Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A178BBP3

Protein Details
Accession A0A178BBP3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
301-323TVAKHAKPRKGGRRGKRKAEDSNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-318KHAKPRKGGRRGKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MSAQHQARRSTSRTAPDAHSETTHTNKTDATPNGEQADPSSAVTPSQPSAPSAATVEEAAMLSALSAPSVAMVPPPAVDAVPGDYEDIADNGSSSLSELGDASDDQSEPTPRPTTALDMDDDDSEAETERLENTPRKLARTATDTSLASEALYTRTPSKLVHSRTVDQEESAPPTPSVITDDVTLDEAADAENPLHSLSLIAASEAASLEYVGKKRKRTSEVGSPVEEQEEDEPARKRSGTAKSPAPNGLLSSANDSGEQVDADEELEGAEERLSQLAHEEIDLEERQANIATEMVGELATVAKHAKPRKGGRRGKRKAEDSNDAFTEQFNGLDAQDGEGEDDHDEEVSAALDEELGKKKKAIDDLVPIQEKFKILQHKFVDENLAVAERELQMLKQPNCIHPEYLLMMKSIDERRADKIAYETKLLEYKRENLEIITAAERHQMHSQYFQTVRHVREGILEECNQRVYELQKGRRSLGCDDTQYMIKLPEKRSDQIRQQTAYNLEVSVLSGVAKYVGFPAAPDIRPARPVDIDDDFRAMKIATRAAPPPSFRTYNRTTTADEAAAETQFLESTPWANPRHPSHQEARFGPSRAPAYQTPAGQRRVVDLTAPNGSASTIEATSNPPSANAPNSNGRMGESESPVLQMKRHPAYQAAYSETPGSHSRNVGVLGREPYTMLSSPAAQHMEAPVDEQGGQRWGGNIRPMMGTPNTTAAGPPGPGRSDQTRVPMTHRNGIGVGDGLFGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.54
3 0.56
4 0.56
5 0.5
6 0.45
7 0.4
8 0.41
9 0.42
10 0.43
11 0.36
12 0.33
13 0.32
14 0.34
15 0.39
16 0.38
17 0.39
18 0.37
19 0.4
20 0.42
21 0.41
22 0.37
23 0.31
24 0.32
25 0.25
26 0.22
27 0.2
28 0.17
29 0.17
30 0.18
31 0.19
32 0.15
33 0.18
34 0.18
35 0.17
36 0.2
37 0.2
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.07
48 0.06
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.04
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.13
94 0.15
95 0.15
96 0.2
97 0.21
98 0.2
99 0.22
100 0.23
101 0.25
102 0.27
103 0.27
104 0.24
105 0.24
106 0.25
107 0.23
108 0.22
109 0.17
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.1
118 0.14
119 0.19
120 0.21
121 0.3
122 0.32
123 0.36
124 0.37
125 0.39
126 0.39
127 0.4
128 0.4
129 0.34
130 0.36
131 0.33
132 0.31
133 0.29
134 0.24
135 0.18
136 0.15
137 0.13
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.16
145 0.23
146 0.29
147 0.33
148 0.4
149 0.44
150 0.46
151 0.51
152 0.56
153 0.49
154 0.41
155 0.39
156 0.33
157 0.33
158 0.31
159 0.26
160 0.2
161 0.2
162 0.19
163 0.16
164 0.18
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.09
198 0.12
199 0.2
200 0.25
201 0.31
202 0.37
203 0.46
204 0.51
205 0.54
206 0.58
207 0.61
208 0.65
209 0.63
210 0.6
211 0.53
212 0.47
213 0.41
214 0.34
215 0.24
216 0.16
217 0.15
218 0.13
219 0.15
220 0.17
221 0.18
222 0.19
223 0.19
224 0.19
225 0.24
226 0.32
227 0.34
228 0.38
229 0.44
230 0.46
231 0.5
232 0.5
233 0.44
234 0.36
235 0.3
236 0.26
237 0.2
238 0.17
239 0.17
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.04
287 0.03
288 0.04
289 0.05
290 0.06
291 0.12
292 0.16
293 0.2
294 0.28
295 0.38
296 0.48
297 0.58
298 0.66
299 0.71
300 0.79
301 0.83
302 0.85
303 0.84
304 0.8
305 0.78
306 0.75
307 0.74
308 0.66
309 0.62
310 0.52
311 0.44
312 0.38
313 0.29
314 0.24
315 0.15
316 0.11
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.06
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.16
347 0.18
348 0.22
349 0.22
350 0.2
351 0.25
352 0.29
353 0.33
354 0.33
355 0.3
356 0.27
357 0.25
358 0.22
359 0.17
360 0.17
361 0.22
362 0.21
363 0.3
364 0.3
365 0.32
366 0.33
367 0.32
368 0.31
369 0.21
