FuNGI

A0A178AV89

Protein Details

Accession

A0A178AV89

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
70-96	VVIQQFPRKKRLGRPPKNRPPDWNNVE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
77-88	RKKRLGRPPKNR
107-125	IKRKRGRPAGFGRGRPPKG

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 11, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013933 CRC_Rsc7/Swp82
Pfam	View protein in Pfam PF08624 CRC_subunit

Amino Acid Sequences

MARGRPSRAAARRSTPVRSATPQQDSDDDMIDAPESRPDTPKEEEDDAESAAPEIDEEEEAPSERSASPVVIQQFPRKKRLGRPPKNRPPDWNNVEPDNTSEGGTPIKRKRGRPAGFGRGRPPKGGVPQVLRTTIDKEGTTVDVINDEADLPEDEEGEKKVDKDGNLLGGRDYRVRIFTISGRGDRQYMLSTEPARCCGFRDSYLFFTKHLRLHKIIVDDNEKRDLIDRDIIPHSYKGRSIGVVTARSVFREFGARIIIGGKRIIDDYYVADAKAQGAVEGELADPNDRLPPPGEPYNKNQYVAWHGASSVYHTGVPSVPMANGKPLPGKRKVNITSANWQFEHGRAASRFNSNLSALRKANLEGVYDPHTNLMCYPKVTQPTHARWEEVAAEDTEVPPLVRQKYLVVDSYFQQPPFAGLGLPGPDADFIDVGTNGLPVLDAEEIHSMKPDERQAFTYAKQEEMEWRNQWGGEATDGARAKPRIGFVGVPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.62
3	0.6
4	0.58
5	0.57
6	0.59
7	0.58
8	0.6
9	0.58
10	0.55
11	0.51
12	0.48
13	0.44
14	0.37
15	0.29
16	0.22
17	0.19
18	0.16
19	0.15
20	0.12
21	0.15
22	0.15
23	0.17
24	0.21
25	0.24
26	0.29
27	0.32
28	0.37
29	0.38
30	0.4
31	0.39
32	0.38
33	0.36
34	0.32
35	0.27
36	0.22
37	0.17
38	0.13
39	0.12
40	0.08
41	0.07
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.11
50	0.12
51	0.12
52	0.13
53	0.12
54	0.12
55	0.12
56	0.16
57	0.2
58	0.24
59	0.27
60	0.35
61	0.44
62	0.48
63	0.54
64	0.56
65	0.59
66	0.63
67	0.72
68	0.74
69	0.75
70	0.82
71	0.85
72	0.9
73	0.93
74	0.88
75	0.86
76	0.83
77	0.83
78	0.79
79	0.75
80	0.69
81	0.62
82	0.59
83	0.5
84	0.45
85	0.37
86	0.3
87	0.23
88	0.19
89	0.16
90	0.18
91	0.21
92	0.26
93	0.29
94	0.38
95	0.44
96	0.48
97	0.58
98	0.65
99	0.67
100	0.69
101	0.72
102	0.73
103	0.74
104	0.73
105	0.71
106	0.7
107	0.67
108	0.59
109	0.53
110	0.47
111	0.46
112	0.49
113	0.46
114	0.41
115	0.45
116	0.47
117	0.45
118	0.41
119	0.36
120	0.33
121	0.31
122	0.27
123	0.21
124	0.19
125	0.19
126	0.18
127	0.17
128	0.14
129	0.11
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.07
134	0.06
135	0.05
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.07
143	0.08
144	0.09
145	0.1
146	0.1
147	0.14
148	0.16
149	0.16
150	0.19
151	0.19
152	0.24
153	0.24
154	0.24
155	0.21
156	0.2
157	0.21
158	0.2
159	0.2
160	0.14
161	0.14
162	0.15
163	0.15
164	0.14
165	0.16
166	0.22
167	0.23
168	0.24
169	0.25
170	0.25
171	0.25
172	0.23
173	0.22
174	0.16
175	0.14
176	0.14
177	0.16
178	0.17
179	0.2
180	0.2
181	0.22
182	0.21
183	0.21
184	0.21
185	0.21
186	0.21
187	0.2
188	0.23
189	0.23
190	0.27
191	0.31
192	0.29
193	0.26
194	0.28
195	0.3
196	0.3
197	0.32
198	0.32
199	0.29
200	0.32
201	0.34
202	0.33
203	0.31
204	0.3
205	0.33
206	0.31
207	0.31
208	0.31
209	0.28
210	0.24
211	0.24
212	0.22
213	0.17
214	0.2
215	0.18
216	0.19
217	0.21
218	0.22
219	0.2
220	0.2
221	0.2
222	0.16
223	0.17
224	0.15
225	0.15
226	0.14
227	0.14
228	0.15
229	0.16
230	0.16
231	0.16
232	0.16
233	0.15
234	0.15
235	0.16
236	0.12
237	0.1
238	0.12
239	0.12
240	0.1
241	0.12
242	0.11
243	0.1
244	0.12
245	0.12
246	0.1
247	0.1
248	0.09
249	0.08
250	0.09
251	0.09
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.1
262	0.08
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.05
267	0.06
268	0.06
269	0.05
270	0.05
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.08
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.16
280	0.23
281	0.28
282	0.28
283	0.34
284	0.43
285	0.44
286	0.43
287	0.39
288	0.34
289	0.34
290	0.34
291	0.29
292	0.19
293	0.18
294	0.17
295	0.17
296	0.17
297	0.13
298	0.11
299	0.1
300	0.1
301	0.11
302	0.1
303	0.11
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.1
308	0.1
309	0.13
310	0.13
311	0.14
312	0.2
313	0.23
314	0.29
315	0.35
316	0.41
317	0.4
318	0.49
319	0.52
320	0.53
321	0.55
322	0.54
323	0.55
324	0.54
325	0.56
326	0.46
327	0.44
328	0.37
329	0.31
330	0.31
331	0.22
332	0.22
333	0.18
334	0.22
335	0.24
336	0.26
337	0.26
338	0.24
339	0.26
340	0.22
341	0.27
342	0.26
343	0.29
344	0.26
345	0.27
346	0.26
347	0.24
348	0.28
349	0.23
350	0.22
351	0.17
352	0.2
353	0.23
354	0.23
355	0.22
356	0.2
357	0.19
358	0.17
359	0.18
360	0.2
361	0.16
362	0.17
363	0.2
364	0.23
365	0.31
366	0.32
367	0.39
368	0.43
369	0.48
370	0.55
371	0.54
372	0.5
373	0.42
374	0.44
375	0.38
376	0.31
377	0.25
378	0.17
379	0.17
380	0.16
381	0.16
382	0.13
383	0.12
384	0.09
385	0.09
386	0.15
387	0.16
388	0.16
389	0.17
390	0.19
391	0.24
392	0.27
393	0.3
394	0.26
395	0.26
396	0.26
397	0.33
398	0.34
399	0.28
400	0.26
401	0.21
402	0.21
403	0.21
404	0.2
405	0.12
406	0.09
407	0.12
408	0.13
409	0.13
410	0.11
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.11
415	0.08
416	0.07
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.04
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.08
430	0.13
431	0.14
432	0.14
433	0.16
434	0.16
435	0.17
436	0.22
437	0.29
438	0.28
439	0.31
440	0.34
441	0.36
442	0.39
443	0.4
444	0.43
445	0.36
446	0.34
447	0.32
448	0.3
449	0.35
450	0.36
451	0.42
452	0.36
453	0.37
454	0.37
455	0.36
456	0.36
457	0.29
458	0.25
459	0.19
460	0.2
461	0.18
462	0.23
463	0.24
464	0.24
465	0.28
466	0.27
467	0.28
468	0.29
469	0.31
470	0.28
471	0.3

A0A178AV89

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer