Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AY26

Protein Details
Accession A0A178AY26    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MSEKKRKRREENGERPKKKVAMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-26KKRKRREENGERPKKKVAMAPKG
314-317KKIP
428-444KLPLKFPRIGGPRKGKK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MSEKKRKRREENGERPKKKVAMAPKGKIQVEMLENKDALGPLLAVTPGLQCPSRISFNPYKRTKILPEGATDHLLLQSSEHPRLDYLAQEEIDGSSESQLKDYVGVFDPTTNKLQLMPVKRVTVRSTLRSETEEMREEQERLEARQQTMMAKRNALATEFGSKKSRKALEDMTMNAISSGNPNDASASRSGAVAENILQNMEAATGAMPTKEELAAAVDSSKPRPTPNLAAEYPGDVYPIDTIVGTELMTMIDVKDWVDASVAGQGVNVSSKFVARRIVALSRNKQIQKLKVLRFILLCINFSAALSGGGRGAKKIPPKGKLEALMGDDVPAGCVMAIRRKFATEGSFEMPRWNIDRLHTHIAAAALIVDDNEVDVNDLRDDLRIDNKEIQAYFAELGCRVGAPTGTDLTKHKLSKAEANNHYIAKLKLPLKFPRIGGPRKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.83
3 0.8
4 0.73
5 0.66
6 0.62
7 0.61
8 0.61
9 0.67
10 0.68
11 0.68
12 0.72
13 0.68
14 0.62
15 0.53
16 0.48
17 0.44
18 0.45
19 0.4
20 0.36
21 0.35
22 0.34
23 0.34
24 0.27
25 0.21
26 0.15
27 0.11
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.07
32 0.08
33 0.09
34 0.1
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.15
39 0.2
40 0.25
41 0.25
42 0.32
43 0.4
44 0.49
45 0.59
46 0.6
47 0.62
48 0.61
49 0.65
50 0.62
51 0.62
52 0.61
53 0.54
54 0.53
55 0.51
56 0.5
57 0.45
58 0.39
59 0.3
60 0.23
61 0.21
62 0.16
63 0.13
64 0.17
65 0.2
66 0.23
67 0.23
68 0.23
69 0.22
70 0.25
71 0.25
72 0.21
73 0.19
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.18
78 0.16
79 0.16
80 0.14
81 0.11
82 0.09
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.13
92 0.15
93 0.14
94 0.17
95 0.19
96 0.2
97 0.22
98 0.2
99 0.18
100 0.17
101 0.22
102 0.25
103 0.29
104 0.32
105 0.33
106 0.37
107 0.39
108 0.41
109 0.39
110 0.41
111 0.4
112 0.4
113 0.41
114 0.39
115 0.4
116 0.39
117 0.39
118 0.34
119 0.34
120 0.31
121 0.27
122 0.28
123 0.27
124 0.25
125 0.23
126 0.23
127 0.21
128 0.21
129 0.26
130 0.26
131 0.25
132 0.27
133 0.28
134 0.28
135 0.33
136 0.37
137 0.32
138 0.3
139 0.3
140 0.3
141 0.3
142 0.26
143 0.21
144 0.15
145 0.22
146 0.22
147 0.23
148 0.26
149 0.26
150 0.27
151 0.34
152 0.37
153 0.31
154 0.34
155 0.37
156 0.37
157 0.39
158 0.39
159 0.35
160 0.31
161 0.29
162 0.24
163 0.19
164 0.13
165 0.11
166 0.11
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.13
212 0.16
213 0.21
214 0.24
215 0.29
216 0.27
217 0.29
218 0.28
219 0.26
220 0.24
221 0.18
222 0.14
223 0.08
224 0.08
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.08
260 0.1
261 0.13
262 0.12
263 0.15
264 0.17
265 0.22
266 0.27
267 0.35
268 0.38
269 0.39
270 0.46
271 0.45
272 0.49
273 0.5
274 0.49
275 0.51
276 0.56
277 0.56
278 0.56
279 0.56
280 0.52
281 0.46
282 0.42
283 0.38
284 0.3
285 0.26
286 0.18
287 0.18
288 0.16
289 0.15
290 0.13
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.12
300 0.15
301 0.21
302 0.3
303 0.36
304 0.4
305 0.45
306 0.49
307 0.52
308 0.51
309 0.47
310 0.42
311 0.37
312 0.32
313 0.27
314 0.22
315 0.18
316 0.14
317 0.12
318 0.09
319 0.06
320 0.04
321 0.06
322 0.07
323 0.14
324 0.16
325 0.19
326 0.2
327 0.21
328 0.22
329 0.24
330 0.26
331 0.21
332 0.24
333 0.25
334 0.27
335 0.26
336 0.28
337 0.26
338 0.25
339 0.25
340 0.23
341 0.21
342 0.23
343 0.29
344 0.32
345 0.38
346 0.36
347 0.33
348 0.32
349 0.3
350 0.26
351 0.2
352 0.14
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.1
368 0.11
369 0.12
370 0.2
371 0.21
372 0.25
373 0.31
374 0.33
375 0.36
376 0.35
377 0.35
378 0.28
379 0.27
380 0.24
381 0.19
382 0.18
383 0.14
384 0.15
385 0.13
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.1
391 0.12
392 0.15
393 0.15
394 0.17
395 0.2
396 0.25
397 0.32
398 0.32
399 0.33
400 0.36
401 0.4
402 0.48
403 0.55
404 0.59
405 0.57
406 0.62
407 0.63
408 0.57
409 0.54
410 0.49
411 0.4
412 0.34
413 0.36
414 0.34
415 0.36
416 0.42
417 0.5
418 0.52
419 0.57
420 0.54
421 0.56
422 0.61
423 0.63
424 0.66