Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AVZ8

Protein Details
Accession A0A178AVZ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-239LTRLPPRTPRVPKPKRTPQTQIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-233KRQALKKLAPAPSARPRQPKMALTRLPPRTPRVPKPKR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MLHKTPPSHRLTVSSLLSPPEMKRSESFGSSIAPAFAPVSFSSFDSQSSQEASKPLFGPALMAAYPTGLLSKGDAYASPPISPYDTQSQKESMDDADVQGTRDPQLFTSRGTAAPGALEPLFPQESTEPASQDAITRHMQSSEYARLQSKPSRDDYELAISFRSIAFESALKNPRAWRERERQFEEYYGRPSGVQKRQALKKLAPAPSARPRQPKMALTRLPPRTPRVPKPKRTPQTQIIDSFDYSPATASPKPARLTTNRDDTDYNALPDYCPPLDTLPKGNPKALKAEWKGTVLDLSNDPDRHMLHEAEVNLAATLRLNCATYLCSKRRVFQARIEALRIGKEFRKTDAQQACKIDVNKASKLWQSYEKVGWFNPDYFRQYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.38
3 0.35
4 0.35
5 0.33
6 0.29
7 0.31
8 0.3
9 0.3
10 0.3
11 0.35
12 0.37
13 0.36
14 0.36
15 0.28
16 0.28
17 0.27
18 0.25
19 0.2
20 0.16
21 0.14
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.16
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.19
34 0.18
35 0.2
36 0.2
37 0.2
38 0.22
39 0.22
40 0.24
41 0.23
42 0.23
43 0.2
44 0.19
45 0.18
46 0.16
47 0.17
48 0.12
49 0.12
50 0.1
51 0.09
52 0.1
53 0.08
54 0.08
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.11
63 0.16
64 0.17
65 0.17
66 0.16
67 0.17
68 0.2
69 0.2
70 0.21
71 0.25
72 0.3
73 0.31
74 0.33
75 0.34
76 0.32
77 0.32
78 0.29
79 0.2
80 0.18
81 0.16
82 0.14
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.13
89 0.15
90 0.15
91 0.13
92 0.18
93 0.18
94 0.18
95 0.21
96 0.22
97 0.2
98 0.21
99 0.2
100 0.14
101 0.14
102 0.12
103 0.11
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.11
111 0.1
112 0.11
113 0.15
114 0.16
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.14
119 0.16
120 0.15
121 0.15
122 0.16
123 0.17
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.16
128 0.19
129 0.21
130 0.21
131 0.21
132 0.22
133 0.23
134 0.27
135 0.31
136 0.3
137 0.29
138 0.32
139 0.34
140 0.34
141 0.34
142 0.32
143 0.34
144 0.31
145 0.27
146 0.23
147 0.18
148 0.17
149 0.15
150 0.13
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.1
156 0.16
157 0.21
158 0.21
159 0.22
160 0.24
161 0.31
162 0.34
163 0.37
164 0.38
165 0.43
166 0.51
167 0.58
168 0.62
169 0.58
170 0.54
171 0.53
172 0.49
173 0.41
174 0.36
175 0.28
176 0.22
177 0.19
178 0.21
179 0.27
180 0.29
181 0.34
182 0.36
183 0.43
184 0.49
185 0.54
186 0.55
187 0.47
188 0.49
189 0.5
190 0.48
191 0.44
192 0.4
193 0.4
194 0.45
195 0.51
196 0.48
197 0.48
198 0.47
199 0.5
200 0.53
201 0.52
202 0.5
203 0.52
204 0.5
205 0.48
206 0.55
207 0.53
208 0.53
209 0.5
210 0.49
211 0.49
212 0.53
213 0.58
214 0.6
215 0.65
216 0.71
217 0.78
218 0.84
219 0.82
220 0.81
221 0.79
222 0.77
223 0.76
224 0.71
225 0.64
226 0.56
227 0.51
228 0.44
229 0.37
230 0.29
231 0.21
232 0.16
233 0.13
234 0.1
235 0.12
236 0.12
237 0.16
238 0.19
239 0.24
240 0.26
241 0.28
242 0.32
243 0.33
244 0.41
245 0.41
246 0.48
247 0.43
248 0.44
249 0.42
250 0.4
251 0.42
252 0.35
253 0.3
254 0.22
255 0.21
256 0.19
257 0.19
258 0.21
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.18
264 0.2
265 0.24
266 0.27
267 0.36
268 0.37
269 0.4
270 0.41
271 0.38
272 0.43
273 0.42
274 0.44
275 0.4
276 0.43
277 0.42
278 0.41
279 0.4
280 0.33
281 0.33
282 0.24
283 0.22
284 0.18
285 0.18
286 0.22
287 0.21
288 0.22
289 0.22
290 0.21
291 0.22
292 0.24
293 0.21
294 0.17
295 0.21
296 0.2
297 0.2
298 0.2
299 0.17
300 0.13
301 0.13
302 0.11
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.13
311 0.19
312 0.28
313 0.3
314 0.38
315 0.4
316 0.45
317 0.54
318 0.61
319 0.57
320 0.57
321 0.64
322 0.63
323 0.65
324 0.63
325 0.55
326 0.48
327 0.48
328 0.41
329 0.34
330 0.3
331 0.35
332 0.34
333 0.35
334 0.44
335 0.42
336 0.5
337 0.55
338 0.57
339 0.56
340 0.59
341 0.57
342 0.54
343 0.53
344 0.49
345 0.47
346 0.47
347 0.44
348 0.42
349 0.43
350 0.42
351 0.45
352 0.44
353 0.45
354 0.44
355 0.46
356 0.5
357 0.49
358 0.47
359 0.45
360 0.47
361 0.42
362 0.4
363 0.4
364 0.41