Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178BAR9

Protein Details
Accession A0A178BAR9    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
255-288RRRHMAKQTKRTKWAKKERRQKCKRQSTPPVSTAHydrophilic
489-521RTPNSPTRCAKSPTKKRSGRKRKLITSPGVLRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-277RRRHMAKQTKRTKWAKKERRQKC
500-511SPTKKRSGRKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009027  Ribosomal_L9/RNase_H1_N  
IPR011320  RNase_H1_N  
IPR037056  RNase_H1_N_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01693  Cauli_VI  
Amino Acid Sequences MSAEGYRPAIKQETFGNTQDTRCHYVVITGKRPGIYTDIAEAREQLEGFPGSNYIKCEDRTSAVDLMRINGIATDSIRLFRGAFESQINFVPNPTATFKDEFRRFASTQQWTQEETRKARVDAIRDEIIKHCLPNGVRVLNEQDVDEKGDVRLDEEQYLEVYQAMCRRAGKRVRRTIDDNLLELHDKPYVNILDLIDAFRMGQKLRTFQKWRDFAAYTQKGRKMDVLYAKENEFLAPLLQDFTKGPGAVDPCAVRRRHMAKQTKRTKWAKKERRQKCKRQSTPPVSTAELPRDLSPSVFDRAPSPLVPELPDDHLSTPGQSQVDCSVSNPPADEADTEFDSASDVFEDEDVIRMVTQASQVSKSEVPAEAFETEVLDEYGSDSEVFEEVVKLEATQPELFHIESSQKHFPATSQDLAQGRKKIKMETLDSVPFVSSQRAFVDHPIPISTPQTGLDLSDQALIEERPETPPSLIWSATSRTGVSPSEDDRTPNSPTRCAKSPTKKRSGRKRKLITSPGVLRSVKRACTNSRGLT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.39
3 0.41
4 0.38
5 0.4
6 0.43
7 0.43
8 0.42
9 0.38
10 0.37
11 0.31
12 0.35
13 0.41
14 0.44
15 0.45
16 0.43
17 0.46
18 0.45
19 0.46
20 0.4
21 0.37
22 0.31
23 0.26
24 0.27
25 0.28
26 0.28
27 0.28
28 0.27
29 0.23
30 0.23
31 0.21
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.15
39 0.17
40 0.19
41 0.18
42 0.22
43 0.23
44 0.26
45 0.27
46 0.28
47 0.29
48 0.32
49 0.34
50 0.31
51 0.33
52 0.29
53 0.28
54 0.25
55 0.21
56 0.17
57 0.12
58 0.12
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.16
69 0.15
70 0.16
71 0.19
72 0.2
73 0.21
74 0.23
75 0.24
76 0.2
77 0.19
78 0.19
79 0.16
80 0.18
81 0.19
82 0.19
83 0.2
84 0.23
85 0.26
86 0.34
87 0.38
88 0.38
89 0.39
90 0.43
91 0.4
92 0.43
93 0.48
94 0.46
95 0.46
96 0.48
97 0.47
98 0.43
99 0.47
100 0.5
101 0.49
102 0.46
103 0.49
104 0.46
105 0.45
106 0.48
107 0.48
108 0.45
109 0.42
110 0.43
111 0.4
112 0.37
113 0.38
114 0.33
115 0.34
116 0.3
117 0.25
118 0.21
119 0.21
120 0.21
121 0.25
122 0.28
123 0.24
124 0.24
125 0.25
126 0.29
127 0.26
128 0.26
129 0.21
130 0.18
131 0.17
132 0.19
133 0.17
134 0.13
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.15
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.12
151 0.13
152 0.14
153 0.17
154 0.19
155 0.27
156 0.36
157 0.44
158 0.51
159 0.6
160 0.63
161 0.66
162 0.69
163 0.68
164 0.68
165 0.6
166 0.5
167 0.41
168 0.37
169 0.32
170 0.27
171 0.21
172 0.15
173 0.13
174 0.12
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.07
189 0.12
190 0.13
191 0.19
192 0.24
193 0.32
194 0.36
195 0.42
196 0.51
197 0.5
198 0.51
199 0.5
200 0.47
201 0.41
202 0.47
203 0.47
204 0.42
205 0.44
206 0.45
207 0.41
208 0.4
209 0.41
210 0.32
211 0.31
212 0.35
213 0.34
214 0.33
215 0.34
216 0.33
217 0.31
218 0.29
219 0.23
220 0.16
221 0.11
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.12
235 0.11
236 0.13
237 0.11
238 0.13
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.24
243 0.29
244 0.34
245 0.43
246 0.5
247 0.54
248 0.64
249 0.74
250 0.73
251 0.77
252 0.8
253 0.79
254 0.8
255 0.82
256 0.82
257 0.82
258 0.86
259 0.87
260 0.89
261 0.9
262 0.9
263 0.9
264 0.9
265 0.89
266 0.89
267 0.9
268 0.87
269 0.84
270 0.77
271 0.69
272 0.59
273 0.52
274 0.44
275 0.36
276 0.29
277 0.22
278 0.19
279 0.18
280 0.16
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.14
289 0.16
290 0.14
291 0.15
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.17
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.15
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.13
311 0.12
312 0.13
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.09
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.11
347 0.12
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.16
353 0.15
354 0.14
355 0.16
356 0.13
357 0.13
358 0.12
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.08
380 0.09
381 0.13
382 0.13
383 0.13
384 0.14
385 0.16
386 0.15
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.17
391 0.23
392 0.26
393 0.25
394 0.25
395 0.25
396 0.25
397 0.29
398 0.32
399 0.28
400 0.24
401 0.29
402 0.32
403 0.36
404 0.41
405 0.39
406 0.36
407 0.4
408 0.41
409 0.39
410 0.41
411 0.44
412 0.44
413 0.43
414 0.47
415 0.43
416 0.42
417 0.39
418 0.33
419 0.27
420 0.22
421 0.21
422 0.15
423 0.14
424 0.15
425 0.18
426 0.18
427 0.21
428 0.24
429 0.22
430 0.22
431 0.22
432 0.22
433 0.21
434 0.23
435 0.2
436 0.17
437 0.16
438 0.17
439 0.15
440 0.15
441 0.15
442 0.13
443 0.13
444 0.15
445 0.14
446 0.12
447 0.14
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.15
454 0.17
455 0.16
456 0.18
457 0.22
458 0.23
459 0.22
460 0.21
461 0.22
462 0.24
463 0.26
464 0.26
465 0.22
466 0.2
467 0.23
468 0.23
469 0.23
470 0.24
471 0.24
472 0.27
473 0.28
474 0.29
475 0.3
476 0.33
477 0.35
478 0.38
479 0.39
480 0.42
481 0.48
482 0.52
483 0.55
484 0.58
485 0.63
486 0.66
487 0.74
488 0.76
489 0.81
490 0.84
491 0.87
492 0.92
493 0.93
494 0.93
495 0.93
496 0.93
497 0.92
498 0.93
499 0.92
500 0.88
501 0.86
502 0.83
503 0.78
504 0.74
505 0.66
506 0.56
507 0.56
508 0.55
509 0.51
510 0.5
511 0.51
512 0.5
513 0.57