FuNGI

J4W6B5

Protein Details

Accession

J4W6B5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
670-690	GSLTPWSRRHPRKALPAPVQD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto_nucl 6, nucl 5.5, cyto 5.5, extr 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MTAVDIHRCRFVPYQPSAINAVAFSHPRTRDSKHAAVARLAVGRANGDIEIWNAAAGIWHQELVIRGGKDRSIDGLVWINEPDQDLGEGRILIGKSRLFSIGYTSTVTEWDLETGKPKRHASGQHGDLWCIAAQPSLNDKRGSSVTDTQGSNKLVAGTIDGELVMYSVEDDDLRFQRTIVKSPTKKAQMVSIIFQSRKVVIVGCSDSTIRAYDITKGHMLRRMTLGSDLVGGSKDIIVWSVKCLPNGNIVSGDSTGQVCIWDGKTYTQTQRLQSHKQDVLSLAISSDGSTIMSGGMDRRTVLYKQNSGAGQRWGKVWGRRYHEHDVKAMATFEHARISVVVSGGPDSNLVIVPLKEMGREHHRTISSLPQQPPLISASKARFMVSWWDREIHLWLLQKSASDLTKLDGESDFDINQNRKLLKTIVVKGDSNISSASINPNGTLLVASTSTDVKAFALEHSNPTKPADVTLSSIELPEQVTKLGASKVQISPDGSWLCFVQNGSRVIIASISSESNSHTIAASRHLRRLHRSVPKYILNGGLGSYERNVAHIAFSPDSKLLATADLAGYVDTWVLRDAAHDGADGYANGTEEDDASATDSDSSDDDAESTSTNEVGRWIRNPNAKLMPKLPAAPSVLAFSDSIPGQEGVEDYTLAAVTSSWNVVAFNALQGSLTPWSRRHPRKALPAPVQDLSDLAKGAFWQGSRLWIYGVSFLFMLDMSQDLPAPDKEVSEQLVQQGTKRKRTNATSGAGGRMEREGLKPQQIRKYSSNKWEDVDVDGPSTSGDVDIDSDDDMIDGADSELAQLRSAVAGGEALSGGAEDENGRKTWWITYKYRPVLGVVSFGGDDSLELALVERPTWDIEMQDSYYAGQEWELR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.47
3	0.49
4	0.48
5	0.44
6	0.38
7	0.29
8	0.27
9	0.21
10	0.22
11	0.22
12	0.27
13	0.27
14	0.31
15	0.36
16	0.39
17	0.45
18	0.52
19	0.56
20	0.56
21	0.61
22	0.59
23	0.57
24	0.54
25	0.48
26	0.42
27	0.35
28	0.28
29	0.22
30	0.2
31	0.18
32	0.16
33	0.12
34	0.1
35	0.11
36	0.1
37	0.11
38	0.1
39	0.09
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.1
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.13
50	0.16
51	0.21
52	0.18
53	0.2
54	0.22
55	0.24
56	0.24
57	0.24
58	0.23
59	0.21
60	0.2
61	0.21
62	0.25
63	0.24
64	0.24
65	0.24
66	0.2
67	0.18
68	0.19
69	0.17
70	0.11
71	0.11
72	0.11
73	0.12
74	0.13
75	0.11
76	0.1
77	0.14
78	0.13
79	0.13
80	0.16
81	0.17
82	0.16
83	0.18
84	0.2
85	0.16
86	0.17
87	0.21
88	0.2
89	0.2
90	0.21
91	0.2
92	0.19
93	0.19
94	0.19
95	0.14
96	0.11
97	0.12
98	0.12
99	0.12
100	0.2
101	0.24
102	0.3
103	0.37
104	0.38
105	0.4
106	0.46
107	0.53
108	0.54
109	0.59
110	0.57
111	0.58
112	0.57
113	0.53
114	0.46
115	0.4
116	0.31
117	0.22
118	0.18
119	0.1
120	0.1
121	0.12
122	0.2
123	0.25
124	0.28
125	0.28
126	0.28
127	0.32
128	0.33
129	0.34
130	0.31
131	0.31
132	0.33
133	0.37
134	0.38
135	0.36
136	0.41
137	0.39
138	0.33
139	0.27
140	0.23
141	0.18
142	0.17
143	0.16
144	0.11
145	0.1
146	0.1
147	0.09
148	0.08
149	0.07
150	0.07
151	0.05
152	0.04
153	0.03
154	0.03
155	0.04
156	0.04
157	0.05
158	0.1
159	0.12
160	0.15
161	0.15
162	0.15
163	0.23
164	0.25
165	0.32
166	0.35
167	0.44
168	0.45
169	0.51
170	0.6
171	0.59
172	0.6
173	0.54
174	0.52
175	0.5
176	0.48
177	0.45
178	0.43
179	0.42
180	0.39
181	0.39
182	0.34
183	0.26
184	0.25
185	0.22
186	0.17
187	0.13
188	0.17
189	0.18
190	0.17
191	0.18
192	0.17
193	0.17
194	0.16
195	0.15
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.15
200	0.16
201	0.19
202	0.23
203	0.24
204	0.26
205	0.3
206	0.3
207	0.27
208	0.29
209	0.27
210	0.23
211	0.23
212	0.21
213	0.16
214	0.16
215	0.14
216	0.1
217	0.09
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.06
222	0.05
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.11
227	0.18
228	0.2
229	0.21
230	0.23
231	0.23
232	0.3
233	0.3
234	0.28
235	0.22
236	0.21
237	0.21
238	0.19
239	0.18
240	0.11
241	0.1
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.06
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.12
251	0.16
252	0.2
253	0.24
254	0.3
255	0.34
256	0.38
257	0.45
258	0.5
259	0.54
260	0.55
261	0.59
262	0.54
263	0.5
264	0.46
265	0.39
266	0.35
267	0.28
268	0.22
269	0.13
270	0.11
271	0.1
272	0.08
273	0.08
274	0.05
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.08
286	0.11
287	0.13
288	0.19
289	0.24
290	0.26
291	0.27
292	0.31
293	0.31
294	0.31
295	0.32
296	0.32
297	0.29
298	0.26
299	0.26
300	0.26
301	0.29
302	0.32
303	0.37
304	0.38
305	0.42
306	0.47
307	0.53
308	0.59
309	0.61
310	0.58
311	0.51
312	0.46
313	0.4
314	0.35
315	0.28
316	0.18
317	0.14
318	0.13
319	0.12
320	0.11
321	0.1
322	0.1
323	0.09
324	0.11
325	0.1
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.12
345	0.19
346	0.23
347	0.25
348	0.28
349	0.29
350	0.29
351	0.31
352	0.36
353	0.36
354	0.39
355	0.38
356	0.36
357	0.36
358	0.35
359	0.34
360	0.28
361	0.22
362	0.16
363	0.19
364	0.17
365	0.2
366	0.21
367	0.2
368	0.17
369	0.16
370	0.25
371	0.23
372	0.25
373	0.22
374	0.23
375	0.22
376	0.23
377	0.24
378	0.16
379	0.17
380	0.17
381	0.16
382	0.16
383	0.16
384	0.16
385	0.14
386	0.15
387	0.12
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.1
395	0.1
396	0.11
397	0.12
398	0.11
399	0.09
400	0.13
401	0.13
402	0.14
403	0.16
404	0.16
405	0.15
406	0.16
407	0.16
408	0.2
409	0.25
410	0.27
411	0.29
412	0.31
413	0.31
414	0.29
415	0.32
416	0.26
417	0.2
418	0.16
419	0.12
420	0.1
421	0.1
422	0.12
423	0.09
424	0.09
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.05
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.05
435	0.05
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.09
444	0.1
445	0.13
446	0.16
447	0.17
448	0.17
449	0.18
450	0.18
451	0.15
452	0.15
453	0.14
454	0.12
455	0.13
456	0.13
457	0.13
458	0.12
459	0.12
460	0.11
461	0.09
462	0.08
463	0.07
464	0.07
465	0.05
466	0.06
467	0.06
468	0.07
469	0.07
470	0.08
471	0.08
472	0.11
473	0.13
474	0.14
475	0.15
476	0.15
477	0.15
478	0.19
479	0.19
480	0.15
481	0.15
482	0.14
483	0.13
484	0.12
485	0.12
486	0.09
487	0.13
488	0.14
489	0.14
490	0.14
491	0.14
492	0.13
493	0.13
494	0.11
495	0.07
496	0.07
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.08
501	0.08
502	0.08
503	0.08
504	0.07
505	0.08
506	0.09
507	0.14
508	0.21
509	0.22
510	0.27
511	0.31
512	0.34
513	0.38
514	0.45
515	0.48
516	0.5
517	0.52
518	0.53
519	0.54
520	0.55
521	0.51
522	0.46
523	0.39
524	0.3
525	0.26
526	0.21
527	0.16
528	0.12
529	0.1
530	0.09
531	0.1
532	0.09
533	0.09
534	0.1
535	0.09
536	0.1
537	0.12
538	0.14
539	0.13
540	0.13
541	0.13
542	0.13
543	0.13
544	0.12
545	0.1
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.04
558	0.04
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.07
564	0.08
565	0.08
566	0.08
567	0.07
568	0.08
569	0.08
570	0.07
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.05
577	0.05
578	0.06
579	0.05
580	0.05
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.08
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.08
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.07
600	0.1
601	0.12
602	0.14
603	0.16
604	0.2
605	0.25
606	0.32
607	0.33
608	0.36
609	0.43
610	0.44
611	0.45
612	0.44
613	0.42
614	0.38
615	0.4
616	0.34
617	0.29
618	0.28
619	0.25
620	0.23
621	0.2
622	0.18
623	0.16
624	0.15
625	0.11
626	0.11
627	0.1
628	0.1
629	0.1
630	0.1
631	0.08
632	0.09
633	0.08
634	0.08
635	0.08
636	0.08
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.05
642	0.04
643	0.04
644	0.05
645	0.06
646	0.05
647	0.06
648	0.06
649	0.06
650	0.08
651	0.07
652	0.07
653	0.07
654	0.07
655	0.07
656	0.07
657	0.09
658	0.11
659	0.12
660	0.14
661	0.16
662	0.24
663	0.34
664	0.43
665	0.5
666	0.57
667	0.63
668	0.72
669	0.8
670	0.82
671	0.81
672	0.79
673	0.74
674	0.66
675	0.59
676	0.47
677	0.38
678	0.31
679	0.23
680	0.16
681	0.11
682	0.1
683	0.09
684	0.11
685	0.12
686	0.1
687	0.11
688	0.11
689	0.17
690	0.18
691	0.18
692	0.17
693	0.16
694	0.17
695	0.19
696	0.19
697	0.14
698	0.12
699	0.12
700	0.11
701	0.1
702	0.09
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.09
710	0.09
711	0.12
712	0.12
713	0.12
714	0.13
715	0.15
716	0.18
717	0.18
718	0.18
719	0.19
720	0.24
721	0.23
722	0.25
723	0.33
724	0.37
725	0.45
726	0.49
727	0.53
728	0.56
729	0.63
730	0.69
731	0.66
732	0.63
733	0.61
734	0.58
735	0.54
736	0.47
737	0.41
738	0.32
739	0.25
740	0.24
741	0.18
742	0.18
743	0.22
744	0.25
745	0.34
746	0.39
747	0.45
748	0.52
749	0.56
750	0.6
751	0.61
752	0.66
753	0.65
754	0.7
755	0.7
756	0.64
757	0.6
758	0.57
759	0.5
760	0.45
761	0.4
762	0.3
763	0.24
764	0.21
765	0.19
766	0.15
767	0.14
768	0.09
769	0.07
770	0.06
771	0.05
772	0.06
773	0.07
774	0.08
775	0.08
776	0.08
777	0.07
778	0.07
779	0.07
780	0.05
781	0.05
782	0.04
783	0.04
784	0.05
785	0.05
786	0.06
787	0.1
788	0.1
789	0.1
790	0.1
791	0.1
792	0.1
793	0.1
794	0.1
795	0.05
796	0.06
797	0.06
798	0.06
799	0.06
800	0.05
801	0.05
802	0.05
803	0.05
804	0.04
805	0.05
806	0.06
807	0.08
808	0.11
809	0.12
810	0.13
811	0.14
812	0.16
813	0.23
814	0.3
815	0.35
816	0.39
817	0.49
818	0.59
819	0.63
820	0.65
821	0.58
822	0.52
823	0.5
824	0.44
825	0.38
826	0.27
827	0.23
828	0.2
829	0.19
830	0.16
831	0.11
832	0.1
833	0.08
834	0.07
835	0.05
836	0.05
837	0.06
838	0.09
839	0.1
840	0.1
841	0.09
842	0.11
843	0.12
844	0.15
845	0.14
846	0.12
847	0.15
848	0.19
849	0.2
850	0.19
851	0.18
852	0.17
853	0.18
854	0.17
855	0.14

J4W6B5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer