Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AIX8

Protein Details
Accession A0A178AIX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
368-388LCTYDKVQRVKNKWKCTLKDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-304KGKKRK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10.5, mito 4, cyto 3, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
CDD cd07976  TFIIA_alpha_beta_like  
Amino Acid Sequences MSNTIVGSVYQQIIDNVIKASQNDFEEFGVDTSTLEEMKQVRDRLAASPAIAPSLYGWQEKLSALKVATFPWDPQPEPQRQPPTVPSNANVKPDIDLPPASAPQDSLNFPNVPIKAEGGYQPPLPNYPSGQPANGAVYSGGYEPDAAASRAATLVQQRFQNSAQQQPQRPQQYTANFPNVGPQGQIPHMPINGQQQPRMMAPQQQQSQQQMQQQQQQQQRMQQQVQQQRPPQQGHMYNSQNDGSDDALADWNALKAARAAAIEDEAGRLAADQFMRARIDAMAMRQDSGLMVPLKSMPKGKKRKAAVSVLQAEDAEASSSIPGPARFDGDDDEVKEDPDDAINSDLDDPEDELNDGDNSDDEMVDYMLCTYDKVQRVKNKWKCTLKDGILTTNKKEYLFHKANGEFEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.14
4 0.15
5 0.16
6 0.17
7 0.19
8 0.2
9 0.22
10 0.22
11 0.23
12 0.21
13 0.2
14 0.2
15 0.18
16 0.14
17 0.12
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.08
23 0.12
24 0.13
25 0.19
26 0.25
27 0.26
28 0.26
29 0.29
30 0.31
31 0.3
32 0.33
33 0.28
34 0.23
35 0.25
36 0.24
37 0.22
38 0.2
39 0.17
40 0.13
41 0.18
42 0.19
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.18
47 0.19
48 0.2
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.19
53 0.19
54 0.18
55 0.22
56 0.21
57 0.21
58 0.26
59 0.3
60 0.28
61 0.35
62 0.41
63 0.45
64 0.49
65 0.57
66 0.57
67 0.54
68 0.57
69 0.58
70 0.57
71 0.55
72 0.52
73 0.46
74 0.47
75 0.49
76 0.48
77 0.41
78 0.35
79 0.3
80 0.3
81 0.31
82 0.25
83 0.21
84 0.2
85 0.21
86 0.22
87 0.21
88 0.18
89 0.15
90 0.15
91 0.17
92 0.17
93 0.16
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.24
98 0.22
99 0.21
100 0.2
101 0.19
102 0.15
103 0.16
104 0.18
105 0.16
106 0.18
107 0.18
108 0.19
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.18
113 0.17
114 0.18
115 0.22
116 0.22
117 0.21
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.19
122 0.16
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.11
141 0.13
142 0.16
143 0.19
144 0.2
145 0.23
146 0.23
147 0.29
148 0.26
149 0.32
150 0.36
151 0.4
152 0.42
153 0.45
154 0.52
155 0.52
156 0.51
157 0.47
158 0.46
159 0.44
160 0.47
161 0.47
162 0.44
163 0.38
164 0.36
165 0.38
166 0.32
167 0.28
168 0.21
169 0.17
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.18
179 0.23
180 0.23
181 0.23
182 0.22
183 0.24
184 0.24
185 0.24
186 0.19
187 0.19
188 0.22
189 0.28
190 0.3
191 0.31
192 0.34
193 0.35
194 0.38
195 0.35
196 0.36
197 0.34
198 0.35
199 0.38
200 0.4
201 0.44
202 0.46
203 0.48
204 0.46
205 0.46
206 0.49
207 0.47
208 0.44
209 0.41
210 0.44
211 0.47
212 0.51
213 0.51
214 0.49
215 0.51
216 0.56
217 0.54
218 0.49
219 0.47
220 0.45
221 0.43
222 0.47
223 0.42
224 0.38
225 0.38
226 0.36
227 0.29
228 0.24
229 0.21
230 0.14
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.08
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.1
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.16
270 0.15
271 0.16
272 0.15
273 0.15
274 0.13
275 0.12
276 0.14
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.13
281 0.15
282 0.17
283 0.23
284 0.27
285 0.36
286 0.47
287 0.55
288 0.6
289 0.65
290 0.72
291 0.73
292 0.75
293 0.71
294 0.69
295 0.68
296 0.6
297 0.54
298 0.44
299 0.37
300 0.28
301 0.22
302 0.13
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.09
309 0.09
310 0.11
311 0.12
312 0.15
313 0.15
314 0.15
315 0.18
316 0.2
317 0.22
318 0.21
319 0.24
320 0.21
321 0.21
322 0.2
323 0.17
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.17
359 0.25
360 0.3
361 0.38
362 0.46
363 0.56
364 0.67
365 0.74
366 0.77
367 0.8
368 0.85
369 0.82
370 0.79
371 0.8
372 0.74
373 0.73
374 0.66
375 0.65
376 0.65
377 0.63
378 0.61
379 0.58
380 0.55
381 0.47
382 0.48
383 0.42
384 0.43
385 0.46
386 0.45
387 0.46
388 0.47