Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178A8Q5

Protein Details
Accession A0A178A8Q5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
387-411LVEISSRRRRHEKAKRKAEEAQKELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-404RRRRHEKAKRKA
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007240  Atg17  
IPR045326  ATG17-like_dom  
Gene Ontology GO:0034045  C:phagophore assembly site membrane  
GO:0000422  P:autophagy of mitochondrion  
Pfam View protein in Pfam  
PF04108  ATG17_like  
Amino Acid Sequences MASPASPASSTSSVGSRRSFDQNRPQTLEDLINHFVASKRSLNTQTVLWRANDLVNAARQLLEENAVLAAKNTSIRNIVEQQVDALEAVRRGIHVVEAEITVEFKQLLHDVDTSFTGLNSTLAVLRDTPIEAVLQPPGTPQKHLYDFIDSAAVSNLEGTLRACIDRYNEAHAVLDDSNDAFDTSLDNLHSSIENVPLTPATASNPSPIPSLYQDLETHAKEAAQNFQSLVQHYDLCVTALRHTEGGSAAATEAAGDAPSQTNDEFAAPPEPMSEEERQEMVAVLVKDAHEVEEVVTEIRERGSEMTFLLNQIENHINHLRNESSALSSILQMIAKITGEIKSHIMTSRSFHASWLDDTRPTLLNGIEEWENQRDFYERFDLAYAELLVEISSRRRRHEKAKRKAEEAQKELDRLHAEDERAREQFTLAQGDFLPLDIWPGLRDPPRQYEVRPVASQPDEDAEDEGGHEESNAGVKSIPQLGRNVVERALTRVKRRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.3
4 0.33
5 0.42
6 0.47
7 0.5
8 0.57
9 0.63
10 0.68
11 0.7
12 0.68
13 0.59
14 0.56
15 0.54
16 0.46
17 0.41
18 0.35
19 0.3
20 0.27
21 0.26
22 0.25
23 0.22
24 0.23
25 0.22
26 0.22
27 0.29
28 0.34
29 0.36
30 0.35
31 0.37
32 0.4
33 0.41
34 0.42
35 0.36
36 0.33
37 0.32
38 0.32
39 0.28
40 0.23
41 0.2
42 0.2
43 0.2
44 0.19
45 0.18
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.12
59 0.12
60 0.13
61 0.16
62 0.17
63 0.22
64 0.26
65 0.29
66 0.27
67 0.27
68 0.25
69 0.23
70 0.22
71 0.17
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.06
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.11
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.11
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.22
128 0.27
129 0.3
130 0.32
131 0.32
132 0.3
133 0.29
134 0.28
135 0.26
136 0.19
137 0.16
138 0.15
139 0.13
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.15
153 0.16
154 0.2
155 0.21
156 0.21
157 0.21
158 0.2
159 0.2
160 0.15
161 0.14
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.15
198 0.14
199 0.15
200 0.14
201 0.17
202 0.2
203 0.18
204 0.17
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.14
209 0.17
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.17
217 0.13
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.08
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.09
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.13
299 0.17
300 0.15
301 0.19
302 0.23
303 0.23
304 0.22
305 0.25
306 0.23
307 0.19
308 0.21
309 0.17
310 0.14
311 0.13
312 0.14
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.15
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.2
335 0.23
336 0.22
337 0.22
338 0.23
339 0.23
340 0.25
341 0.28
342 0.24
343 0.21
344 0.22
345 0.24
346 0.22
347 0.2
348 0.19
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.14
353 0.13
354 0.13
355 0.15
356 0.17
357 0.17
358 0.16
359 0.17
360 0.17
361 0.16
362 0.19
363 0.21
364 0.18
365 0.19
366 0.19
367 0.19
368 0.16
369 0.17
370 0.14
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.12
378 0.2
379 0.23
380 0.29
381 0.37
382 0.44
383 0.55
384 0.65
385 0.69
386 0.73
387 0.82
388 0.82
389 0.8
390 0.82
391 0.82
392 0.8
393 0.73
394 0.71
395 0.63
396 0.58
397 0.52
398 0.48
399 0.4
400 0.31
401 0.31
402 0.26
403 0.25
404 0.27
405 0.31
406 0.32
407 0.31
408 0.31
409 0.27
410 0.24
411 0.25
412 0.24
413 0.27
414 0.21
415 0.22
416 0.21
417 0.22
418 0.21
419 0.18
420 0.15
421 0.08
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.1
427 0.15
428 0.2
429 0.26
430 0.29
431 0.36
432 0.41
433 0.43
434 0.44
435 0.49
436 0.52
437 0.53
438 0.5
439 0.44
440 0.46
441 0.46
442 0.44
443 0.35
444 0.31
445 0.26
446 0.25
447 0.24
448 0.18
449 0.16
450 0.16
451 0.15
452 0.12
453 0.1
454 0.09
455 0.08
456 0.07
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.1
461 0.11
462 0.15
463 0.23
464 0.25
465 0.24
466 0.27
467 0.3
468 0.35
469 0.38
470 0.37
471 0.3
472 0.32
473 0.3
474 0.34
475 0.4
476 0.41