FuNGI

A0A178B5I4

Protein Details

Accession

A0A178B5I4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
162-186	DADRRKQKEADRKTKREQERASRGR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-14	RAARSARGG
117-186	RRGTSTRGKRGMIKPTFTGRRSKEERAALEKEAIEREKARTKEQADADRRKQKEADRKTKREQERASRGR

Subcellular Location(s)

mito 14, cyto_nucl 7.5, nucl 7, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKPRAARSARGGRGGAAASRPSTQEAASTVTPQSTEPATTSDAPTQPVVLKHDDDEDVKPPTPSESAAAPHAAQEASPAEAPASTTPVDGTDPPGRPVQRLGSLNASRSASPAVRRGTSTRGKRGMIKPTFTGRRSKEERAALEKEAIEREKARTKEQADADRRKQKEADRKTKREQERASRGRGGYSGAMSGPFSLGSSREDRKTNHRTTSGFGAGSGSRATRIKNEDGGEGSSGYRGSGSGGGGGGSSSRREGGGGMESSEDEEDAEFPRKDIDLIEISSDENEAAPVARPLRSALPVRIGRKEHQERSFGINTDASTEASAKILDQAESGGKAPSDVLKQVSSKGKGKMKESDATSSKKPFKGVWQDSDELASPVKTEENSEDEQMVEAGQVGIVEQPKQTEEPQASPQEAPTEEDSRPKAKPKSIAEPVLQTDEDRAEWARFQNNLSHIRTELGPDESTTTDEAGDVNMVEGTSNARKPTVRDNNVYLFQIPPLMPELHSATIKKEPSDAPAPLPAPTPATGNVKIKVEEGFTDPAGAGHEAPRFASGCVGKLRVRQSGRTTLDWGGTSYELTPGNKASFLQEVVSLNVVPENQRVVPEDAGDAISFGRVKGKFVVIPDWGQMLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.51
3	0.44
4	0.37
5	0.3
6	0.27
7	0.23
8	0.24
9	0.24
10	0.24
11	0.24
12	0.21
13	0.2
14	0.19
15	0.22
16	0.21
17	0.22
18	0.2
19	0.2
20	0.2
21	0.18
22	0.19
23	0.16
24	0.16
25	0.15
26	0.17
27	0.2
28	0.22
29	0.24
30	0.28
31	0.28
32	0.29
33	0.28
34	0.27
35	0.26
36	0.27
37	0.29
38	0.27
39	0.27
40	0.26
41	0.29
42	0.29
43	0.29
44	0.29
45	0.28
46	0.29
47	0.28
48	0.27
49	0.24
50	0.25
51	0.23
52	0.22
53	0.19
54	0.18
55	0.19
56	0.21
57	0.23
58	0.19
59	0.19
60	0.19
61	0.17
62	0.14
63	0.14
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.12
68	0.11
69	0.11
70	0.13
71	0.11
72	0.13
73	0.11
74	0.11
75	0.11
76	0.12
77	0.14
78	0.13
79	0.18
80	0.22
81	0.23
82	0.25
83	0.31
84	0.31
85	0.31
86	0.34
87	0.33
88	0.34
89	0.34
90	0.35
91	0.39
92	0.4
93	0.41
94	0.41
95	0.38
96	0.3
97	0.29
98	0.3
99	0.23
100	0.24
101	0.29
102	0.29
103	0.29
104	0.32
105	0.33
106	0.38
107	0.44
108	0.49
109	0.52
110	0.54
111	0.55
112	0.61
113	0.65
114	0.67
115	0.64
116	0.59
117	0.54
118	0.58
119	0.63
120	0.56
121	0.59
122	0.52
123	0.56
124	0.59
125	0.61
126	0.59
127	0.58
128	0.61
129	0.59
130	0.59
131	0.51
132	0.48
133	0.42
134	0.37
135	0.34
136	0.3
137	0.26
138	0.24
139	0.27
140	0.32
141	0.33
142	0.35
143	0.37
144	0.39
145	0.44
146	0.48
147	0.53
148	0.55
149	0.62
150	0.67
151	0.69
152	0.68
153	0.64
154	0.62
155	0.61
156	0.62
157	0.64
158	0.66
159	0.68
160	0.75
161	0.8
162	0.85
163	0.85
164	0.84
165	0.81
166	0.81
167	0.81
168	0.79
169	0.76
170	0.72
171	0.64
172	0.56
173	0.48
174	0.39
175	0.3
176	0.24
177	0.19
178	0.13
179	0.13
180	0.11
181	0.11
182	0.08
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.09
188	0.14
189	0.17
190	0.21
191	0.25
192	0.27
193	0.36
194	0.45
195	0.49
196	0.5
197	0.51
198	0.49
199	0.48
200	0.51
201	0.44
202	0.34
203	0.28
204	0.24
205	0.19
206	0.19
207	0.17
208	0.1
209	0.1
210	0.11
211	0.12
212	0.15
213	0.2
214	0.22
215	0.26
216	0.27
217	0.26
218	0.26
219	0.26
220	0.22
221	0.18
222	0.15
223	0.11
224	0.1
225	0.08
226	0.07
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.06
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.08
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.08
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.06
257	0.11
258	0.1
259	0.1
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.12
265	0.1
266	0.1
267	0.11
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.07
273	0.05
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.05
279	0.06
280	0.07
281	0.07
282	0.09
283	0.11
284	0.14
285	0.15
286	0.15
287	0.22
288	0.26
289	0.28
290	0.32
291	0.33
292	0.32
293	0.4
294	0.47
295	0.46
296	0.45
297	0.46
298	0.43
299	0.47
300	0.47
301	0.37
302	0.31
303	0.25
304	0.21
305	0.2
306	0.19
307	0.12
308	0.1
309	0.1
310	0.09
311	0.08
312	0.08
313	0.05
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.08
327	0.08
328	0.09
329	0.1
330	0.11
331	0.12
332	0.17
333	0.22
334	0.24
335	0.27
336	0.33
337	0.36
338	0.38
339	0.41
340	0.44
341	0.42
342	0.44
343	0.41
344	0.41
345	0.41
346	0.41
347	0.4
348	0.41
349	0.42
350	0.38
351	0.38
352	0.32
353	0.37
354	0.44
355	0.46
356	0.44
357	0.44
358	0.43
359	0.42
360	0.42
361	0.34
362	0.23
363	0.18
364	0.12
365	0.08
366	0.07
367	0.08
368	0.07
369	0.08
370	0.09
371	0.13
372	0.15
373	0.15
374	0.15
375	0.14
376	0.14
377	0.13
378	0.11
379	0.06
380	0.05
381	0.04
382	0.04
383	0.03
384	0.03
385	0.05
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.09
391	0.1
392	0.11
393	0.15
394	0.16
395	0.19
396	0.24
397	0.26
398	0.27
399	0.25
400	0.25
401	0.23
402	0.21
403	0.2
404	0.18
405	0.2
406	0.18
407	0.23
408	0.25
409	0.26
410	0.28
411	0.34
412	0.35
413	0.37
414	0.44
415	0.45
416	0.52
417	0.55
418	0.58
419	0.52
420	0.5
421	0.47
422	0.42
423	0.36
424	0.27
425	0.21
426	0.17
427	0.16
428	0.13
429	0.13
430	0.1
431	0.12
432	0.15
433	0.17
434	0.18
435	0.19
436	0.22
437	0.27
438	0.33
439	0.33
440	0.32
441	0.29
442	0.29
443	0.28
444	0.25
445	0.22
446	0.18
447	0.16
448	0.15
449	0.17
450	0.16
451	0.16
452	0.15
453	0.13
454	0.1
455	0.1
456	0.09
457	0.07
458	0.07
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.08
466	0.12
467	0.14
468	0.14
469	0.16
470	0.18
471	0.2
472	0.31
473	0.39
474	0.41
475	0.44
476	0.49
477	0.52
478	0.54
479	0.52
480	0.42
481	0.32
482	0.26
483	0.25
484	0.19
485	0.15
486	0.15
487	0.15
488	0.14
489	0.16
490	0.2
491	0.19
492	0.22
493	0.21
494	0.21
495	0.27
496	0.28
497	0.26
498	0.27
499	0.25
500	0.29
501	0.34
502	0.32
503	0.28
504	0.32
505	0.32
506	0.29
507	0.29
508	0.24
509	0.21
510	0.2
511	0.2
512	0.18
513	0.23
514	0.27
515	0.3
516	0.32
517	0.32
518	0.32
519	0.31
520	0.29
521	0.24
522	0.21
523	0.21
524	0.21
525	0.18
526	0.18
527	0.17
528	0.16
529	0.16
530	0.15
531	0.12
532	0.13
533	0.15
534	0.15
535	0.15
536	0.17
537	0.16
538	0.15
539	0.21
540	0.18
541	0.2
542	0.23
543	0.27
544	0.28
545	0.33
546	0.38
547	0.41
548	0.44
549	0.47
550	0.5
551	0.56
552	0.58
553	0.55
554	0.54
555	0.47
556	0.46
557	0.4
558	0.34
559	0.26
560	0.22
561	0.2
562	0.16
563	0.17
564	0.17
565	0.18
566	0.19
567	0.19
568	0.2
569	0.2
570	0.2
571	0.2
572	0.2
573	0.2
574	0.19
575	0.19
576	0.19
577	0.2
578	0.21
579	0.18
580	0.15
581	0.15
582	0.15
583	0.13
584	0.14
585	0.17
586	0.16
587	0.18
588	0.22
589	0.24
590	0.24
591	0.23
592	0.22
593	0.19
594	0.2
595	0.18
596	0.14
597	0.1
598	0.12
599	0.11
600	0.1
601	0.17
602	0.16
603	0.19
604	0.22
605	0.27
606	0.27
607	0.3
608	0.35
609	0.31
610	0.33
611	0.32

A0A178B5I4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer