FuNGI

A0A178BC62

Protein Details

Accession

A0A178BC62

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
125-148	LNGAQDKSAKKRKRGDKEEVEDAY	Hydrophilic
156-180	EEKEEEQRQKKRKTEKPRADDKDEE	Acidic
420-451	FPPMLPRKLRVTRCRAEKKNKKDKPRVALPST	Hydrophilic
511-535	KGSGGGKKKGPNGRKSRSSAWKAKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
132-141	SAKKRKRGDK
158-173	KEEEQRQKKRKTEKPR
428-449	LRVTRCRAEKKNKKDKPRVALP
497-535	HRAKEGQGKSGLKFKGSGGGKKKGPNGRKSRSSAWKAKK

Subcellular Location(s)

nucl 24, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MAKSKDKHAAKSESRQKSDKSFIKVDKKAFDPALSSLFAGPVQAPPKSRYQDRVVKENDEELSELEDAESDDDSEDEAEEEDSEDEAEGGVPLGSDVSSEDDASDAEESSSESEAEAANLKEAMLNGAQDKSAKKRKRGDKEEVEDAYMRKLAREEEKEEEQRQKKRKTEKPRADDKDEEEASDDDQEAPNNFVIPKHETLAAPDDKDAQEIEKAGRTVFLGNVSTDCINSKSAEKALKKHLESFIADLADNNPPHKIESIRYRSTAFDNSLPKRAAFAKKEIMDATTRSTNAYAVYTTKVAAREAVKKLNGTVLLKRHLHVDSVAHPTKVEHRRCVFVGNLPFVDDESQTPTKDGEKKSKKPASDVEEGLWTHFAKAGKIESVRVVRDAATRVGKGFAYVQFYDENGVEAALQFNEQKFPPMLPRKLRVTRCRAEKKNKKDKPRVALPSTDRKANGKAGYVAKLSDEQKSMQGRARSMLGKVAKAQSKEGFVFEGHRAKEGQGKSGLKFKGSGGGKKKGPNGRKSRSSAWKAKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.77
3	0.73
4	0.71
5	0.73
6	0.7
7	0.67
8	0.66
9	0.69
10	0.74
11	0.76
12	0.74
13	0.7
14	0.66
15	0.65
16	0.58
17	0.5
18	0.43
19	0.38
20	0.35
21	0.3
22	0.27
23	0.2
24	0.19
25	0.17
26	0.15
27	0.13
28	0.14
29	0.17
30	0.19
31	0.22
32	0.24
33	0.33
34	0.39
35	0.44
36	0.45
37	0.51
38	0.57
39	0.59
40	0.66
41	0.62
42	0.6
43	0.57
44	0.55
45	0.47
46	0.39
47	0.35
48	0.26
49	0.24
50	0.19
51	0.17
52	0.12
53	0.11
54	0.1
55	0.1
56	0.09
57	0.07
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.06
64	0.07
65	0.07
66	0.06
67	0.07
68	0.08
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.05
76	0.05
77	0.04
78	0.04
79	0.04
80	0.04
81	0.04
82	0.04
83	0.05
84	0.08
85	0.09
86	0.09
87	0.09
88	0.09
89	0.09
90	0.1
91	0.1
92	0.07
93	0.06
94	0.06
95	0.07
96	0.08
97	0.09
98	0.08
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.08
103	0.1
104	0.09
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.09
110	0.1
111	0.08
112	0.09
113	0.1
114	0.1
115	0.11
116	0.13
117	0.15
118	0.23
119	0.32
120	0.38
121	0.46
122	0.55
123	0.65
124	0.74
125	0.8
126	0.82
127	0.82
128	0.82
129	0.81
130	0.72
131	0.64
132	0.55
133	0.47
134	0.38
135	0.3
136	0.23
137	0.16
138	0.16
139	0.17
140	0.23
141	0.28
142	0.3
143	0.33
144	0.41
145	0.45
146	0.48
147	0.54
148	0.54
149	0.58
150	0.63
151	0.66
152	0.67
153	0.72
154	0.77
155	0.79
156	0.83
157	0.84
158	0.84
159	0.87
160	0.86
161	0.82
162	0.77
163	0.7
164	0.68
165	0.57
166	0.48
167	0.39
168	0.32
169	0.26
170	0.22
171	0.18
172	0.1
173	0.1
174	0.11
175	0.09
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.09
181	0.12
182	0.15
183	0.16
184	0.16
185	0.18
186	0.17
187	0.19
188	0.25
189	0.23
190	0.2
191	0.19
192	0.2
193	0.18
194	0.19
195	0.17
196	0.11
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.11
205	0.1
206	0.1
207	0.11
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.1
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.1
218	0.1
219	0.11
220	0.14
221	0.21
222	0.23
223	0.26
224	0.34
225	0.4
226	0.4
227	0.43
228	0.41
229	0.37
230	0.36
231	0.33
232	0.26
233	0.2
234	0.19
235	0.14
236	0.14
237	0.15
238	0.14
239	0.13
240	0.12
241	0.11
242	0.12
243	0.13
244	0.13
245	0.13
246	0.22
247	0.29
248	0.31
249	0.32
250	0.33
251	0.33
252	0.34
253	0.33
254	0.25
255	0.23
256	0.28
257	0.28
258	0.32
259	0.31
260	0.28
261	0.27
262	0.31
263	0.32
264	0.28
265	0.3
266	0.32
267	0.32
268	0.34
269	0.32
270	0.28
271	0.22
272	0.21
273	0.2
274	0.15
275	0.15
276	0.14
277	0.14
278	0.13
279	0.12
280	0.12
281	0.09
282	0.08
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.11
287	0.11
288	0.1
289	0.13
290	0.15
291	0.2
292	0.23
293	0.27
294	0.26
295	0.26
296	0.26
297	0.26
298	0.25
299	0.21
300	0.22
301	0.22
302	0.26
303	0.27
304	0.27
305	0.28
306	0.25
307	0.24
308	0.21
309	0.19
310	0.17
311	0.25
312	0.26
313	0.22
314	0.22
315	0.22
316	0.3
317	0.37
318	0.37
319	0.36
320	0.37
321	0.41
322	0.41
323	0.43
324	0.35
325	0.32
326	0.33
327	0.27
328	0.25
329	0.23
330	0.22
331	0.2
332	0.19
333	0.14
334	0.1
335	0.14
336	0.16
337	0.15
338	0.16
339	0.16
340	0.21
341	0.27
342	0.31
343	0.35
344	0.44
345	0.51
346	0.61
347	0.66
348	0.62
349	0.61
350	0.64
351	0.6
352	0.56
353	0.5
354	0.41
355	0.39
356	0.38
357	0.33
358	0.27
359	0.2
360	0.14
361	0.16
362	0.15
363	0.11
364	0.13
365	0.14
366	0.17
367	0.17
368	0.18
369	0.2
370	0.23
371	0.24
372	0.23
373	0.22
374	0.19
375	0.21
376	0.22
377	0.22
378	0.21
379	0.21
380	0.21
381	0.22
382	0.2
383	0.18
384	0.19
385	0.17
386	0.19
387	0.19
388	0.2
389	0.19
390	0.19
391	0.2
392	0.16
393	0.15
394	0.09
395	0.09
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.06
400	0.07
401	0.08
402	0.08
403	0.11
404	0.11
405	0.15
406	0.14
407	0.16
408	0.25
409	0.33
410	0.41
411	0.45
412	0.51
413	0.57
414	0.66
415	0.73
416	0.73
417	0.73
418	0.74
419	0.78
420	0.82
421	0.83
422	0.85
423	0.86
424	0.88
425	0.9
426	0.9
427	0.9
428	0.91
429	0.9
430	0.88
431	0.88
432	0.87
433	0.8
434	0.8
435	0.76
436	0.76
437	0.69
438	0.65
439	0.56
440	0.5
441	0.5
442	0.48
443	0.44
444	0.37
445	0.4
446	0.39
447	0.4
448	0.38
449	0.34
450	0.28
451	0.31
452	0.3
453	0.28
454	0.26
455	0.23
456	0.29
457	0.34
458	0.35
459	0.36
460	0.38
461	0.35
462	0.36
463	0.4
464	0.35
465	0.32
466	0.36
467	0.33
468	0.32
469	0.35
470	0.4
471	0.4
472	0.4
473	0.45
474	0.4
475	0.43
476	0.41
477	0.38
478	0.31
479	0.27
480	0.29
481	0.3
482	0.33
483	0.28
484	0.29
485	0.29
486	0.29
487	0.36
488	0.33
489	0.33
490	0.35
491	0.38
492	0.38
493	0.46
494	0.46
495	0.39
496	0.39
497	0.34
498	0.35
499	0.36
500	0.43
501	0.42
502	0.49
503	0.53
504	0.59
505	0.67
506	0.68
507	0.71
508	0.73
509	0.76
510	0.78
511	0.81
512	0.82
513	0.83
514	0.84
515	0.84

A0A178BC62

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer