Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ASR1

Protein Details
Accession A0A178ASR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-166GGGKGEKGGEKKKRKKQKKDKGEAVGMGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-158GGGGGKGEKGGEKKKRKKQKKDK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MTEVRMRLRQKGQQFPTQDLESFLLAFGDNDYPLPSTVRVLDEIITDYIIETCHEAASVAHHARRAKIKLDDFKFMLRRDTVKLGRVSDMLETDKELKRKRKAFDTDEGAVLGKGEEEGGAKGGDAGGKEDGGAVGGGGGKGEKGGEKKKRKKQKKDKGEAVGMGDEDREG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.63
3 0.62
4 0.56
5 0.47
6 0.4
7 0.36
8 0.28
9 0.24
10 0.19
11 0.13
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.1
21 0.11
22 0.1
23 0.11
24 0.12
25 0.13
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.14
31 0.13
32 0.11
33 0.09
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.08
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.18
49 0.19
50 0.22
51 0.29
52 0.29
53 0.28
54 0.33
55 0.39
56 0.44
57 0.46
58 0.47
59 0.42
60 0.44
61 0.43
62 0.38
63 0.34
64 0.26
65 0.25
66 0.24
67 0.29
68 0.26
69 0.27
70 0.28
71 0.27
72 0.26
73 0.25
74 0.23
75 0.16
76 0.16
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.13
81 0.15
82 0.2
83 0.26
84 0.33
85 0.4
86 0.47
87 0.5
88 0.55
89 0.6
90 0.6
91 0.62
92 0.6
93 0.53
94 0.47
95 0.44
96 0.34
97 0.26
98 0.21
99 0.13
100 0.06
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.08
131 0.14
132 0.24
133 0.34
134 0.46
135 0.57
136 0.67
137 0.78
138 0.86
139 0.91
140 0.93
141 0.94
142 0.94
143 0.95
144 0.95
145 0.93
146 0.89
147 0.81
148 0.73
149 0.63
150 0.52
151 0.42