FuNGI

A0A178AMH5

Protein Details

Accession

A0A178AMH5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
490-517	QQENMGRGERSKKKRRFRSLSPVGRDTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
497-507	GERSKKKRRFR

Subcellular Location(s)

mito 19, nucl 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006939 SNF5 IPR013088 Znf_NHR/GATA
Gene Ontology	GO:0000228 C:nuclear chromosome GO:0070603 C:SWI/SNF superfamily-type complex GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04855 SNF5

Amino Acid Sequences

MFTTTGKTAPPQAFMSSYAPRLRSHGNSLISPVVPLANTLPAPRVTKRGTAVLSYAEDAYDDDDFEDSDRPRRATGLRSIQRGTDASTLDQTAQIAALGEELTKPVELQGIWRDWMGRPKRTLTEKQVQTQSVLPVTLIPIRIDVDIQPFRPDAPLPTPSNAREFGINEHLPAYKQPDITPAYRLKDSFLWNLHEALTTPDQFAKQFVDELDLPNDRKPQLIMVMAGQIRQQLEEYAGVALHPLFHSTTAPTLQGTVGQPVQHIASQTGVSTPVASHRNGTSTPVVPQTNGTSTPMTNGVARTNGTQTPAPQPNGITATATALPSEELHNPDDTYRCIVTLNINLMNRLYTDKFEWSLLHPPGFAEMFAKTTCADIGLSGEWVAAMTHAIYEAVLRLKKEACENGGLVGDGEIDNDAVEPAIGAGWRYDHEHLCDEWEPKIEMLSKEEIEKREGDRERQIRRLRRETARFSSTSNMPGGPQNEFFNNIEQQENMGRGERSKKKRRFRSLSPVGRDTPGAGSGYGGQEGLLQESERHTWRCAHCYVWGTAVWAVRDGPRGPRSLCNNCGYLYERDKKLPPWSENLFYHERPHHEVQQPYRPQR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.36
3	0.32
4	0.35
5	0.37
6	0.36
7	0.34
8	0.37
9	0.4
10	0.4
11	0.43
12	0.45
13	0.43
14	0.43
15	0.45
16	0.44
17	0.37
18	0.33
19	0.26
20	0.19
21	0.15
22	0.15
23	0.13
24	0.14
25	0.14
26	0.15
27	0.18
28	0.21
29	0.26
30	0.27
31	0.33
32	0.32
33	0.38
34	0.4
35	0.43
36	0.41
37	0.39
38	0.38
39	0.34
40	0.32
41	0.28
42	0.25
43	0.18
44	0.16
45	0.14
46	0.14
47	0.11
48	0.09
49	0.08
50	0.08
51	0.08
52	0.09
53	0.14
54	0.14
55	0.2
56	0.25
57	0.26
58	0.26
59	0.3
60	0.33
61	0.34
62	0.43
63	0.47
64	0.49
65	0.53
66	0.54
67	0.5
68	0.5
69	0.45
70	0.39
71	0.32
72	0.27
73	0.23
74	0.24
75	0.24
76	0.21
77	0.21
78	0.17
79	0.12
80	0.11
81	0.09
82	0.07
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.06
93	0.09
94	0.08
95	0.12
96	0.17
97	0.19
98	0.2
99	0.2
100	0.21
101	0.22
102	0.32
103	0.35
104	0.36
105	0.37
106	0.42
107	0.49
108	0.55
109	0.61
110	0.61
111	0.64
112	0.63
113	0.67
114	0.68
115	0.62
116	0.56
117	0.5
118	0.44
119	0.35
120	0.29
121	0.21
122	0.15
123	0.16
124	0.17
125	0.15
126	0.12
127	0.12
128	0.13
129	0.13
130	0.13
131	0.13
132	0.18
133	0.2
134	0.2
135	0.21
136	0.2
137	0.21
138	0.22
139	0.21
140	0.17
141	0.19
142	0.25
143	0.25
144	0.28
145	0.32
146	0.31
147	0.35
148	0.32
149	0.28
150	0.24
151	0.22
152	0.23
153	0.27
154	0.25
155	0.22
156	0.22
157	0.22
158	0.2
159	0.2
160	0.22
161	0.19
162	0.19
163	0.19
164	0.24
165	0.27
166	0.28
167	0.32
168	0.31
169	0.31
170	0.32
171	0.32
172	0.29
173	0.3
174	0.32
175	0.32
176	0.3
177	0.3
178	0.29
179	0.3
180	0.28
181	0.23
182	0.2
183	0.18
184	0.18
185	0.15
186	0.14
187	0.15
188	0.15
189	0.15
190	0.16
191	0.14
192	0.12
193	0.12
194	0.11
195	0.14
196	0.13
197	0.15
198	0.17
199	0.18
200	0.18
201	0.2
202	0.23
203	0.19
204	0.19
205	0.18
206	0.16
207	0.16
208	0.16
209	0.14
210	0.12
211	0.16
212	0.16
213	0.16
214	0.14
215	0.14
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.07
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.06
233	0.07
234	0.07
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.08
239	0.09
240	0.08
241	0.1
242	0.1
243	0.11
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.11
249	0.1
250	0.1
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.07
256	0.08
257	0.07
258	0.06
259	0.06
260	0.1
261	0.12
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.15
266	0.15
267	0.18
268	0.16
269	0.14
270	0.16
271	0.19
272	0.19
273	0.17
274	0.17
275	0.16
276	0.15
277	0.15
278	0.15
279	0.12
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.11
291	0.12
292	0.13
293	0.12
294	0.14
295	0.2
296	0.23
297	0.23
298	0.22
299	0.21
300	0.21
301	0.23
302	0.21
303	0.14
304	0.1
305	0.11
306	0.11
307	0.11
308	0.09
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.09
313	0.09
314	0.1
315	0.11
316	0.12
317	0.12
318	0.13
319	0.14
320	0.12
321	0.13
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.11
326	0.12
327	0.13
328	0.15
329	0.16
330	0.16
331	0.16
332	0.16
333	0.15
334	0.14
335	0.14
336	0.12
337	0.1
338	0.12
339	0.13
340	0.14
341	0.15
342	0.15
343	0.15
344	0.21
345	0.22
346	0.2
347	0.18
348	0.17
349	0.18
350	0.17
351	0.15
352	0.09
353	0.07
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.05
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.05
380	0.09
381	0.1
382	0.1
383	0.12
384	0.14
385	0.16
386	0.2
387	0.21
388	0.2
389	0.21
390	0.21
391	0.2
392	0.19
393	0.17
394	0.13
395	0.1
396	0.09
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.04
412	0.05
413	0.06
414	0.09
415	0.12
416	0.13
417	0.16
418	0.18
419	0.18
420	0.22
421	0.25
422	0.23
423	0.22
424	0.23
425	0.21
426	0.18
427	0.21
428	0.2
429	0.18
430	0.2
431	0.22
432	0.2
433	0.24
434	0.29
435	0.28
436	0.26
437	0.28
438	0.27
439	0.33
440	0.36
441	0.36
442	0.41
443	0.48
444	0.52
445	0.59
446	0.65
447	0.65
448	0.71
449	0.75
450	0.74
451	0.76
452	0.79
453	0.78
454	0.76
455	0.73
456	0.64
457	0.57
458	0.54
459	0.47
460	0.41
461	0.34
462	0.27
463	0.22
464	0.26
465	0.25
466	0.23
467	0.23
468	0.22
469	0.21
470	0.25
471	0.24
472	0.24
473	0.25
474	0.24
475	0.22
476	0.2
477	0.21
478	0.2
479	0.2
480	0.17
481	0.17
482	0.16
483	0.19
484	0.29
485	0.37
486	0.45
487	0.55
488	0.64
489	0.72
490	0.82
491	0.9
492	0.89
493	0.89
494	0.89
495	0.9
496	0.9
497	0.86
498	0.81
499	0.72
500	0.65
501	0.55
502	0.46
503	0.37
504	0.28
505	0.22
506	0.16
507	0.14
508	0.15
509	0.15
510	0.14
511	0.12
512	0.09
513	0.11
514	0.11
515	0.12
516	0.1
517	0.1
518	0.1
519	0.13
520	0.17
521	0.2
522	0.22
523	0.23
524	0.3
525	0.35
526	0.4
527	0.39
528	0.37
529	0.39
530	0.41
531	0.4
532	0.35
533	0.31
534	0.27
535	0.28
536	0.28
537	0.23
538	0.2
539	0.19
540	0.19
541	0.24
542	0.23
543	0.29
544	0.3
545	0.35
546	0.37
547	0.43
548	0.5
549	0.53
550	0.58
551	0.53
552	0.51
553	0.47
554	0.48
555	0.45
556	0.43
557	0.43
558	0.46
559	0.46
560	0.49
561	0.53
562	0.55
563	0.6
564	0.62
565	0.57
566	0.56
567	0.59
568	0.61
569	0.59
570	0.61
571	0.58
572	0.5
573	0.54
574	0.52
575	0.51
576	0.51
577	0.55
578	0.57
579	0.58
580	0.64
581	0.64
582	0.69

A0A178AMH5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer