FuNGI

A0A178BDY8

Protein Details

Accession

A0A178BDY8

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
27-48	HEEPIAKRRRNSAPRVTQNKED	Hydrophilic
91-114	EELRAPSPPKPRPSKPKLTTPNTL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
181-204	IHSRPPSKKAKRLGIMVPEHHKRK
269-277	KKASKRRKG

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 5.5, cyto_mito 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MMVPLSRNTPRLLSKVNGRKHASDDDHEEPIAKRRRNSAPRVTQNKEDIHAEPASTDEELRAPSPRERRQNPLSLIRKEEDIYAEPASSDEELRAPSPPKPRPSKPKLTTPNTLYEADDLKVPPKKVQAADHNKENASSAVPRSSSSSTQQGIFDEMAFGSQGSGKRLMAKTFSSKKTSNIHSRPPSKKAKRLGIMVPEHHKRKGTTTPTEKGKASLDSDNESVVSTWSIDELVNILGPAEETAEESANEAAAEAAKEDDPELRTVATKKASKRRKGSRLTVLHDQLGDWIKDRGPTSSQPDSSAPSEGMDHLKEYLEKLPEEEVEGSCCPLCRAPVNDDDYWDYWKGKEKTVKNQNKFCHAHRTKSAWDEYRSEGYPDITWTDLPQRIRKHRMTLFKILNNERSSGYRDRYEPIALTGNAAAVPTKRKDLPEHVQQELESYALDHHSVYPGYYGPHGRRVITESVMKLLKNEIKNCTDAVVQGSGPATFVQAVLVPEMAVLLIMEDCRVDREEAEEIRERTYELGMLLNEEVEDRVELHDHSDDENEYGVR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.55
3	0.61
4	0.64
5	0.64
6	0.62
7	0.62
8	0.66
9	0.62
10	0.58
11	0.58
12	0.53
13	0.5
14	0.47
15	0.44
16	0.36
17	0.4
18	0.43
19	0.41
20	0.4
21	0.46
22	0.57
23	0.64
24	0.72
25	0.74
26	0.75
27	0.81
28	0.87
29	0.83
30	0.8
31	0.77
32	0.72
33	0.64
34	0.57
35	0.47
36	0.42
37	0.38
38	0.3
39	0.23
40	0.21
41	0.19
42	0.16
43	0.15
44	0.11
45	0.12
46	0.13
47	0.15
48	0.18
49	0.19
50	0.26
51	0.36
52	0.44
53	0.53
54	0.56
55	0.64
56	0.67
57	0.73
58	0.72
59	0.73
60	0.73
61	0.67
62	0.68
63	0.61
64	0.55
65	0.46
66	0.42
67	0.35
68	0.29
69	0.27
70	0.23
71	0.21
72	0.19
73	0.18
74	0.18
75	0.14
76	0.12
77	0.1
78	0.1
79	0.12
80	0.12
81	0.16
82	0.17
83	0.22
84	0.31
85	0.38
86	0.46
87	0.53
88	0.63
89	0.69
90	0.77
91	0.82
92	0.78
93	0.82
94	0.83
95	0.81
96	0.8
97	0.73
98	0.71
99	0.64
100	0.59
101	0.49
102	0.41
103	0.36
104	0.28
105	0.26
106	0.19
107	0.21
108	0.25
109	0.25
110	0.26
111	0.29
112	0.35
113	0.36
114	0.43
115	0.48
116	0.54
117	0.58
118	0.62
119	0.61
120	0.55
121	0.51
122	0.45
123	0.35
124	0.27
125	0.24
126	0.18
127	0.18
128	0.18
129	0.18
130	0.21
131	0.24
132	0.24
133	0.25
134	0.29
135	0.27
136	0.28
137	0.29
138	0.25
139	0.24
140	0.22
141	0.18
142	0.12
143	0.11
144	0.09
145	0.08
146	0.07
147	0.05
148	0.08
149	0.09
150	0.11
151	0.13
152	0.13
153	0.2
154	0.22
155	0.23
156	0.23
157	0.25
158	0.32
159	0.39
160	0.43
161	0.42
162	0.42
163	0.46
164	0.5
165	0.55
166	0.56
167	0.54
168	0.59
169	0.62
170	0.71
171	0.71
172	0.72
173	0.75
174	0.73
175	0.75
176	0.74
177	0.74
178	0.69
179	0.68
180	0.65
181	0.62
182	0.58
183	0.55
184	0.53
185	0.51
186	0.49
187	0.46
188	0.44
189	0.37
190	0.37
191	0.42
192	0.42
193	0.45
194	0.49
195	0.54
196	0.57
197	0.6
198	0.55
199	0.48
200	0.43
201	0.36
202	0.31
203	0.28
204	0.23
205	0.22
206	0.22
207	0.21
208	0.18
209	0.16
210	0.13
211	0.1
212	0.08
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.06
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.03
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.05
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.1
252	0.11
253	0.14
254	0.17
255	0.21
256	0.27
257	0.36
258	0.45
259	0.52
260	0.6
261	0.67
262	0.72
263	0.75
264	0.76
265	0.76
266	0.74
267	0.7
268	0.67
269	0.59
270	0.5
271	0.42
272	0.34
273	0.27
274	0.23
275	0.18
276	0.12
277	0.11
278	0.11
279	0.14
280	0.14
281	0.13
282	0.14
283	0.17
284	0.23
285	0.27
286	0.27
287	0.26
288	0.27
289	0.28
290	0.26
291	0.24
292	0.18
293	0.13
294	0.13
295	0.12
296	0.13
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.1
303	0.13
304	0.13
305	0.13
306	0.13
307	0.14
308	0.14
309	0.15
310	0.15
311	0.11
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.11
316	0.11
317	0.09
318	0.09
319	0.1
320	0.11
321	0.14
322	0.17
323	0.23
324	0.28
325	0.28
326	0.28
327	0.3
328	0.28
329	0.27
330	0.25
331	0.2
332	0.16
333	0.25
334	0.25
335	0.28
336	0.35
337	0.38
338	0.47
339	0.58
340	0.67
341	0.66
342	0.72
343	0.7
344	0.72
345	0.71
346	0.63
347	0.64
348	0.57
349	0.55
350	0.53
351	0.55
352	0.5
353	0.52
354	0.55
355	0.49
356	0.49
357	0.45
358	0.43
359	0.41
360	0.38
361	0.33
362	0.27
363	0.23
364	0.2
365	0.18
366	0.16
367	0.12
368	0.11
369	0.11
370	0.16
371	0.19
372	0.22
373	0.27
374	0.35
375	0.42
376	0.51
377	0.54
378	0.57
379	0.6
380	0.67
381	0.67
382	0.68
383	0.67
384	0.62
385	0.66
386	0.62
387	0.62
388	0.53
389	0.48
390	0.4
391	0.35
392	0.36
393	0.34
394	0.33
395	0.3
396	0.31
397	0.32
398	0.33
399	0.33
400	0.28
401	0.25
402	0.26
403	0.22
404	0.21
405	0.19
406	0.16
407	0.15
408	0.14
409	0.12
410	0.08
411	0.13
412	0.14
413	0.18
414	0.21
415	0.24
416	0.29
417	0.37
418	0.43
419	0.49
420	0.52
421	0.5
422	0.49
423	0.45
424	0.42
425	0.33
426	0.26
427	0.15
428	0.1
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.08
433	0.08
434	0.1
435	0.11
436	0.1
437	0.11
438	0.11
439	0.12
440	0.15
441	0.2
442	0.2
443	0.29
444	0.3
445	0.3
446	0.31
447	0.34
448	0.35
449	0.33
450	0.35
451	0.27
452	0.31
453	0.32
454	0.3
455	0.26
456	0.29
457	0.33
458	0.35
459	0.39
460	0.4
461	0.41
462	0.43
463	0.42
464	0.37
465	0.31
466	0.25
467	0.24
468	0.19
469	0.16
470	0.16
471	0.16
472	0.14
473	0.13
474	0.12
475	0.1
476	0.08
477	0.08
478	0.07
479	0.09
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.08
485	0.08
486	0.07
487	0.05
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.08
496	0.11
497	0.11
498	0.11
499	0.15
500	0.21
501	0.22
502	0.28
503	0.32
504	0.32
505	0.33
506	0.33
507	0.3
508	0.25
509	0.24
510	0.2
511	0.14
512	0.16
513	0.14
514	0.16
515	0.15
516	0.14
517	0.13
518	0.12
519	0.12
520	0.09
521	0.09
522	0.08
523	0.09
524	0.11
525	0.11
526	0.14
527	0.17
528	0.17
529	0.18
530	0.2
531	0.2
532	0.19

A0A178BDY8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer