSEHGEPVSELEKARARLLSQLGDRLVQPQVSASKVPSKEKRAGRAQGRHSRERLQWSSEECDHLADYGVDLNTRSTIDMIWTIMAEHFGQRDFLEFRKRW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.24
3	0.32
4	0.39
5	0.44
6	0.5
7	0.49
8	0.48
9	0.5
10	0.49
11	0.47
12	0.39
13	0.36
14	0.34
15	0.35
16	0.33
17	0.3
18	0.3
19	0.24
20	0.23
21	0.21
22	0.17
23	0.23
24	0.23
25	0.22
26	0.19
27	0.21
28	0.2
29	0.21
30	0.21
31	0.15
32	0.16
33	0.15
34	0.16
35	0.19
36	0.22
37	0.28
38	0.34
39	0.41
40	0.51
41	0.57
42	0.64
43	0.68
44	0.72
45	0.74
46	0.78
47	0.75
48	0.69
49	0.64
50	0.6
51	0.55
52	0.53
53	0.55
54	0.54
55	0.59
56	0.63
57	0.68
58	0.72
59	0.68
60	0.67
61	0.61
62	0.59
63	0.55
64	0.49
65	0.43
66	0.36
67	0.39
68	0.41
69	0.39
70	0.4
71	0.37
72	0.43
73	0.46
74	0.44
75	0.42
76	0.41
77	0.38
78	0.31
79	0.28
80	0.22
81	0.18
82	0.18
83	0.16
84	0.11
85	0.11
86	0.1
87	0.08
88	0.07
89	0.07
90	0.06
91	0.07
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.09
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.09
100	0.08
101	0.07
102	0.07
103	0.07
104	0.07
105	0.08
106	0.09
107	0.14
108	0.15
109	0.15
110	0.16
111	0.15
112	0.16
113	0.17
114	0.16
115	0.14
116	0.13
117	0.13
118	0.12
119	0.13
120	0.12
121	0.11
122	0.1
123	0.06
124	0.06
125	0.07
126	0.09
127	0.11
128	0.14
129	0.2
130	0.21
131	0.25
132	0.28
133	0.32
134	0.35
135	0.34
136	0.33
137	0.28
138	0.26
139	0.25
140	0.23
141	0.17
142	0.15
143	0.12
144	0.12
145	0.12
146	0.11
147	0.08
148	0.08
149	0.07
150	0.06
151	0.07
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.05
159	0.04
160	0.05
161	0.05
162	0.06
163	0.06
164	0.07
165	0.07
166	0.08
167	0.09
168	0.1
169	0.13
170	0.13
171	0.18
172	0.2
173	0.2
174	0.21
175	0.21
176	0.25
177	0.24
178	0.28
179	0.25
180	0.23
181	0.23
182	0.22
183	0.22
184	0.19
185	0.18
186	0.13
187	0.14
188	0.15
189	0.14
190	0.14
191	0.15
192	0.13
193	0.15
194	0.15
195	0.14
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.16
200	0.2
201	0.2
202	0.18
203	0.18
204	0.19
205	0.2
206	0.2
207	0.17
208	0.12
209	0.14
210	0.22
211	0.28
212	0.35
213	0.38
214	0.43
215	0.47
216	0.55
217	0.59
218	0.58
219	0.6
220	0.61
221	0.59
222	0.58
223	0.54
224	0.47
225	0.4
226	0.34
227	0.24
228	0.17
229	0.15
230	0.11
231	0.14
232	0.11
233	0.11
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.08
238	0.06
239	0.04
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.04
244	0.04
245	0.05
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.08
255	0.07
256	0.07
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.06
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.04
281	0.04
282	0.05
283	0.06
284	0.06
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.11
289	0.11
290	0.12
291	0.13
292	0.14
293	0.16
294	0.15
295	0.17
296	0.17
297	0.2
298	0.21
299	0.23
300	0.23
301	0.21
302	0.25
303	0.3
304	0.32
305	0.32
306	0.31
307	0.28
308	0.3
309	0.29
310	0.25
311	0.22
312	0.2
313	0.17
314	0.18
315	0.18
316	0.15
317	0.14
318	0.13
319	0.1
320	0.13
321	0.14
322	0.12
323	0.11
324	0.1
325	0.11
326	0.11
327	0.11
328	0.06
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.05
333	0.04
334	0.04
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.1
348	0.1
349	0.09
350	0.13
351	0.15
352	0.17
353	0.17
354	0.18
355	0.2
356	0.19
357	0.2
358	0.17
359	0.17
360	0.16
361	0.16
362	0.16
363	0.13
364	0.14
365	0.16
366	0.17
367	0.17
368	0.17
369	0.17
370	0.2
371	0.2
372	0.19
373	0.16
374	0.15
375	0.13
376	0.13
377	0.12
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.14
399	0.19
400	0.2
401	0.23
402	0.22
403	0.21
404	0.26
405	0.29
406	0.31
407	0.28
408	0.31
409	0.29
410	0.29
411	0.28
412	0.25
413	0.24
414	0.18
415	0.17
416	0.16
417	0.17
418	0.19
419	0.2
420	0.2
421	0.26
422	0.3
423	0.39
424	0.44
425	0.49
426	0.55
427	0.61
428	0.67
429	0.68
430	0.73
431	0.74
432	0.76
433	0.79
434	0.8
435	0.81
436	0.81
437	0.76
438	0.74
439	0.7
440	0.71
441	0.65
442	0.61
443	0.58
444	0.54
445	0.57
446	0.52
447	0.49
448	0.4
449	0.36
450	0.31
451	0.26
452	0.23
453	0.16
454	0.13
455	0.13
456	0.13
457	0.12
458	0.12
459	0.13
460	0.13
461	0.13
462	0.13
463	0.1
464	0.1
465	0.12
466	0.13
467	0.13
468	0.12
469	0.12
470	0.12
471	0.12
472	0.13
473	0.12
474	0.12
475	0.13
476	0.13
477	0.15
478	0.14
479	0.18
480	0.19
481	0.24

A0A178B864

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer