Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AEP6

Protein Details
Accession A0A178AEP6    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-50CPALQPKTSRRSFRKSSVNSPPQLHydrophilic
86-105PQAPRHLKVRQKSTWRTPGNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18, cyto 3, extr 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MSLFRTLDRTSAVSPSNNAGLFLPFLCPALQPKTSRRSFRKSSVNSPPQLAHTGKHVESLYIQALAQAASCRQHAKHISSLREVSPQAPRHLKVRQKSTWRTPGNQEAKAAAKLARAGPLKSVKQFAKQELEALVDYYGIHIDTRPEEEVPDDGNLVWNVGDAHEPWPLRDPQDSKHIQQLQKLLKDDETPQADAFKAYKKLPAPGVVYLTTETIRSMLHHLSIVERPTPVATQRFLSVLDDMKTAHIHIIRSEWTTAIHLAGRAMGTVSADELQAALQMWRDMEHRAGVKGGFVTLNVLFDISVKAGKYELAETFYKELQARKLPIHRHFRISLLYYYGILRNGDAVRKTYQDLVNSGDIVDTVVLNSVIAALIRAGEPSAAEHVFERMKRLHATRTVPAPGHRFFNRAWRDRRSLGLYLTHEARQMNRNNEPDAVKELQDYAPIAPDARTYGLLIRHHSVSAGNIDRVYELLQEMRYNSVPLEGTVFIVIFQGFSQFGGVRYSSWTRDKLEKFWSQFLKALQERLERTWISVTAVVSALKAFAKVTDPERTMRAWEEIRKMWEPTEAELENVMKVLRKLVPTQGDGFFNPQGPSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.32
4 0.28
5 0.27
6 0.23
7 0.21
8 0.2
9 0.18
10 0.17
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.17
16 0.22
17 0.27
18 0.3
19 0.38
20 0.47
21 0.55
22 0.64
23 0.68
24 0.71
25 0.73
26 0.77
27 0.8
28 0.78
29 0.79
30 0.81
31 0.81
32 0.75
33 0.71
34 0.64
35 0.56
36 0.55
37 0.47
38 0.36
39 0.34
40 0.36
41 0.33
42 0.35
43 0.32
44 0.27
45 0.26
46 0.29
47 0.24
48 0.19
49 0.18
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.13
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.15
58 0.18
59 0.18
60 0.27
61 0.32
62 0.36
63 0.42
64 0.48
65 0.51
66 0.53
67 0.56
68 0.49
69 0.49
70 0.45
71 0.4
72 0.41
73 0.41
74 0.42
75 0.46
76 0.45
77 0.46
78 0.53
79 0.57
80 0.57
81 0.62
82 0.63
83 0.66
84 0.74
85 0.78
86 0.8
87 0.78
88 0.75
89 0.73
90 0.75
91 0.72
92 0.65
93 0.57
94 0.49
95 0.47
96 0.42
97 0.37
98 0.28
99 0.22
100 0.22
101 0.22
102 0.26
103 0.25
104 0.25
105 0.29
106 0.35
107 0.38
108 0.38
109 0.43
110 0.38
111 0.45
112 0.49
113 0.48
114 0.48
115 0.44
116 0.43
117 0.37
118 0.37
119 0.29
120 0.24
121 0.19
122 0.12
123 0.11
124 0.09
125 0.08
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.08
130 0.09
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.11
140 0.1
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.09
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.18
155 0.19
156 0.2
157 0.25
158 0.26
159 0.25
160 0.35
161 0.38
162 0.35
163 0.43
164 0.48
165 0.44
166 0.46
167 0.52
168 0.49
169 0.5
170 0.5
171 0.43
172 0.37
173 0.37
174 0.35
175 0.33
176 0.3
177 0.26
178 0.24
179 0.24
180 0.22
181 0.21
182 0.2
183 0.18
184 0.19
185 0.18
186 0.23
187 0.23
188 0.27
189 0.29
190 0.32
191 0.29
192 0.28
193 0.3
194 0.25
195 0.25
196 0.21
197 0.2
198 0.15
199 0.12
200 0.1
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.16
211 0.16
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.12
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.06
281 0.05
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.14
303 0.13
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.16
308 0.2
309 0.21
310 0.23
311 0.3
312 0.35
313 0.42
314 0.5
315 0.48
316 0.49
317 0.48
318 0.46
319 0.43
320 0.38
321 0.31
322 0.23
323 0.21
324 0.17
325 0.17
326 0.16
327 0.14
328 0.11
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.13
334 0.15
335 0.15
336 0.16
337 0.18
338 0.2
339 0.21
340 0.2
341 0.21
342 0.21
343 0.2
344 0.19
345 0.18
346 0.13
347 0.1
348 0.09
349 0.08
350 0.04
351 0.03
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.1
373 0.13
374 0.13
375 0.16
376 0.15
377 0.18
378 0.22
379 0.24
380 0.27
381 0.31
382 0.36
383 0.36
384 0.39
385 0.39
386 0.37
387 0.39
388 0.39
389 0.33
390 0.35
391 0.32
392 0.3
393 0.27
394 0.36
395 0.41
396 0.44
397 0.49
398 0.5
399 0.55
400 0.54
401 0.58
402 0.53
403 0.47
404 0.41
405 0.4
406 0.36
407 0.33
408 0.33
409 0.29
410 0.26
411 0.24
412 0.25
413 0.27
414 0.31
415 0.34
416 0.38
417 0.4
418 0.4
419 0.43
420 0.41
421 0.35
422 0.35
423 0.3
424 0.24
425 0.21
426 0.22
427 0.19
428 0.19
429 0.18
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.12
434 0.1
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.11
439 0.1
440 0.14
441 0.18
442 0.21
443 0.23
444 0.24
445 0.24
446 0.23
447 0.23
448 0.2
449 0.17
450 0.21
451 0.21
452 0.19
453 0.18
454 0.18
455 0.18
456 0.18
457 0.17
458 0.11
459 0.09
460 0.1
461 0.11
462 0.12
463 0.13
464 0.16
465 0.16
466 0.15
467 0.14
468 0.15
469 0.14
470 0.13
471 0.16
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.12
476 0.09
477 0.1
478 0.09
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.12
488 0.12
489 0.11
490 0.16
491 0.2
492 0.23
493 0.28
494 0.31
495 0.32
496 0.42
497 0.45
498 0.45
499 0.5
500 0.53
501 0.53
502 0.58
503 0.58
504 0.52
505 0.52
506 0.49
507 0.5
508 0.44
509 0.44
510 0.41
511 0.43
512 0.43
513 0.43
514 0.46
515 0.37
516 0.37
517 0.36
518 0.31
519 0.27
520 0.27
521 0.24
522 0.19
523 0.2
524 0.18
525 0.15
526 0.14
527 0.13
528 0.1
529 0.1
530 0.08
531 0.09
532 0.12
533 0.16
534 0.2
535 0.27
536 0.29
537 0.31
538 0.34
539 0.33
540 0.33
541 0.33
542 0.35
543 0.33
544 0.38
545 0.42
546 0.45
547 0.5
548 0.5
549 0.49
550 0.43
551 0.44
552 0.39
553 0.35
554 0.37
555 0.31
556 0.29
557 0.29
558 0.29
559 0.22
560 0.21
561 0.18
562 0.14
563 0.14
564 0.18
565 0.2
566 0.23
567 0.26
568 0.33
569 0.39
570 0.4
571 0.44
572 0.43
573 0.42
574 0.4
575 0.41
576 0.36
577 0.33