Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0WG39

Protein Details
Accession G0WG39    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-66VQQYTKCTHRDRSRHNAKGKTQSHHydrophilic
80-101ELNRLKKTPKPLLKNKEKKVKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-99KKTPKPLLKNKEKKV
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.999, mito 4.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR017340  U1_snRNP-C  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
KEGG ndi:NDAI_0I01810  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MARYYCEYCHSYLTHDTLSVRKSHLVGKNHIRITADYYRNKNVQQYTKCTHRDRSRHNAKGKTQSHHRSKITKVSDELDELNRLKKTPKPLLKNKEKKVKFQMAKIFQKELNKMGGESMLAKLYDGSPGYSKVFIDSNRLDIGDSVRLNKLPQRANERSSSTMANDNNTGGGNRDRNEVFINNYAQSNSSSSIIEPPRMLSIWSHHNSGTFPKTSIYHEDSKTSILNSTISSSRKRIMMHSHSRPSIPAANASTSGGHNGGGGGGGTIKRRRYGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.29
4 0.29
5 0.31
6 0.29
7 0.26
8 0.26
9 0.26
10 0.33
11 0.39
12 0.41
13 0.47
14 0.54
15 0.6
16 0.59
17 0.59
18 0.53
19 0.46
20 0.48
21 0.48
22 0.47
23 0.45
24 0.48
25 0.53
26 0.54
27 0.55
28 0.55
29 0.53
30 0.55
31 0.54
32 0.57
33 0.57
34 0.62
35 0.68
36 0.66
37 0.68
38 0.68
39 0.72
40 0.73
41 0.77
42 0.79
43 0.8
44 0.84
45 0.83
46 0.8
47 0.81
48 0.79
49 0.75
50 0.74
51 0.75
52 0.76
53 0.77
54 0.75
55 0.7
56 0.69
57 0.7
58 0.66
59 0.6
60 0.53
61 0.46
62 0.42
63 0.38
64 0.36
65 0.28
66 0.27
67 0.23
68 0.25
69 0.23
70 0.22
71 0.22
72 0.24
73 0.31
74 0.37
75 0.45
76 0.5
77 0.6
78 0.7
79 0.79
80 0.85
81 0.85
82 0.85
83 0.8
84 0.78
85 0.77
86 0.77
87 0.69
88 0.66
89 0.67
90 0.66
91 0.71
92 0.65
93 0.59
94 0.51
95 0.52
96 0.47
97 0.4
98 0.34
99 0.26
100 0.23
101 0.2
102 0.18
103 0.13
104 0.12
105 0.1
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.07
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.11
122 0.16
123 0.15
124 0.16
125 0.15
126 0.16
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.16
137 0.21
138 0.21
139 0.26
140 0.33
141 0.36
142 0.39
143 0.43
144 0.43
145 0.39
146 0.37
147 0.33
148 0.25
149 0.27
150 0.25
151 0.22
152 0.2
153 0.17
154 0.16
155 0.15
156 0.13
157 0.1
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.18
162 0.17
163 0.19
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.2
168 0.22
169 0.19
170 0.2
171 0.19
172 0.17
173 0.17
174 0.15
175 0.13
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.18
180 0.19
181 0.19
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.12
188 0.15
189 0.23
190 0.24
191 0.25
192 0.24
193 0.25
194 0.25
195 0.3
196 0.31
197 0.23
198 0.21
199 0.22
200 0.23
201 0.25
202 0.31
203 0.31
204 0.33
205 0.33
206 0.35
207 0.34
208 0.34
209 0.32
210 0.26
211 0.22
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.17
216 0.19
217 0.21
218 0.25
219 0.26
220 0.29
221 0.31
222 0.32
223 0.34
224 0.39
225 0.46
226 0.53
227 0.59
228 0.64
229 0.63
230 0.62
231 0.58
232 0.53
233 0.49
234 0.41
235 0.37
236 0.32
237 0.31
238 0.32
239 0.31
240 0.28
241 0.22
242 0.23
243 0.17
244 0.14
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.08
249 0.08
250 0.05
251 0.07
252 0.09
253 0.15
254 0.2
255 0.23