Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178BBP3

Protein Details
Accession A0A178BBP3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
301-323TVAKHAKPRKGGRRGKRKAEDSNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-318KHAKPRKGGRRGKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MSAQHQARRSTSRTAPDAHSETTHTNKTDATPNGEQADPSSAVTPSQPSAPSAATVEEAAMLSALSAPSVAMVPPPAVDAVPGDYEDIADNGSSSLSELGDASDDQSEPTPRPTTALDMDDDDSEAETERLENTPRKLARTATDTSLASEALYTRTPSKLVHSRTVDQEESAPPTPSVITDDVTLDEAADAENPLHSLSLIAASEAASLEYVGKKRKRTSEVGSPVEEQEEDEPARKRSGTAKSPAPNGLLSSANDSGEQVDADEELEGAEERLSQLAHEEIDLEERQANIATEMVGELATVAKHAKPRKGGRRGKRKAEDSNDAFTEQFNGLDAQDGEGEDDHDEEVSAALDEELGKKKKAIDDLVPIQEKFKILQHKFVDENLAVAERELQMLKQPNCIHPEYLLMMKSIDERRADKIAYETKLLEYKRENLEIITAAERHQMHSQYFQTVRHVREGILEECNQRVYELQKGRRSLGCDDTQYMIKLPEKRSDQIRQQTAYNLEVSVLSGVAKYVGFPAAPDIRPARPVDIDDDFRAMKIATRAAPPPSFRTYNRTTTADEAAAETQFLESTPWANPRHPSHQEARFGPSRAPAYQTPAGQRRVVDLTAPNGSASTIEATSNPPSANAPNSNGRMGESESPVLQMKRHPAYQAAYSETPGSHSRNVGVLGREPYTMLSSPAAQHMEAPVDEQGGQRWGGNIRPMMGTPNTTAAGPPGPGRSDQTRVPMTHRNGIGVGDGLFGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.54
3 0.56
4 0.56
5 0.5
6 0.45
7 0.4
8 0.41
9 0.42
10 0.43
11 0.36
12 0.33
13 0.32
14 0.34
15 0.39
16 0.38
17 0.39
18 0.37
19 0.4
20 0.42
21 0.41
22 0.37
23 0.31
24 0.32
25 0.25
26 0.22
27 0.2
28 0.17
29 0.17
30 0.18
31 0.19
32 0.15
33 0.18
34 0.18
35 0.17
36 0.2
37 0.2
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.07
48 0.06
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.04
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.13
94 0.15
95 0.15
96 0.2
97 0.21
98 0.2
99 0.22
100 0.23
101 0.25
102 0.27
103 0.27
104 0.24
105 0.24
106 0.25
107 0.23
108 0.22
109 0.17
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.1
118 0.14
119 0.19
120 0.21
121 0.3
122 0.32
123 0.36
124 0.37
125 0.39
126 0.39
127 0.4
128 0.4
129 0.34
130 0.36
131 0.33
132 0.31
133 0.29
134 0.24
135 0.18
136 0.15
137 0.13
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.16
145 0.23
146 0.29
147 0.33
148 0.4
149 0.44
150 0.46
151 0.51
152 0.56
153 0.49
154 0.41
155 0.39
156 0.33
157 0.33
158 0.31
159 0.26
160 0.2
161 0.2
162 0.19
163 0.16
164 0.18
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.09
198 0.12
199 0.2
200 0.25
201 0.31
202 0.37
203 0.46
204 0.51
205 0.54
206 0.58
207 0.61
208 0.65
209 0.63
210 0.6
211 0.53
212 0.47
213 0.41
214 0.34
215 0.24
216 0.16
217 0.15
218 0.13
219 0.15
220 0.17
221 0.18
222 0.19
223 0.19
224 0.19
225 0.24
226 0.32
227 0.34
228 0.38
229 0.44
230 0.46
231 0.5
232 0.5
233 0.44
234 0.36
235 0.3
236 0.26
237 0.2
238 0.17
239 0.17
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.04
287 0.03
288 0.04
289 0.05
290 0.06
291 0.12
292 0.16
293 0.2
294 0.28
295 0.38
296 0.48
297 0.58
298 0.66
299 0.71
300 0.79
301 0.83
302 0.85
303 0.84
304 0.8
305 0.78
306 0.75
307 0.74
308 0.66
309 0.62
310 0.52
311 0.44
312 0.38
313 0.29
314 0.24
315 0.15
316 0.11
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.06
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.16
347 0.18
348 0.22
349 0.22
350 0.2
351 0.25
352 0.29
353 0.33
354 0.33
355 0.3
356 0.27
357 0.25
358 0.22
359 0.17
360 0.17
361 0.22
362 0.21
363 0.3
364 0.3
365 0.32
366 0.33
367 0.32
368 0.31
369 0.21
370 0.21
371 0.13
372 0.12
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.06
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.09
381 0.17
382 0.17
383 0.23
384 0.24
385 0.27
386 0.31
387 0.32
388 0.29
389 0.22
390 0.23
391 0.18
392 0.18
393 0.15
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.14
398 0.14
399 0.16
400 0.16
401 0.17
402 0.2
403 0.22
404 0.22
405 0.18
406 0.22
407 0.24
408 0.24
409 0.24
410 0.21
411 0.2
412 0.25
413 0.25
414 0.23
415 0.19
416 0.23
417 0.25
418 0.26
419 0.25
420 0.2
421 0.21
422 0.19
423 0.18
424 0.13
425 0.11
426 0.09
427 0.14
428 0.14
429 0.15
430 0.17
431 0.18
432 0.18
433 0.22
434 0.23
435 0.23
436 0.25
437 0.24
438 0.28
439 0.31
440 0.32
441 0.31
442 0.31
443 0.26
444 0.28
445 0.31
446 0.25
447 0.23
448 0.24
449 0.21
450 0.21
451 0.21
452 0.17
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.19
457 0.25
458 0.32
459 0.37
460 0.39
461 0.42
462 0.43
463 0.44
464 0.4
465 0.38
466 0.34
467 0.31
468 0.31
469 0.29
470 0.28
471 0.25
472 0.22
473 0.18
474 0.19
475 0.24
476 0.24
477 0.29
478 0.32
479 0.35
480 0.41
481 0.46
482 0.5
483 0.53
484 0.56
485 0.51
486 0.48
487 0.49
488 0.45
489 0.39
490 0.31
491 0.22
492 0.16
493 0.14
494 0.13
495 0.09
496 0.07
497 0.05
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.1
508 0.15
509 0.15
510 0.18
511 0.2
512 0.2
513 0.24
514 0.25
515 0.23
516 0.2
517 0.21
518 0.22
519 0.23
520 0.25
521 0.23
522 0.24
523 0.22
524 0.2
525 0.2
526 0.15
527 0.14
528 0.13
529 0.15
530 0.15
531 0.18
532 0.21
533 0.25
534 0.28
535 0.28
536 0.31
537 0.34
538 0.36
539 0.35
540 0.4
541 0.41
542 0.45
543 0.47
544 0.45
545 0.41
546 0.4
547 0.41
548 0.35
549 0.29
550 0.24
551 0.2
552 0.17
553 0.14
554 0.11
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.1
562 0.16
563 0.19
564 0.21
565 0.28
566 0.33
567 0.42
568 0.45
569 0.48
570 0.5
571 0.55
572 0.6
573 0.56
574 0.56
575 0.52
576 0.49
577 0.44
578 0.42
579 0.38
580 0.32
581 0.35
582 0.3
583 0.32
584 0.35
585 0.36
586 0.39
587 0.42
588 0.45
589 0.42
590 0.41
591 0.37
592 0.37
593 0.34
594 0.28
595 0.24
596 0.24
597 0.25
598 0.24
599 0.2
600 0.17
601 0.16
602 0.13
603 0.12
604 0.11
605 0.09
606 0.09
607 0.1
608 0.13
609 0.15
610 0.17
611 0.16
612 0.15
613 0.16
614 0.19
615 0.23
616 0.24
617 0.26
618 0.31
619 0.34
620 0.35
621 0.33
622 0.31
623 0.28
624 0.28
625 0.28
626 0.24
627 0.23
628 0.21
629 0.23
630 0.25
631 0.24
632 0.22
633 0.22
634 0.28
635 0.31
636 0.34
637 0.33
638 0.35
639 0.37
640 0.41
641 0.4
642 0.38
643 0.34
644 0.32
645 0.32
646 0.28
647 0.28
648 0.26
649 0.26
650 0.23
651 0.24
652 0.24
653 0.25
654 0.27
655 0.27
656 0.26
657 0.27
658 0.27
659 0.27
660 0.26
661 0.24
662 0.23
663 0.23
664 0.21
665 0.18
666 0.16
667 0.16
668 0.17
669 0.22
670 0.22
671 0.18
672 0.19
673 0.19
674 0.2
675 0.18
676 0.19
677 0.14
678 0.14
679 0.15
680 0.15
681 0.15
682 0.15
683 0.15
684 0.14
685 0.16
686 0.17
687 0.2
688 0.25
689 0.24
690 0.24
691 0.25
692 0.25
693 0.27
694 0.27
695 0.27
696 0.23
697 0.25
698 0.23
699 0.22
700 0.22
701 0.19
702 0.19
703 0.18
704 0.19
705 0.19
706 0.2
707 0.22
708 0.27
709 0.3
710 0.32
711 0.35
712 0.4
713 0.43
714 0.43
715 0.48
716 0.52
717 0.52
718 0.56
719 0.53
720 0.47
721 0.42
722 0.4
723 0.35
724 0.27
725 0.21