FuNGI

A0A178AFD7

Protein Details

Accession

A0A178AFD7

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
173-198	NPDVRGNREREPRKRPPPKRDFLDYG	Basic
306-336	DNTNVRTRYRSRSRSRNARRRREPSGERWTH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
178-192	GNREREPRKRPPPKR
241-253	DSRGRGGRPRNDR
315-329	RSRSRSRNARRRREP

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019416 NCBP3
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000340 F:RNA 7-methylguanosine cap binding
Pfam	View protein in Pfam PF10309 NCBP3

Amino Acid Sequences

MDTDMMDAGYDIDIDVGAGLNPPAQQPQQIIQQETTQKDTNDMPAAYYENLDTQPAKAWPECLNLQGVSEFDPNDPLYYIMEHCGADPRAKQLRWVNDTSVNLEFYSPQEAAAALQLLTHEEVGNASSLGSQDSRRAKSYSKKPDSVLRIREANDGDQKPKGAANRSNYYQRNPDVRGNREREPRKRPPPKRDFLDYGEEEVDSRGSRDRRRRSTGDESMDEDSGVEKRRNNSRYERDNRDSRGRGGRPRNDRQRDAGRLRDDRADVDSYRPGTRSPRESHFGRLRNRSASPTSDDGDGRFGFAEDNTNVRTRYRSRSRSRNARRRREPSGERWTHDRANYGQSGGRWQKDASLVDSSPMGNHRRSDAMDETRKGNSLLSRMTKDGRPVVPQSRSLADRITRDDGDDSSYGRLKNDDSEPVFSDFSEPKPRRNLIDRISRDTDINIRGRGQEGINIRGTAGNDSPGGGGINIRGVASGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.05
3	0.04
4	0.04
5	0.05
6	0.05
7	0.07
8	0.08
9	0.09
10	0.14
11	0.15
12	0.17
13	0.2
14	0.24
15	0.32
16	0.36
17	0.38
18	0.35
19	0.41
20	0.46
21	0.45
22	0.46
23	0.41
24	0.36
25	0.36
26	0.37
27	0.35
28	0.34
29	0.31
30	0.26
31	0.24
32	0.26
33	0.24
34	0.22
35	0.18
36	0.15
37	0.15
38	0.17
39	0.16
40	0.14
41	0.18
42	0.19
43	0.22
44	0.2
45	0.23
46	0.24
47	0.29
48	0.3
49	0.27
50	0.28
51	0.24
52	0.24
53	0.22
54	0.19
55	0.17
56	0.17
57	0.17
58	0.14
59	0.17
60	0.16
61	0.16
62	0.16
63	0.13
64	0.12
65	0.13
66	0.14
67	0.13
68	0.14
69	0.13
70	0.13
71	0.19
72	0.19
73	0.21
74	0.21
75	0.28
76	0.34
77	0.34
78	0.41
79	0.42
80	0.5
81	0.53
82	0.55
83	0.51
84	0.48
85	0.5
86	0.46
87	0.4
88	0.32
89	0.26
90	0.23
91	0.19
92	0.15
93	0.17
94	0.14
95	0.12
96	0.11
97	0.11
98	0.11
99	0.11
100	0.1
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.07
105	0.08
106	0.08
107	0.07
108	0.06
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.06
113	0.05
114	0.06
115	0.06
116	0.07
117	0.08
118	0.09
119	0.15
120	0.22
121	0.25
122	0.27
123	0.3
124	0.34
125	0.43
126	0.52
127	0.57
128	0.58
129	0.59
130	0.59
131	0.65
132	0.68
133	0.67
134	0.62
135	0.55
136	0.51
137	0.49
138	0.51
139	0.44
140	0.4
141	0.4
142	0.36
143	0.34
144	0.31
145	0.3
146	0.26
147	0.27
148	0.26
149	0.25
150	0.29
151	0.33
152	0.38
153	0.41
154	0.49
155	0.49
156	0.49
157	0.48
158	0.46
159	0.46
160	0.44
161	0.48
162	0.47
163	0.51
164	0.56
165	0.55
166	0.57
167	0.61
168	0.66
169	0.67
170	0.69
171	0.73
172	0.75
173	0.81
174	0.84
175	0.86
176	0.87
177	0.87
178	0.84
179	0.8
180	0.74
181	0.67
182	0.65
183	0.54
184	0.46
185	0.37
186	0.31
187	0.24
188	0.2
189	0.16
190	0.08
191	0.08
192	0.11
193	0.15
194	0.22
195	0.32
196	0.41
197	0.49
198	0.56
199	0.59
200	0.62
201	0.67
202	0.67
203	0.63
204	0.55
205	0.49
206	0.44
207	0.4
208	0.32
209	0.22
210	0.15
211	0.12
212	0.13
213	0.12
214	0.13
215	0.17
216	0.26
217	0.29
218	0.33
219	0.4
220	0.46
221	0.55
222	0.6
223	0.65
224	0.62
225	0.65
226	0.65
227	0.64
228	0.57
229	0.51
230	0.52
231	0.47
232	0.5
233	0.53
234	0.57
235	0.58
236	0.66
237	0.72
238	0.7
239	0.68
240	0.66
241	0.65
242	0.66
243	0.61
244	0.58
245	0.54
246	0.5
247	0.49
248	0.46
249	0.38
250	0.31
251	0.29
252	0.25
253	0.2
254	0.19
255	0.2
256	0.19
257	0.19
258	0.19
259	0.17
260	0.2
261	0.24
262	0.29
263	0.31
264	0.33
265	0.38
266	0.39
267	0.46
268	0.49
269	0.52
270	0.52
271	0.55
272	0.54
273	0.53
274	0.53
275	0.49
276	0.43
277	0.39
278	0.36
279	0.31
280	0.29
281	0.27
282	0.25
283	0.22
284	0.22
285	0.19
286	0.15
287	0.12
288	0.11
289	0.09
290	0.09
291	0.12
292	0.09
293	0.11
294	0.12
295	0.14
296	0.15
297	0.15
298	0.2
299	0.21
300	0.3
301	0.38
302	0.47
303	0.54
304	0.64
305	0.74
306	0.8
307	0.87
308	0.88
309	0.89
310	0.9
311	0.91
312	0.88
313	0.86
314	0.85
315	0.81
316	0.8
317	0.81
318	0.75
319	0.67
320	0.65
321	0.62
322	0.56
323	0.5
324	0.44
325	0.35
326	0.36
327	0.34
328	0.3
329	0.27
330	0.23
331	0.3
332	0.31
333	0.3
334	0.27
335	0.26
336	0.27
337	0.3
338	0.31
339	0.25
340	0.25
341	0.24
342	0.23
343	0.23
344	0.2
345	0.17
346	0.2
347	0.2
348	0.18
349	0.19
350	0.21
351	0.23
352	0.24
353	0.28
354	0.3
355	0.36
356	0.41
357	0.42
358	0.42
359	0.4
360	0.4
361	0.35
362	0.31
363	0.25
364	0.22
365	0.26
366	0.29
367	0.31
368	0.32
369	0.36
370	0.35
371	0.38
372	0.41
373	0.37
374	0.37
375	0.4
376	0.45
377	0.46
378	0.47
379	0.45
380	0.43
381	0.42
382	0.38
383	0.37
384	0.33
385	0.33
386	0.35
387	0.37
388	0.33
389	0.33
390	0.33
391	0.28
392	0.28
393	0.25
394	0.21
395	0.19
396	0.23
397	0.22
398	0.2
399	0.22
400	0.19
401	0.24
402	0.26
403	0.3
404	0.3
405	0.33
406	0.35
407	0.36
408	0.35
409	0.3
410	0.3
411	0.24
412	0.27
413	0.34
414	0.33
415	0.36
416	0.45
417	0.48
418	0.51
419	0.57
420	0.61
421	0.58
422	0.67
423	0.67
424	0.66
425	0.68
426	0.62
427	0.55
428	0.49
429	0.47
430	0.44
431	0.43
432	0.37
433	0.34
434	0.34
435	0.35
436	0.35
437	0.29
438	0.28
439	0.27
440	0.3
441	0.31
442	0.29
443	0.28
444	0.27
445	0.28
446	0.26
447	0.22
448	0.2
449	0.17
450	0.18
451	0.17
452	0.15
453	0.15
454	0.11
455	0.1
456	0.09
457	0.11
458	0.11
459	0.11

A0A178AFD7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer