FuNGI

A0A178ABM7

Protein Details

Accession

A0A178ABM7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
107-131	QEVDERMDKRRRARREAREQQERDD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
115-121	KRRRARR

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, mito_nucl 10.333, mito 9, cyto_mito 7.333, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF14559 TPR_19
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR

Amino Acid Sequences

MSGRRDFLSMPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQMKEMLAKRAASLGQAAPSAYGVTEKKEEDEEEDRFQDPDNEVGLFSSGMNYDKDDDEADRIYQEVDERMDKRRRARREAREQQERDDYEKNNPKIQLQFADLKRALGSVSEEEWAALPEVGDMTGKAKRAREARMANARSYAVPDSVLQAASKSGELDTSISANDADSGTMTNFASIGAAQLSALQVRLDSAANTGEQQATTSGTATSVDPKGYITALDRKQAMGDEVPVEDINRARVLLESAVKTNVHNGPGYVALARLEEVAGKIHTAKKVIQKGCEMCPKSIVVWEEAIRLNRETVHNAKIVAANGIKLNPKAIKLWQAAIDLEQTPAARKKVTRQALDHNPQSVELWKTLINDTEDIENVKLLFAKATETVPLSEELWISYARVSDADAAQQVLNKARKAIPTSWAIWVHACRLQEELGKVEVCDRIMERAVKALIKENAMIKREEWLTQAEICEEEGDKATAASIIKATIGWGLDEDDDRRDVWLEDSKGASSRGRYETARAILGHAVSIFPYSTTVWHASADLEKHHGSSESLLSVLERAVNACPNSESLWLLYAREKWASGDPQGAREVLGRSFNQLPGNENLYTRAVDLEVDAGNYEQARQFLKAARESAATDRIFMKSAVLERQLSNFEDAIDICNQGLQNWPGSWKLHAVKGQIYEQLSKLKEAQEAFSIGTRAAPKSPTLFILLSRIQEKQGAIVKARSTLDRGRQQNPKNPDLLCEAVRLERRQNNIPSAQKLMATALQECPTSGLLWSEKIMHLESRTQRKPRALEAIKKVEKDPILFVVVARIFWAERRLDKAATWFTKALVLDPDYGDGWVWYYKFLEQHGTEEKKAEVLSRAAMAEPRHGEVWQSVRKDPRNARVGVEELVKIAAKVAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.24
3	0.18
4	0.15
5	0.12
6	0.1
7	0.09
8	0.09
9	0.09
10	0.09
11	0.08
12	0.09
13	0.1
14	0.11
15	0.15
16	0.15
17	0.16
18	0.2
19	0.23
20	0.25
21	0.3
22	0.3
23	0.29
24	0.31
25	0.32
26	0.31
27	0.36
28	0.38
29	0.33
30	0.32
31	0.29
32	0.28
33	0.32
34	0.33
35	0.31
36	0.29
37	0.29
38	0.28
39	0.32
40	0.31
41	0.26
42	0.26
43	0.21
44	0.2
45	0.2
46	0.19
47	0.16
48	0.15
49	0.14
50	0.11
51	0.13
52	0.12
53	0.15
54	0.19
55	0.2
56	0.22
57	0.24
58	0.25
59	0.27
60	0.32
61	0.32
62	0.33
63	0.34
64	0.33
65	0.31
66	0.31
67	0.29
68	0.24
69	0.23
70	0.2
71	0.18
72	0.17
73	0.17
74	0.17
75	0.12
76	0.11
77	0.09
78	0.09
79	0.1
80	0.11
81	0.12
82	0.13
83	0.14
84	0.15
85	0.15
86	0.16
87	0.17
88	0.18
89	0.17
90	0.15
91	0.15
92	0.14
93	0.13
94	0.14
95	0.13
96	0.15
97	0.2
98	0.22
99	0.31
100	0.39
101	0.43
102	0.52
103	0.58
104	0.65
105	0.69
106	0.78
107	0.8
108	0.83
109	0.89
110	0.89
111	0.91
112	0.84
113	0.8
114	0.78
115	0.7
116	0.64
117	0.6
118	0.52
119	0.51
120	0.58
121	0.55
122	0.52
123	0.51
124	0.5
125	0.49
126	0.51
127	0.44
128	0.39
129	0.44
130	0.4
131	0.47
132	0.43
133	0.39
134	0.34
135	0.31
136	0.26
137	0.18
138	0.2
139	0.13
140	0.14
141	0.14
142	0.13
143	0.13
144	0.13
145	0.13
146	0.11
147	0.08
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.06
154	0.08
155	0.11
156	0.14
157	0.18
158	0.2
159	0.26
160	0.32
161	0.38
162	0.44
163	0.48
164	0.54
165	0.61
166	0.61
167	0.56
168	0.53
169	0.48
170	0.38
171	0.36
172	0.28
173	0.18
174	0.16
175	0.15
176	0.15
177	0.16
178	0.16
179	0.12
180	0.11
181	0.11
182	0.11
183	0.11
184	0.09
185	0.08
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.07
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.08
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.08
224	0.09
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.1
233	0.09
234	0.08
235	0.08
236	0.09
237	0.09
238	0.13
239	0.12
240	0.12
241	0.12
242	0.12
243	0.13
244	0.12
245	0.12
246	0.11
247	0.19
248	0.21
249	0.24
250	0.24
251	0.24
252	0.24
253	0.24
254	0.23
255	0.15
256	0.14
257	0.12
258	0.11
259	0.12
260	0.11
261	0.11
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.08
268	0.09
269	0.1
270	0.11
271	0.14
272	0.14
273	0.14
274	0.16
275	0.16
276	0.16
277	0.2
278	0.2
279	0.19
280	0.17
281	0.16
282	0.16
283	0.16
284	0.17
285	0.11
286	0.09
287	0.08
288	0.07
289	0.08
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.09
298	0.12
299	0.14
300	0.16
301	0.2
302	0.26
303	0.36
304	0.38
305	0.39
306	0.42
307	0.44
308	0.48
309	0.53
310	0.47
311	0.38
312	0.37
313	0.35
314	0.29
315	0.29
316	0.24
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.17
321	0.18
322	0.19
323	0.18
324	0.17
325	0.16
326	0.16
327	0.17
328	0.19
329	0.2
330	0.22
331	0.21
332	0.21
333	0.22
334	0.21
335	0.2
336	0.18
337	0.15
338	0.13
339	0.12
340	0.14
341	0.15
342	0.13
343	0.15
344	0.14
345	0.15
346	0.16
347	0.17
348	0.23
349	0.23
350	0.25
351	0.24
352	0.24
353	0.23
354	0.21
355	0.21
356	0.14
357	0.13
358	0.12
359	0.09
360	0.1
361	0.14
362	0.14
363	0.14
364	0.15
365	0.22
366	0.31
367	0.38
368	0.4
369	0.41
370	0.49
371	0.57
372	0.62
373	0.57
374	0.5
375	0.42
376	0.38
377	0.35
378	0.29
379	0.2
380	0.14
381	0.13
382	0.12
383	0.13
384	0.14
385	0.15
386	0.13
387	0.12
388	0.13
389	0.12
390	0.12
391	0.11
392	0.11
393	0.09
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.08
405	0.09
406	0.09
407	0.1
408	0.09
409	0.09
410	0.08
411	0.07
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.09
428	0.13
429	0.15
430	0.15
431	0.16
432	0.18
433	0.2
434	0.23
435	0.24
436	0.23
437	0.23
438	0.25
439	0.27
440	0.25
441	0.23
442	0.21
443	0.19
444	0.18
445	0.17
446	0.15
447	0.12
448	0.12
449	0.13
450	0.14
451	0.14
452	0.13
453	0.12
454	0.12
455	0.11
456	0.12
457	0.12
458	0.1
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.11
463	0.12
464	0.1
465	0.11
466	0.12
467	0.12
468	0.12
469	0.16
470	0.15
471	0.15
472	0.16
473	0.18
474	0.22
475	0.22
476	0.22
477	0.18
478	0.2
479	0.2
480	0.19
481	0.16
482	0.14
483	0.14
484	0.15
485	0.15
486	0.11
487	0.11
488	0.1
489	0.09
490	0.07
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.05
501	0.05
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.06
510	0.06
511	0.07
512	0.08
513	0.07
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.1
520	0.14
521	0.14
522	0.15
523	0.16
524	0.16
525	0.16
526	0.17
527	0.16
528	0.12
529	0.17
530	0.18
531	0.2
532	0.21
533	0.22
534	0.25
535	0.26
536	0.26
537	0.21
538	0.19
539	0.18
540	0.17
541	0.14
542	0.1
543	0.08
544	0.06
545	0.07
546	0.05
547	0.04
548	0.05
549	0.05
550	0.06
551	0.09
552	0.11
553	0.11
554	0.11
555	0.11
556	0.11
557	0.13
558	0.13
559	0.12
560	0.13
561	0.13
562	0.13
563	0.13
564	0.13
565	0.11
566	0.12
567	0.12
568	0.09
569	0.09
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.07
574	0.06
575	0.05
576	0.06
577	0.07
578	0.1
579	0.1
580	0.1
581	0.11
582	0.11
583	0.12
584	0.13
585	0.12
586	0.09
587	0.11
588	0.11
589	0.12
590	0.13
591	0.14
592	0.14
593	0.15
594	0.15
595	0.14
596	0.18
597	0.19
598	0.18
599	0.23
600	0.22
601	0.24
602	0.25
603	0.23
604	0.19
605	0.19
606	0.19
607	0.14
608	0.17
609	0.15
610	0.17
611	0.19
612	0.21
613	0.23
614	0.22
615	0.23
616	0.23
617	0.26
618	0.23
619	0.22
620	0.21
621	0.19
622	0.19
623	0.16
624	0.13
625	0.1
626	0.09
627	0.09
628	0.08
629	0.07
630	0.07
631	0.07
632	0.06
633	0.07
634	0.07
635	0.07
636	0.07
637	0.08
638	0.1
639	0.11
640	0.13
641	0.17
642	0.22
643	0.24
644	0.24
645	0.24
646	0.24
647	0.25
648	0.26
649	0.29
650	0.24
651	0.23
652	0.23
653	0.22
654	0.22
655	0.2
656	0.17
657	0.13
658	0.15
659	0.17
660	0.19
661	0.2
662	0.19
663	0.22
664	0.23
665	0.22
666	0.22
667	0.18
668	0.15
669	0.14
670	0.14
671	0.14
672	0.12
673	0.11
674	0.09
675	0.11
676	0.1
677	0.1
678	0.14
679	0.12
680	0.14
681	0.14
682	0.16
683	0.17
684	0.18
685	0.19
686	0.21
687	0.23
688	0.26
689	0.29
690	0.3
691	0.31
692	0.33
693	0.34
694	0.32
695	0.31
696	0.28
697	0.26
698	0.3
699	0.27
700	0.25
701	0.26
702	0.24
703	0.26
704	0.26
705	0.25
706	0.21
707	0.22
708	0.21
709	0.2
710	0.18
711	0.14
712	0.16
713	0.16
714	0.15
715	0.16
716	0.17
717	0.17
718	0.2
719	0.21
720	0.19
721	0.21
722	0.2
723	0.19
724	0.24
725	0.24
726	0.23
727	0.24
728	0.24
729	0.21
730	0.23
731	0.22
732	0.22
733	0.26
734	0.27
735	0.27
736	0.3
737	0.3
738	0.32
739	0.33
740	0.29
741	0.27
742	0.31
743	0.38
744	0.43
745	0.48
746	0.51
747	0.59
748	0.65
749	0.69
750	0.7
751	0.65
752	0.61
753	0.56
754	0.51
755	0.47
756	0.43
757	0.35
758	0.3
759	0.27
760	0.27
761	0.32
762	0.32
763	0.35
764	0.37
765	0.41
766	0.47
767	0.51
768	0.52
769	0.54
770	0.57
771	0.53
772	0.52
773	0.48
774	0.41
775	0.36
776	0.32
777	0.27
778	0.23
779	0.21
780	0.2
781	0.2
782	0.2
783	0.19
784	0.18
785	0.16
786	0.15
787	0.13
788	0.13
789	0.13
790	0.14
791	0.15
792	0.16
793	0.16
794	0.18
795	0.19
796	0.19
797	0.19
798	0.27
799	0.34
800	0.42
801	0.49
802	0.54
803	0.59
804	0.64
805	0.66
806	0.65
807	0.68
808	0.66
809	0.67
810	0.69
811	0.74
812	0.71
813	0.69
814	0.63
815	0.58
816	0.53
817	0.46
818	0.39
819	0.32
820	0.29
821	0.27
822	0.26
823	0.26
824	0.24
825	0.21
826	0.19
827	0.16
828	0.14
829	0.16
830	0.21
831	0.18
832	0.21
833	0.27
834	0.3
835	0.3
836	0.31
837	0.37
838	0.42
839	0.41
840	0.43
841	0.37
842	0.34
843	0.38
844	0.36
845	0.31
846	0.26
847	0.25
848	0.23
849	0.23
850	0.24
851	0.2
852	0.2
853	0.18
854	0.12
855	0.12
856	0.13
857	0.12
858	0.12
859	0.13
860	0.15
861	0.18
862	0.2
863	0.26
864	0.24
865	0.3
866	0.39
867	0.42
868	0.41
869	0.41
870	0.4
871	0.34
872	0.34
873	0.31
874	0.25
875	0.22
876	0.22
877	0.22
878	0.22
879	0.21
880	0.24
881	0.23
882	0.26
883	0.26
884	0.27
885	0.26
886	0.25
887	0.26
888	0.27
889	0.35
890	0.35
891	0.36
892	0.39
893	0.48
894	0.55
895	0.63
896	0.66
897	0.67
898	0.68
899	0.66
900	0.64
901	0.6
902	0.56
903	0.49
904	0.44
905	0.35
906	0.27
907	0.27
908	0.23
909	0.18

A0A178ABM7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer