Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AWW0

Protein Details
Accession A0A178AWW0    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
311-339RKGSVASVPKEKKRERRKSKGLASPTTPGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
310-331SRKGSVASVPKEKKRERRKSKG
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAMKVPLLDEQDFNFPLALSELEGQDINLANNFCWYFHSSQFFEPACNNSAILGHHRDDPATNYILHDRKIFDERLRSIPEGTQFVVSGEPQGEGQPWLYQRQNKMRNAEGQIETFVEGNWYNRGTQILMAPSLLDVVRARLLTVSTRLQQVAELSQNMTHWNPASGHSYFPSTYEAPKAAATASRIGSPTLAPADLEQSQESTAVQAADPAEATEDFSDALFMQSLMLTNRYGDEYMDENPLKGEPGAFVFTNTKNAVDERNKAQEQSAQAKSSQATALGVETRPPSVAPSVAATPKGGATPAPPEAHSRKGSVASVPKEKKRERRKSKGLASPTTPGVPPPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.18
3 0.16
4 0.16
5 0.14
6 0.1
7 0.12
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.11
12 0.12
13 0.13
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.16
19 0.17
20 0.15
21 0.17
22 0.21
23 0.22
24 0.26
25 0.32
26 0.31
27 0.32
28 0.39
29 0.36
30 0.33
31 0.32
32 0.31
33 0.28
34 0.26
35 0.24
36 0.17
37 0.19
38 0.18
39 0.21
40 0.23
41 0.21
42 0.24
43 0.25
44 0.25
45 0.25
46 0.27
47 0.25
48 0.22
49 0.21
50 0.19
51 0.26
52 0.28
53 0.28
54 0.27
55 0.25
56 0.27
57 0.32
58 0.33
59 0.3
60 0.35
61 0.38
62 0.41
63 0.44
64 0.42
65 0.38
66 0.37
67 0.37
68 0.31
69 0.28
70 0.23
71 0.18
72 0.18
73 0.17
74 0.14
75 0.12
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.11
84 0.12
85 0.17
86 0.21
87 0.25
88 0.32
89 0.42
90 0.5
91 0.52
92 0.55
93 0.55
94 0.57
95 0.57
96 0.55
97 0.46
98 0.39
99 0.34
100 0.3
101 0.26
102 0.19
103 0.15
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.06
123 0.05
124 0.06
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.11
152 0.14
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.06
181 0.06
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.18
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.15
231 0.13
232 0.11
233 0.06
234 0.09
235 0.11
236 0.1
237 0.12
238 0.15
239 0.16
240 0.21
241 0.2
242 0.19
243 0.18
244 0.19
245 0.25
246 0.26
247 0.3
248 0.31
249 0.39
250 0.39
251 0.39
252 0.39
253 0.36
254 0.37
255 0.4
256 0.39
257 0.31
258 0.31
259 0.33
260 0.32
261 0.3
262 0.24
263 0.17
264 0.13
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.15
279 0.18
280 0.2
281 0.21
282 0.19
283 0.18
284 0.18
285 0.17
286 0.15
287 0.11
288 0.11
289 0.15
290 0.2
291 0.21
292 0.21
293 0.28
294 0.32
295 0.39
296 0.39
297 0.36
298 0.35
299 0.36
300 0.37
301 0.37
302 0.41
303 0.41
304 0.49
305 0.55
306 0.59
307 0.66
308 0.73
309 0.77
310 0.8
311 0.84
312 0.85
313 0.88
314 0.91
315 0.92
316 0.93
317 0.92
318 0.9
319 0.87
320 0.8
321 0.74
322 0.67
323 0.59
324 0.49