Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178APN5

Protein Details
Accession A0A178APN5    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MSRKKAKAKGKTKGSAKSTPQRPSKRPSTQSWHydrophilic
511-532SAPGRSNKTRKARIRGNRNTTFHydrophilic
552-577IMDTERPSLKPKKKGRRGQMPPELDDHydrophilic
589-609EADRAKKRLKKAEREELRQQGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-26RKKAKAKGKTKGSAKSTPQRPSKR
560-568LKPKKKGRR
592-617RAKKRLKKAEREELRQQGLLGRKGKG
710-735KRLNGPLQGKKGVKPARGSTFRSGPR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034082  R3H_G-patch  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF01424  R3H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS51061  R3H  
CDD cd02646  R3H_G-patch  
Amino Acid Sequences MSRKKAKAKGKTKGSAKSTPQRPSKRPSTQSWLAEPDTGPSFSLRDEARWHSSHRSAAFDSGKKLRHLPIQFVSAGHLEGTIKEQLPLPESAESESEDNSPAPSSLSSTQDNTDAMAHMAIRSPSPAASDASSSSDEVVFQGRGQPPAAPATSANIQGLSIAGDSMPPRLSVTLTAPAVLPIITSAATKRQEDPPRAPASTSTAPSDRALKSQPRPKASTEINAVITTNNEDSEDEGSDADHSIAQQLAKRRGDKPAWEGTTTPWEHRSKPNIGWLPTTSRPNMEDYLRGEVKPQDAALNDYMQNIRESGLVDDMLGAGAFPLREMDLDAGSHNDWESASGSQRDEDDAQAEALDNDSNEDSWDSDMLQDFDDISTSSDVMDSVVRILRKRTRKSGLHYLCVYECSVIDDAHWLPATFLRSKAEKQLIHAFEEEADLRQAALETSESSDEDNYDEDDSEEDEDEGYNKDELDDEALARVLQKQEELGLGSEEMVLYGADDYFRNTADFAFSAPGRSNKTRKARIRGNRNTTFPSASAMVDALAMDPYGGFDIMDTERPSLKPKKKGRRGQMPPELDDSDLNEQLQNAWEADRAKKRLKKAEREELRQQGLLGRKGKGANLKVKYSGGIGMEDVVEEIREFLLGQTQSLSLPPMDAQRRATIHQAAKSFDLSSRSRGDGHDRFTILSKTTRTRVYTDAEFDQAIARKGLLKRLNGPLQGKKGVKPARGSTFRSGPRARPQVGYRDGEKVGANAPELGPENKGHALMMRMGWSKGQALGTADNQGILHPIAHTVKINKAGLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.82
3 0.81
4 0.81
5 0.79
6 0.79
7 0.81
8 0.82
9 0.82
10 0.82
11 0.83
12 0.83
13 0.81
14 0.8
15 0.79
16 0.78
17 0.76
18 0.73
19 0.68
20 0.59
21 0.55
22 0.47
23 0.41
24 0.36
25 0.3
26 0.25
27 0.2
28 0.19
29 0.16
30 0.21
31 0.18
32 0.18
33 0.23
34 0.29
35 0.34
36 0.36
37 0.4
38 0.42
39 0.47
40 0.5
41 0.47
42 0.46
43 0.42
44 0.47
45 0.5
46 0.46
47 0.47
48 0.48
49 0.5
50 0.47
51 0.49
52 0.47
53 0.48
54 0.48
55 0.5
56 0.47
57 0.47
58 0.46
59 0.41
60 0.39
61 0.3
62 0.27
63 0.19
64 0.16
65 0.11
66 0.11
67 0.14
68 0.15
69 0.15
70 0.15
71 0.18
72 0.19
73 0.22
74 0.22
75 0.22
76 0.2
77 0.21
78 0.21
79 0.19
80 0.19
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.14
92 0.16
93 0.2
94 0.22
95 0.23
96 0.24
97 0.25
98 0.25
99 0.22
100 0.19
101 0.16
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.09
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.15
118 0.18
119 0.19
120 0.17
121 0.16
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.14
126 0.11
127 0.1
128 0.17
129 0.18
130 0.2
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.24
135 0.24
136 0.18
137 0.16
138 0.18
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.15
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.09
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.15
160 0.18
161 0.18
162 0.18
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.14
167 0.11
168 0.05
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.13
174 0.17
175 0.19
176 0.22
177 0.3
178 0.38
179 0.44
180 0.49
181 0.51
182 0.53
183 0.52
184 0.5
185 0.42
186 0.41
187 0.39
188 0.35
189 0.31
190 0.26
191 0.27
192 0.28
193 0.32
194 0.26
195 0.25
196 0.29
197 0.33
198 0.41
199 0.47
200 0.53
201 0.53
202 0.56
203 0.56
204 0.58
205 0.53
206 0.51
207 0.48
208 0.44
209 0.39
210 0.36
211 0.33
212 0.25
213 0.22
214 0.18
215 0.14
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.11
234 0.17
235 0.25
236 0.29
237 0.33
238 0.34
239 0.41
240 0.44
241 0.46
242 0.45
243 0.47
244 0.45
245 0.42
246 0.41
247 0.35
248 0.4
249 0.36
250 0.32
251 0.3
252 0.3
253 0.33
254 0.39
255 0.43
256 0.4
257 0.41
258 0.48
259 0.47
260 0.46
261 0.45
262 0.4
263 0.4
264 0.39
265 0.4
266 0.32
267 0.28
268 0.27
269 0.28
270 0.29
271 0.23
272 0.23
273 0.21
274 0.27
275 0.27
276 0.25
277 0.24
278 0.23
279 0.23
280 0.2
281 0.18
282 0.13
283 0.13
284 0.16
285 0.15
286 0.15
287 0.14
288 0.15
289 0.15
290 0.14
291 0.14
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.04
304 0.03
305 0.02
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.05
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.13
375 0.2
376 0.29
377 0.33
378 0.4
379 0.47
380 0.51
381 0.57
382 0.64
383 0.61
384 0.57
385 0.53
386 0.47
387 0.39
388 0.35
389 0.28
390 0.17
391 0.13
392 0.1
393 0.1
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.08
401 0.07
402 0.09
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.13
407 0.15
408 0.16
409 0.22
410 0.26
411 0.24
412 0.27
413 0.35
414 0.34
415 0.34
416 0.33
417 0.27
418 0.21
419 0.21
420 0.18
421 0.09
422 0.08
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.08
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.09
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.04
486 0.04
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.11
500 0.15
501 0.19
502 0.25
503 0.29
504 0.36
505 0.46
506 0.54
507 0.61
508 0.67
509 0.71
510 0.75
511 0.81
512 0.83
513 0.83
514 0.79
515 0.75
516 0.7
517 0.63
518 0.55
519 0.44
520 0.36
521 0.28
522 0.21
523 0.18
524 0.13
525 0.1
526 0.09
527 0.08
528 0.06
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.03
533 0.03
534 0.04
535 0.04
536 0.03
537 0.03
538 0.06
539 0.07
540 0.1
541 0.11
542 0.12
543 0.14
544 0.15
545 0.22
546 0.29
547 0.36
548 0.44
549 0.53
550 0.63
551 0.72
552 0.81
553 0.85
554 0.86
555 0.88
556 0.88
557 0.88
558 0.81
559 0.73
560 0.69
561 0.59
562 0.49
563 0.39
564 0.32
565 0.26
566 0.22
567 0.19
568 0.15
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.12
573 0.09
574 0.08
575 0.11
576 0.13
577 0.2
578 0.27
579 0.31
580 0.39
581 0.44
582 0.52
583 0.59
584 0.67
585 0.71
586 0.73
587 0.79
588 0.79
589 0.82
590 0.83
591 0.8
592 0.73
593 0.63
594 0.53
595 0.47
596 0.45
597 0.44
598 0.38
599 0.32
600 0.33
601 0.33
602 0.36
603 0.39
604 0.4
605 0.42
606 0.43
607 0.45
608 0.43
609 0.43
610 0.4
611 0.33
612 0.29
613 0.21
614 0.17
615 0.14
616 0.12
617 0.11
618 0.1
619 0.09
620 0.06
621 0.06
622 0.05
623 0.05
624 0.04
625 0.04
626 0.05
627 0.05
628 0.11
629 0.11
630 0.11
631 0.12
632 0.12
633 0.13
634 0.13
635 0.14
636 0.08
637 0.09
638 0.1
639 0.17
640 0.2
641 0.23
642 0.25
643 0.29
644 0.32
645 0.33
646 0.38
647 0.38
648 0.39
649 0.41
650 0.42
651 0.38
652 0.37
653 0.37
654 0.32
655 0.27
656 0.28
657 0.24
658 0.26
659 0.28
660 0.28
661 0.28
662 0.3
663 0.36
664 0.36
665 0.39
666 0.4
667 0.37
668 0.36
669 0.38
670 0.38
671 0.31
672 0.31
673 0.31
674 0.31
675 0.35
676 0.4
677 0.39
678 0.41
679 0.42
680 0.43
681 0.42
682 0.41
683 0.39
684 0.35
685 0.32
686 0.29
687 0.29
688 0.26
689 0.23
690 0.19
691 0.16
692 0.21
693 0.23
694 0.31
695 0.32
696 0.34
697 0.4
698 0.48
699 0.55
700 0.55
701 0.59
702 0.58
703 0.6
704 0.64
705 0.59
706 0.54
707 0.57
708 0.58
709 0.57
710 0.56
711 0.57
712 0.59
713 0.64
714 0.66
715 0.63
716 0.65
717 0.65
718 0.67
719 0.64
720 0.61
721 0.65
722 0.68
723 0.64
724 0.61
725 0.6
726 0.61
727 0.64
728 0.61
729 0.53
730 0.5
731 0.48
732 0.43
733 0.39
734 0.31
735 0.27
736 0.24
737 0.22
738 0.19
739 0.18
740 0.19
741 0.21
742 0.21
743 0.19
744 0.18
745 0.22
746 0.21
747 0.22
748 0.18
749 0.18
750 0.19
751 0.2
752 0.21
753 0.22
754 0.23
755 0.23
756 0.24
757 0.24
758 0.23
759 0.23
760 0.22
761 0.19
762 0.2
763 0.23
764 0.23
765 0.25
766 0.23
767 0.21
768 0.2
769 0.18
770 0.17
771 0.14
772 0.13
773 0.1
774 0.15
775 0.16
776 0.18
777 0.22
778 0.23
779 0.29
780 0.36