Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B6J2

Protein Details
Accession A0A178B6J2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-48SCDQPSGKSRTNKSNKANEVPEHydrophilic
923-951LHLEQAKTSNKKPRKDRNRRTWDDRLEEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
933-940KKPRKDRN
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013633  NRDE-2  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08424  NRDE-2  
Amino Acid Sequences MASNIPKFASFRPKPKVAPEPTAETQSCDQPSGKSRTNKSNKANEVPETKANIVQSKLYFSDRRGDADVLRYGSLNRSDIPPYRRIGYGYVLGLSLDQKIDRERSSQNKIYVTPATRQRQERLLTSKHAPKDGTRMLRVVRPEGKQYVNEGDDFIPVSSGRKRRRDSREYLEGETPALDYRGIGRDAQQALDPDTQYDSDTEDTSIVAELTKKNSELLRHTRECPHDVEAWLNFIEYQEAMLAFDRFELNETLRQRLADVRIPIYEEALKNVRSDHHTILYLGLLREAQWSWNAVKVSSKFAEVLVKQPASPVLWLKYLDFVQSSFKEFKYESCRETFRHCLSSFLAAAKGADAGIILHVIIRMTVMIHEAGYQELALAIWQAILELHVIDKPAMGANEAQPLSEFEQYWETETPRIGELGASGWRKPPSEFRSPNNATLRSHDPSTSVFDTFQIHETEAIEKLRYPGRTTDQAGEEDAFHMIFFTDIEDYLKFIPAQTPSALLVEAFLCFCGLPPLPRIADHQRAWWNDTFLSHVYKQTSVESPTGRRASLLVNGVARYSAYDTTSMQITTDLLFDCAFSLKSVRLSTDFVRRVLKLVATERANEEIFGEYLLAFESRHYPTEVVKTAKQLLKARPTSQRLYHAYGLVELHRNKLDKANQVFSMALSMDGMGSLASMMLLHGWVWTALLTGDEVQALWRLVSHNGKISTKQGGSVRPSNDRLQDVRLAISDICEKALLRQDFQTAVIGTSLLALLTYLSKFRDAEASLAVHRGLCQWFTSHNISTCAYAELNAQAIARFLTYHVSQAAIVKPALIRSAIEPLIEKFPSNTILLSLYAANEARFAIDDRVRGIMHQNSLQSSDATSVAGWSFAIHYETLRGEVGGSTSHSIRALYKRATNQDSSGAHSPVLWMSYVRFEILQLHLEQAKTSNKKPRKDRNRRTWDDRLEEAETRVKETFYAGLRSLPWCKSFVMLAFTDAKSVFDEEELWKLYKVMQEKELRIYVELD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.7
3 0.74
4 0.7
5 0.71
6 0.66
7 0.66
8 0.62
9 0.65
10 0.56
11 0.5
12 0.46
13 0.44
14 0.41
15 0.35
16 0.33
17 0.31
18 0.39
19 0.43
20 0.49
21 0.5
22 0.56
23 0.64
24 0.73
25 0.78
26 0.79
27 0.81
28 0.81
29 0.81
30 0.79
31 0.75
32 0.7
33 0.65
34 0.62
35 0.56
36 0.5
37 0.44
38 0.42
39 0.4
40 0.36
41 0.36
42 0.32
43 0.31
44 0.32
45 0.35
46 0.35
47 0.32
48 0.4
49 0.36
50 0.39
51 0.39
52 0.38
53 0.35
54 0.37
55 0.4
56 0.33
57 0.31
58 0.28
59 0.25
60 0.27
61 0.29
62 0.25
63 0.21
64 0.23
65 0.28
66 0.35
67 0.39
68 0.39
69 0.39
70 0.4
71 0.4
72 0.39
73 0.36
74 0.33
75 0.32
76 0.28
77 0.25
78 0.22
79 0.2
80 0.19
81 0.17
82 0.14
83 0.11
84 0.1
85 0.11
86 0.16
87 0.21
88 0.22
89 0.26
90 0.33
91 0.4
92 0.49
93 0.54
94 0.55
95 0.55
96 0.54
97 0.54
98 0.53
99 0.48
100 0.46
101 0.49
102 0.52
103 0.55
104 0.59
105 0.58
106 0.59
107 0.6
108 0.6
109 0.58
110 0.55
111 0.53
112 0.56
113 0.6
114 0.56
115 0.57
116 0.51
117 0.46
118 0.5
119 0.53
120 0.53
121 0.48
122 0.47
123 0.45
124 0.48
125 0.48
126 0.46
127 0.44
128 0.4
129 0.44
130 0.45
131 0.46
132 0.43
133 0.44
134 0.43
135 0.37
136 0.35
137 0.31
138 0.26
139 0.23
140 0.22
141 0.18
142 0.12
143 0.11
144 0.14
145 0.19
146 0.27
147 0.36
148 0.44
149 0.51
150 0.6
151 0.7
152 0.76
153 0.77
154 0.78
155 0.79
156 0.74
157 0.72
158 0.65
159 0.55
160 0.46
161 0.38
162 0.29
163 0.19
164 0.15
165 0.11
166 0.08
167 0.1
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.16
172 0.23
173 0.24
174 0.25
175 0.24
176 0.21
177 0.24
178 0.27
179 0.25
180 0.19
181 0.19
182 0.19
183 0.18
184 0.16
185 0.15
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.07
195 0.09
196 0.1
197 0.14
198 0.16
199 0.16
200 0.19
201 0.21
202 0.25
203 0.31
204 0.38
205 0.44
206 0.46
207 0.5
208 0.55
209 0.57
210 0.55
211 0.5
212 0.44
213 0.39
214 0.35
215 0.35
216 0.28
217 0.26
218 0.23
219 0.2
220 0.16
221 0.12
222 0.12
223 0.08
224 0.08
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.09
235 0.1
236 0.11
237 0.17
238 0.19
239 0.21
240 0.22
241 0.22
242 0.21
243 0.24
244 0.26
245 0.26
246 0.27
247 0.25
248 0.25
249 0.27
250 0.26
251 0.23
252 0.23
253 0.18
254 0.19
255 0.21
256 0.21
257 0.19
258 0.2
259 0.22
260 0.22
261 0.27
262 0.26
263 0.25
264 0.25
265 0.25
266 0.25
267 0.23
268 0.2
269 0.16
270 0.13
271 0.1
272 0.09
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.11
278 0.11
279 0.16
280 0.16
281 0.14
282 0.19
283 0.2
284 0.25
285 0.23
286 0.24
287 0.2
288 0.2
289 0.26
290 0.21
291 0.24
292 0.24
293 0.24
294 0.22
295 0.23
296 0.23
297 0.18
298 0.19
299 0.18
300 0.14
301 0.16
302 0.17
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.15
308 0.13
309 0.16
310 0.16
311 0.2
312 0.19
313 0.19
314 0.21
315 0.21
316 0.26
317 0.29
318 0.32
319 0.31
320 0.34
321 0.37
322 0.36
323 0.42
324 0.44
325 0.39
326 0.42
327 0.39
328 0.37
329 0.35
330 0.37
331 0.32
332 0.25
333 0.21
334 0.14
335 0.14
336 0.11
337 0.1
338 0.06
339 0.05
340 0.04
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.14
386 0.14
387 0.13
388 0.12
389 0.14
390 0.16
391 0.16
392 0.15
393 0.11
394 0.14
395 0.14
396 0.16
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.14
401 0.14
402 0.12
403 0.12
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.15
412 0.17
413 0.18
414 0.19
415 0.26
416 0.27
417 0.37
418 0.41
419 0.42
420 0.51
421 0.53
422 0.59
423 0.55
424 0.52
425 0.42
426 0.42
427 0.43
428 0.35
429 0.33
430 0.26
431 0.21
432 0.2
433 0.25
434 0.22
435 0.17
436 0.15
437 0.15
438 0.17
439 0.17
440 0.17
441 0.13
442 0.11
443 0.11
444 0.12
445 0.12
446 0.12
447 0.11
448 0.09
449 0.09
450 0.11
451 0.14
452 0.14
453 0.15
454 0.17
455 0.21
456 0.25
457 0.27
458 0.28
459 0.26
460 0.26
461 0.25
462 0.22
463 0.18
464 0.13
465 0.11
466 0.08
467 0.06
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.03
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.06
479 0.07
480 0.06
481 0.06
482 0.09
483 0.09
484 0.11
485 0.1
486 0.11
487 0.1
488 0.11
489 0.1
490 0.08
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.08
503 0.1
504 0.11
505 0.12
506 0.16
507 0.2
508 0.27
509 0.27
510 0.31
511 0.34
512 0.35
513 0.38
514 0.34
515 0.3
516 0.23
517 0.22
518 0.2
519 0.15
520 0.17
521 0.15
522 0.16
523 0.16
524 0.16
525 0.17
526 0.17
527 0.18
528 0.16
529 0.19
530 0.18
531 0.19
532 0.25
533 0.25
534 0.23
535 0.21
536 0.19
537 0.18
538 0.2
539 0.19
540 0.15
541 0.14
542 0.14
543 0.14
544 0.13
545 0.11
546 0.08
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.09
553 0.1
554 0.1
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.07
569 0.07
570 0.1
571 0.1
572 0.11
573 0.12
574 0.15
575 0.17
576 0.26
577 0.27
578 0.26
579 0.28
580 0.27
581 0.27
582 0.26
583 0.24
584 0.18
585 0.19
586 0.22
587 0.2
588 0.21
589 0.21
590 0.22
591 0.21
592 0.18
593 0.16
594 0.11
595 0.1
596 0.09
597 0.08
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.05
602 0.04
603 0.05
604 0.09
605 0.1
606 0.11
607 0.12
608 0.13
609 0.15
610 0.2
611 0.24
612 0.23
613 0.23
614 0.25
615 0.3
616 0.32
617 0.36
618 0.36
619 0.38
620 0.44
621 0.47
622 0.49