370 0.21
371 0.13
372 0.12
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.06
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.09
381 0.17
382 0.17
383 0.23
384 0.24
385 0.27
386 0.31
387 0.32
388 0.29
389 0.22
390 0.23
391 0.18
392 0.18
393 0.15
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.14
398 0.14
399 0.16
400 0.16
401 0.17
402 0.2
403 0.22
404 0.22
405 0.18
406 0.22
407 0.24
408 0.24
409 0.24
410 0.21
411 0.2
412 0.25
413 0.25
414 0.23
415 0.19
416 0.23
417 0.25
418 0.26
419 0.25
420 0.2
421 0.21
422 0.19
423 0.18
424 0.13
425 0.11
426 0.09
427 0.14
428 0.14
429 0.15
430 0.17
431 0.18
432 0.18
433 0.22
434 0.23
435 0.23
436 0.25
437 0.24
438 0.28
439 0.31
440 0.32
441 0.31
442 0.31
443 0.26
444 0.28
445 0.31
446 0.25
447 0.23
448 0.24
449 0.21
450 0.21
451 0.21
452 0.17
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.19
457 0.25
458 0.32
459 0.37
460 0.39
461 0.42
462 0.43
463 0.44
464 0.4
465 0.38
466 0.34
467 0.31
468 0.31
469 0.29
470 0.28
471 0.25
472 0.22
473 0.18
474 0.19
475 0.24
476 0.24
477 0.29
478 0.32
479 0.35
480 0.41
481 0.46
482 0.5
483 0.53
484 0.56
485 0.51
486 0.48
487 0.49
488 0.45
489 0.39
490 0.31
491 0.22
492 0.16
493 0.14
494 0.13
495 0.09
496 0.07
497 0.05
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.1
508 0.15
509 0.15
510 0.18
511 0.2
512 0.2
513 0.24
514 0.25
515 0.23
516 0.2
517 0.21
518 0.22
519 0.23
520 0.25
521 0.23
522 0.24
523 0.22
524 0.2
525 0.2
526 0.15
527 0.14
528 0.13
529 0.15
530 0.15
531 0.18
532 0.21
533 0.25
534 0.28
535 0.28
536 0.31
537 0.34
538 0.36
539 0.35
540 0.4
541 0.41
542 0.45
543 0.47
544 0.45
545 0.41
546 0.4
547 0.41
548 0.35
549 0.29
550 0.24
551 0.2
552 0.17
553 0.14
554 0.11
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.1
562 0.16
563 0.19
564 0.21
565 0.28
566 0.33
567 0.42
568 0.45
569 0.48
570 0.5
571 0.55
572 0.6
573 0.56
574 0.56
575 0.52
576 0.49
577 0.44
578 0.42
579 0.38
580 0.32
581 0.35
582 0.3
583 0.32
584 0.35
585 0.36
586 0.39
587 0.42
588 0.45
589 0.42
590 0.41
591 0.37
592 0.37
593 0.34
594 0.28
595 0.24
596 0.24
597 0.25
598 0.24
599 0.2
600 0.17
601 0.16
602 0.13
603 0.12
604 0.11
605 0.09
606 0.09
607 0.1
608 0.13
609 0.15
610 0.17
611 0.16
612 0.15
613 0.16
614 0.19
615 0.23
616 0.24
617 0.26
618 0.31
619 0.34
620 0.35
621 0.33
622 0.31
623 0.28
624 0.28
625 0.28
626 0.24
627 0.23
628 0.21
629 0.23
630 0.25
631 0.24
632 0.22
633 0.22
634 0.28
635 0.31
636 0.34
637 0.33
638 0.35
639 0.37
640 0.41
641 0.4
642 0.38
643 0.34
644 0.32
645 0.32
646 0.28
647 0.28
648 0.26
649 0.26
650 0.23
651 0.24
652 0.24
653 0.25
654 0.27
655 0.27
656 0.26
657 0.27
658 0.27
659 0.27
660 0.26
661 0.24
662 0.23
663 0.23
664 0.21
665 0.18
666 0.16
667 0.16
668 0.17
669 0.22
670 0.22
671 0.18
672 0.19
673 0.19
674 0.2
675 0.18
676 0.19
677 0.14
678 0.14
679 0.15
680 0.15
681 0.15
682 0.15
683 0.15
684 0.14
685 0.16
686 0.17
687 0.2
688 0.25
689 0.24
690 0.24
691 0.25
692 0.25
693 0.27
694 0.27
695 0.27
696 0.23
697 0.25
698 0.23
699 0.22
700 0.22
701 0.19
702 0.19
703 0.18
704 0.19
705 0.19
706 0.2
707 0.22
708 0.27
709 0.3
710 0.32
711 0.35
712 0.4
713 0.43
714 0.43
715 0.48
716 0.52
717 0.52
718 0.56
719 0.53
720 0.47
721 0.42
722 0.4
723 0.35
724 0.27
725 0.21