Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B2U3

Protein Details
Accession A0A178B2U3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-298KVAPTDRLSKRKKAERIQPLHNNRGRIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
281-284KRKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011709  DEAD-box_helicase_OB_fold  
IPR007502  Helicase-assoc_dom  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0004386  F:helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04408  HA2  
PF07717  OB_NTP_bind  
Amino Acid Sequences MLPTTIPEIQRQNLSNTILMLKAMGINDLLHFDFMDPPPTNTMLTALEELYQLGALDDEGLLTRQGRQMADFPMDPTLSKSLIKSVDLQCSDEILTIVAMISATQSVFHRPRDKQQQADQKKQKFNDPSGDHITLLNVYNGWKQGGFSVPWCHENFVMPRNMQRVRDVRNQLLQIMARHKHSVVSCGRNTIKVRQALCSGFFRNSARKDPAEGYKTLVEGTPVYLHPSSSLFGKPAEHVVYHSLVETTKEYMHVCSAIEPKWLVEAAPTFFKVAPTDRLSKRKKAERIQPLHNNRGRITPNKPYESPSGRRIFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.36
3 0.32
4 0.3
5 0.24
6 0.22
7 0.17
8 0.13
9 0.12
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.12
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.15
21 0.15
22 0.22
23 0.2
24 0.21
25 0.24
26 0.26
27 0.25
28 0.2
29 0.22
30 0.16
31 0.17
32 0.16
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.1
38 0.09
39 0.07
40 0.05
41 0.05
42 0.04
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.05
48 0.06
49 0.06
50 0.08
51 0.11
52 0.14
53 0.14
54 0.15
55 0.18
56 0.21
57 0.24
58 0.22
59 0.21
60 0.21
61 0.21
62 0.19
63 0.18
64 0.17
65 0.15
66 0.16
67 0.15
68 0.17
69 0.19
70 0.2
71 0.24
72 0.25
73 0.31
74 0.32
75 0.33
76 0.28
77 0.27
78 0.27
79 0.2
80 0.16
81 0.09
82 0.08
83 0.06
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.05
92 0.05
93 0.12
94 0.15
95 0.2
96 0.27
97 0.29
98 0.39
99 0.49
100 0.54
101 0.54
102 0.6
103 0.66
104 0.67
105 0.76
106 0.76
107 0.73
108 0.74
109 0.7
110 0.69
111 0.64
112 0.59
113 0.58
114 0.51
115 0.49
116 0.48
117 0.47
118 0.39
119 0.33
120 0.3
121 0.21
122 0.19
123 0.13
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.14
136 0.14
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.16
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.2
145 0.17
146 0.19
147 0.23
148 0.26
149 0.24
150 0.28
151 0.29
152 0.32
153 0.4
154 0.42
155 0.39
156 0.41
157 0.41
158 0.35
159 0.32
160 0.28
161 0.22
162 0.23
163 0.23
164 0.2
165 0.21
166 0.2
167 0.22
168 0.21
169 0.25
170 0.25
171 0.3
172 0.29
173 0.34
174 0.34
175 0.36
176 0.38
177 0.38
178 0.38
179 0.37
180 0.37
181 0.33
182 0.37
183 0.32
184 0.33
185 0.31
186 0.27
187 0.22
188 0.24
189 0.25
190 0.28
191 0.3
192 0.33
193 0.34
194 0.33
195 0.35
196 0.36
197 0.41
198 0.38
199 0.35
200 0.32
201 0.29
202 0.28
203 0.25
204 0.21
205 0.14
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.11
219 0.12
220 0.14
221 0.14
222 0.16
223 0.17
224 0.15
225 0.16
226 0.18
227 0.18
228 0.17
229 0.17
230 0.13
231 0.12
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.16
240 0.15
241 0.13
242 0.16
243 0.19
244 0.18
245 0.2
246 0.19
247 0.18
248 0.19
249 0.19
250 0.14
251 0.13
252 0.15
253 0.15
254 0.18
255 0.19
256 0.18
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.21
261 0.25
262 0.27
263 0.35
264 0.41
265 0.51
266 0.56
267 0.63
268 0.69
269 0.72
270 0.77
271 0.78
272 0.81
273 0.82
274 0.83
275 0.85
276 0.86
277 0.85
278 0.86
279 0.8
280 0.74
281 0.65
282 0.65
283 0.61
284 0.57
285 0.56
286 0.56
287 0.6
288 0.63
289 0.63
290 0.59
291 0.63
292 0.64
293 0.63
294 0.61