Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B8L5

Protein Details
Accession A0A178B8L5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-45YGSSKTRKSNTKSTPEKRTNGTHydrophilic
200-223EEEKEEKKKAPKEKTPKQKWTAYLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-216EEKKKAPKEKTPK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.5, cyto 8, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
CDD cd21075  DBD_XPA-like  
Amino Acid Sequences MSTRRSGRAKAPVKYTSDSEGSDYGSSKTRKSNTKSTPEKRTNGTNHDAVTSSPAKRTKKDPSVVAAEHRAKAAAADEKASKAAHKKAWDEWVTAHDVGGKLLDDEPAREESITQTDGLKKYGLKKYGLKKEDLAVLKHFEKKNPNPLFKNAIKLFFEEEVKVLGYRKAGMLAGVEGKNEEVLKQGEEIWREEHKDDPPEEEKEEKKKAPKEKTPKQKWTAYLEAHAVSSPDSLKDEPEEAINQTDCKTKYSLVPGDLVVLPYFPKPNPKYGNTTKLFKESEVKTLAYRKAAVLGGVEDGDEAAMLEKGKELFEEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.58
3 0.53
4 0.47
5 0.42
6 0.37
7 0.32
8 0.28
9 0.26
10 0.24
11 0.2
12 0.25
13 0.25
14 0.25
15 0.32
16 0.38
17 0.46
18 0.52
19 0.6
20 0.63
21 0.72
22 0.79
23 0.8
24 0.83
25 0.83
26 0.81
27 0.75
28 0.75
29 0.72
30 0.68
31 0.65
32 0.58
33 0.5
34 0.46
35 0.42
36 0.32
37 0.31
38 0.29
39 0.24
40 0.27
41 0.33
42 0.36
43 0.39
44 0.47
45 0.51
46 0.56
47 0.61
48 0.59
49 0.57
50 0.61
51 0.59
52 0.55
53 0.53
54 0.48
55 0.42
56 0.38
57 0.32
58 0.24
59 0.23
60 0.22
61 0.19
62 0.16
63 0.17
64 0.18
65 0.19
66 0.2
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.26
71 0.28
72 0.32
73 0.34
74 0.37
75 0.46
76 0.45
77 0.41
78 0.36
79 0.34
80 0.33
81 0.3
82 0.25
83 0.19
84 0.17
85 0.15
86 0.14
87 0.11
88 0.08
89 0.08
90 0.11
91 0.08
92 0.09
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.16
104 0.17
105 0.18
106 0.17
107 0.16
108 0.24
109 0.29
110 0.31
111 0.31
112 0.37
113 0.45
114 0.54
115 0.54
116 0.48
117 0.44
118 0.42
119 0.45
120 0.4
121 0.33
122 0.25
123 0.26
124 0.27
125 0.32
126 0.31
127 0.28
128 0.35
129 0.38
130 0.47
131 0.5
132 0.55
133 0.51
134 0.54
135 0.57
136 0.49
137 0.53
138 0.44
139 0.4
140 0.34
141 0.31
142 0.3
143 0.24
144 0.23
145 0.15
146 0.14
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.12
174 0.14
175 0.15
176 0.16
177 0.17
178 0.19
179 0.19
180 0.21
181 0.22
182 0.25
183 0.24
184 0.26
185 0.28
186 0.29
187 0.3
188 0.31
189 0.33
190 0.35
191 0.4
192 0.39
193 0.43
194 0.48
195 0.56
196 0.61
197 0.66
198 0.7
199 0.75
200 0.82
201 0.84
202 0.87
203 0.84
204 0.81
205 0.76
206 0.73
207 0.7
208 0.61
209 0.53
210 0.45
211 0.39
212 0.33
213 0.27
214 0.2
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.08
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.13
223 0.14
224 0.13
225 0.14
226 0.15
227 0.14
228 0.16
229 0.16
230 0.15
231 0.15
232 0.21
233 0.2
234 0.2
235 0.21
236 0.2
237 0.24
238 0.31
239 0.34
240 0.3
241 0.31
242 0.29
243 0.3
244 0.29
245 0.25
246 0.17
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.15
251 0.13
252 0.23
253 0.24
254 0.34
255 0.41
256 0.44
257 0.52
258 0.57
259 0.67
260 0.62
261 0.65
262 0.59
263 0.59
264 0.56
265 0.49
266 0.49
267 0.41
268 0.43
269 0.41
270 0.39
271 0.35
272 0.41
273 0.43
274 0.38
275 0.37
276 0.3
277 0.31
278 0.31
279 0.27
280 0.21
281 0.18
282 0.16
283 0.15
284 0.14
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.09
295 0.1
296 0.1