623 0.51
624 0.54
625 0.53
626 0.51
627 0.53
628 0.48
629 0.49
630 0.46
631 0.39
632 0.34
633 0.31
634 0.28
635 0.22
636 0.24
637 0.19
638 0.19
639 0.2
640 0.21
641 0.21
642 0.27
643 0.3
644 0.33
645 0.37
646 0.38
647 0.36
648 0.36
649 0.35
650 0.28
651 0.24
652 0.16
653 0.11
654 0.07
655 0.06
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.03
660 0.03
661 0.02
662 0.02
663 0.02
664 0.02
665 0.02
666 0.02
667 0.03
668 0.03
669 0.03
670 0.03
671 0.03
672 0.03
673 0.03
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.07
684 0.07
685 0.06
686 0.06
687 0.07
688 0.12
689 0.16
690 0.17
691 0.21
692 0.24
693 0.26
694 0.27
695 0.28
696 0.3
697 0.27
698 0.3
699 0.28
700 0.3
701 0.34
702 0.39
703 0.39
704 0.39
705 0.43
706 0.42
707 0.43
708 0.41
709 0.37
710 0.34
711 0.35
712 0.3
713 0.27
714 0.23
715 0.21
716 0.17
717 0.17
718 0.16
719 0.13
720 0.12
721 0.12
722 0.11
723 0.13
724 0.22
725 0.21
726 0.2
727 0.21
728 0.23
729 0.23
730 0.24
731 0.23
732 0.15
733 0.14
734 0.13
735 0.11
736 0.09
737 0.08
738 0.07
739 0.04
740 0.04
741 0.03
742 0.04
743 0.05
744 0.06
745 0.07
746 0.08
747 0.1
748 0.1
749 0.11
750 0.15
751 0.15
752 0.16
753 0.17
754 0.18
755 0.17
756 0.18
757 0.17
758 0.13
759 0.12
760 0.14
761 0.13
762 0.12
763 0.12
764 0.12
765 0.14
766 0.19
767 0.23
768 0.24
769 0.25
770 0.27
771 0.27
772 0.27
773 0.26
774 0.23
775 0.18
776 0.15
777 0.14
778 0.12
779 0.12
780 0.12
781 0.11
782 0.09
783 0.09
784 0.09
785 0.08
786 0.07
787 0.06
788 0.1
789 0.1
790 0.12
791 0.12
792 0.12
793 0.13
794 0.16
795 0.17
796 0.16
797 0.15
798 0.15
799 0.15
800 0.15
801 0.16
802 0.13
803 0.11
804 0.11
805 0.16
806 0.16
807 0.16
808 0.16
809 0.17
810 0.22
811 0.22
812 0.2
813 0.16
814 0.17
815 0.19
816 0.19
817 0.16
818 0.12
819 0.13
820 0.14
821 0.14
822 0.12
823 0.1
824 0.12
825 0.12
826 0.11
827 0.1
828 0.1
829 0.09
830 0.09
831 0.11
832 0.14
833 0.16
834 0.17
835 0.18
836 0.21
837 0.21
838 0.2
839 0.24
840 0.24
841 0.25
842 0.27
843 0.28
844 0.26
845 0.29
846 0.29
847 0.23
848 0.19
849 0.17
850 0.14
851 0.13
852 0.11
853 0.1
854 0.09
855 0.09
856 0.08
857 0.07
858 0.07
859 0.08
860 0.09
861 0.08
862 0.09
863 0.11
864 0.12
865 0.13
866 0.13
867 0.12
868 0.11
869 0.11
870 0.11
871 0.1
872 0.11
873 0.12
874 0.12
875 0.13
876 0.13
877 0.14
878 0.18
879 0.24
880 0.29
881 0.31
882 0.37
883 0.44
884 0.52
885 0.56
886 0.54
887 0.49
888 0.51
889 0.47
890 0.46
891 0.44
892 0.36
893 0.31
894 0.28
895 0.27
896 0.2
897 0.2
898 0.14
899 0.1
900 0.1
901 0.15
902 0.16
903 0.15
904 0.14
905 0.14
906 0.17
907 0.19
908 0.21
909 0.17
910 0.2
911 0.22
912 0.22
913 0.22
914 0.23
915 0.3
916 0.33
917 0.39
918 0.47
919 0.52
920 0.62
921 0.72
922 0.78
923 0.8
924 0.86
925 0.9
926 0.91
927 0.94
928 0.94
929 0.93
930 0.92
931 0.9
932 0.85
933 0.78
934 0.71
935 0.65
936 0.58
937 0.52
938 0.48
939 0.39
940 0.37
941 0.34
942 0.28
943 0.24
944 0.24
945 0.26
946 0.22
947 0.26
948 0.23
949 0.25
950 0.27
951 0.31
952 0.35
953 0.33
954 0.32
955 0.29
956 0.29
957 0.28
958 0.29
959 0.27
960 0.27
961 0.23
962 0.25
963 0.28
964 0.27
965 0.28
966 0.25
967 0.23
968 0.2
969 0.21
970 0.18
971 0.13
972 0.16
973 0.15
974 0.21
975 0.23
976 0.22
977 0.21
978 0.21
979 0.24
980 0.26
981 0.3
982 0.3
983 0.36
984 0.42
985 0.46
986 0.52
987 0.53
988 0.49