FuNGI

A0A178ARJ8

Protein Details

Accession

A0A178ARJ8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-41	PPVANGQPPVRRPRPKKDGGALRAPRKP	Basic
523-548	EASGNESSRKKHKKNRDKLLDGSRKS	Basic
563-588	SEMTDAGKIKKHKKHKSRLVIGGSPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-44	PVRRPRPKKDGGALRAPRKPLKS
511-519	KGKKRPGSP
527-547	NESSRKKHKKNRDKLLDGSRK
569-580	GKIKKHKKHKSR

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNGQPPQGTAPAAPPVANGQPPVRRPRPKKDGGALRAPRKPLKSIARPLVSLTQMNEAKKDTPSSSAQPVDGRQELEKLKQEYLQQGATVSPLLVTRRDLKELRHHVMRLQNKSRVDIQDKEQFVPPIRLHRRDPRAPPSGAGSHFEEEETKEDLDEIKERERIELQKEDRRKIREENQAKIAPTGKTKAPAFQKKTEQKYRPDDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDFENKQTWVGQYESELSEAHVMLTTDPTNPHNPVYMAPMERWYRFNVKGKIKPTGDDVEKVMFKVENVPGFLRRMEIRAAQNALEEEKSRTRYGLSTRIGGGNDDEGRIRRGRNDDDGVGYVKRELDGDDIDFNLEEDFADDEEGLNGLFEGEAEEVKEAQEKLKRDQLNAALWERPDEMALALQEELEKKAAEEEKLLKKAQAKQIVKREKNYDMLDSDDENPYLTSSESDTDSETERLRAKEEEEKKALEANGKAPDGGNLASGASTKGTNTPSGNHRSVDIKGKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKNRDKLLDGSRKSSSLAHPRGAASGSDSEMTDAGKIKKHKKHKSRLVIGGSPSGSPGTSRAASPAASSQLNGSRAASPDAASPKPVIPSAKEIYESLPPEGMNIQALIAKFKGRVDKTNSPLFIKLVKAVSSFNKANSWLTPLAQMPSEESISASMNAAKPKPAAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.22
3	0.25
4	0.26
5	0.26
6	0.27
7	0.33
8	0.4
9	0.49
10	0.55
11	0.61
12	0.68
13	0.76
14	0.8
15	0.82
16	0.85
17	0.85
18	0.86
19	0.82
20	0.85
21	0.83
22	0.81
23	0.78
24	0.75
25	0.72
26	0.65
27	0.63
28	0.61
29	0.63
30	0.64
31	0.68
32	0.71
33	0.68
34	0.65
35	0.64
36	0.61
37	0.53
38	0.46
39	0.37
40	0.37
41	0.36
42	0.37
43	0.35
44	0.32
45	0.31
46	0.32
47	0.34
48	0.27
49	0.28
50	0.32
51	0.34
52	0.39
53	0.38
54	0.38
55	0.37
56	0.38
57	0.39
58	0.36
59	0.34
60	0.28
61	0.32
62	0.33
63	0.35
64	0.4
65	0.37
66	0.36
67	0.38
68	0.41
69	0.4
70	0.41
71	0.37
72	0.29
73	0.27
74	0.25
75	0.22
76	0.18
77	0.13
78	0.09
79	0.1
80	0.11
81	0.12
82	0.15
83	0.22
84	0.25
85	0.32
86	0.33
87	0.36
88	0.45
89	0.53
90	0.56
91	0.55
92	0.53
93	0.52
94	0.59
95	0.62
96	0.61
97	0.61
98	0.61
99	0.56
100	0.59
101	0.6
102	0.58
103	0.56
104	0.5
105	0.48
106	0.5
107	0.5
108	0.49
109	0.46
110	0.42
111	0.38
112	0.4
113	0.36
114	0.39
115	0.45
116	0.48
117	0.51
118	0.58
119	0.65
120	0.67
121	0.73
122	0.71
123	0.7
124	0.66
125	0.6
126	0.56
127	0.52
128	0.45
129	0.4
130	0.35
131	0.28
132	0.27
133	0.26
134	0.22
135	0.18
136	0.19
137	0.18
138	0.15
139	0.13
140	0.14
141	0.14
142	0.16
143	0.18
144	0.18
145	0.2
146	0.23
147	0.23
148	0.25
149	0.29
150	0.31
151	0.33
152	0.39
153	0.41
154	0.47
155	0.53
156	0.59
157	0.61
158	0.61
159	0.6
160	0.59
161	0.63
162	0.65
163	0.65
164	0.63
165	0.64
166	0.63
167	0.59
168	0.53
169	0.48
170	0.39
171	0.36
172	0.33
173	0.27
174	0.29
175	0.29
176	0.33
177	0.4
178	0.47
179	0.5
180	0.54
181	0.63
182	0.66
183	0.75
184	0.78
185	0.75
186	0.74
187	0.77
188	0.75
189	0.69
190	0.67
191	0.63
192	0.6
193	0.64
194	0.64
195	0.61
196	0.59
197	0.58
198	0.58
199	0.6
200	0.62
201	0.57
202	0.53
203	0.52
204	0.55
205	0.52
206	0.49
207	0.43
208	0.36
209	0.31
210	0.26
211	0.2
212	0.16
213	0.17
214	0.19
215	0.22
216	0.22
217	0.21
218	0.21
219	0.22
220	0.22
221	0.21
222	0.17
223	0.12
224	0.11
225	0.14
226	0.14
227	0.14
228	0.13
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.13
241	0.15
242	0.16
243	0.16
244	0.16
245	0.16
246	0.16
247	0.18
248	0.19
249	0.17
250	0.16
251	0.21
252	0.22
253	0.23
254	0.24
255	0.23
256	0.26
257	0.31
258	0.39
259	0.42
260	0.48
261	0.53
262	0.54
263	0.59
264	0.54
265	0.5
266	0.45
267	0.43
268	0.37
269	0.32
270	0.3
271	0.25
272	0.24
273	0.23
274	0.2
275	0.13
276	0.12
277	0.15
278	0.16
279	0.14
280	0.15
281	0.16
282	0.17
283	0.18
284	0.18
285	0.15
286	0.13
287	0.13
288	0.14
289	0.17
290	0.18
291	0.2
292	0.21
293	0.19
294	0.19
295	0.18
296	0.17
297	0.13
298	0.12
299	0.12
300	0.15
301	0.17
302	0.17
303	0.17
304	0.17
305	0.19
306	0.22
307	0.28
308	0.26
309	0.24
310	0.25
311	0.27
312	0.26
313	0.23
314	0.19
315	0.13
316	0.12
317	0.11
318	0.11
319	0.09
320	0.12
321	0.13
322	0.13
323	0.14
324	0.18
325	0.21
326	0.25
327	0.27
328	0.25
329	0.25
330	0.25
331	0.23
332	0.18
333	0.16
334	0.11
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.05
348	0.05
349	0.03
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.02
363	0.02
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.07
372	0.07
373	0.1
374	0.14
375	0.16
376	0.19
377	0.27
378	0.28
379	0.27
380	0.31
381	0.32
382	0.32
383	0.33
384	0.31
385	0.25
386	0.24
387	0.24
388	0.2
389	0.16
390	0.12
391	0.1
392	0.08
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.06
404	0.11
405	0.13
406	0.12
407	0.15
408	0.21
409	0.26
410	0.3
411	0.31
412	0.29
413	0.32
414	0.39
415	0.44
416	0.47
417	0.45
418	0.49
419	0.59
420	0.68
421	0.66
422	0.64
423	0.62
424	0.56
425	0.58
426	0.52
427	0.45
428	0.35
429	0.34
430	0.3
431	0.27
432	0.25
433	0.19
434	0.17
435	0.15
436	0.14
437	0.11
438	0.1
439	0.08
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.09
444	0.1
445	0.11
446	0.11
447	0.13
448	0.14
449	0.14
450	0.15
451	0.18
452	0.18
453	0.19
454	0.19
455	0.2
456	0.28
457	0.34
458	0.39
459	0.38
460	0.38
461	0.36
462	0.39
463	0.37
464	0.32
465	0.27
466	0.24
467	0.26
468	0.25
469	0.25
470	0.21
471	0.21
472	0.18
473	0.16
474	0.12
475	0.08
476	0.07
477	0.07
478	0.08
479	0.07
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.1
484	0.11
485	0.14
486	0.15
487	0.19
488	0.25
489	0.32
490	0.34
491	0.3
492	0.31
493	0.3
494	0.32
495	0.39
496	0.41
497	0.42
498	0.48
499	0.56
500	0.6
501	0.64
502	0.7
503	0.68
504	0.69
505	0.65
506	0.64
507	0.57
508	0.54
509	0.47
510	0.38
511	0.36
512	0.29
513	0.26
514	0.24
515	0.25
516	0.27
517	0.38
518	0.48
519	0.5
520	0.57
521	0.69
522	0.75
523	0.83
524	0.9
525	0.9
526	0.86
527	0.86
528	0.87
529	0.85
530	0.76
531	0.7
532	0.61
533	0.51
534	0.46
535	0.41
536	0.37
537	0.38
538	0.4
539	0.38
540	0.38
541	0.38
542	0.39
543	0.36
544	0.28
545	0.21
546	0.18
547	0.16
548	0.15
549	0.14
550	0.13
551	0.12
552	0.12
553	0.11
554	0.13
555	0.15
556	0.2
557	0.27
558	0.36
559	0.45
560	0.56
561	0.65
562	0.72
563	0.81
564	0.86
565	0.9
566	0.89
567	0.9
568	0.86
569	0.81
570	0.72
571	0.66
572	0.56
573	0.45
574	0.36
575	0.27
576	0.2
577	0.15
578	0.14
579	0.14
580	0.14
581	0.14
582	0.16
583	0.17
584	0.17
585	0.18
586	0.2
587	0.18
588	0.18
589	0.18
590	0.19
591	0.23
592	0.25
593	0.24
594	0.22
595	0.22
596	0.23
597	0.26
598	0.23
599	0.18
600	0.22
601	0.26
602	0.25
603	0.24
604	0.24
605	0.23
606	0.25
607	0.28
608	0.25
609	0.23
610	0.3
611	0.31
612	0.32
613	0.31
614	0.3
615	0.29
616	0.33
617	0.32
618	0.27
619	0.25
620	0.22
621	0.22
622	0.22
623	0.2
624	0.14
625	0.12
626	0.11
627	0.11
628	0.12
629	0.13
630	0.13
631	0.14
632	0.15
633	0.19
634	0.28
635	0.29
636	0.37
637	0.44
638	0.53
639	0.57
640	0.64
641	0.63
642	0.57
643	0.56
644	0.5
645	0.45
646	0.37
647	0.36
648	0.3
649	0.29
650	0.27
651	0.29
652	0.32
653	0.35
654	0.35
655	0.33
656	0.34
657	0.34
658	0.35
659	0.33
660	0.34
661	0.28
662	0.27
663	0.28
664	0.27
665	0.27
666	0.26
667	0.25
668	0.22
669	0.23
670	0.23
671	0.19
672	0.18
673	0.17
674	0.17
675	0.18
676	0.16
677	0.16
678	0.19
679	0.25
680	0.25
681	0.27

A0A178ARJ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer