Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AFD9

Protein Details
Accession A0A178AFD9    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-318GSEFPSRKVRKAEKKAIKAEKKEAKRMKKEGKSNVEMNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-312SRKVRKAEKKAIKAEKKEAKRMKKEGK
Subcellular Location(s) plas 23, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MTPDSKGYVPVTACNAQWSYSPSEPAALALSVLFGLLTLAHLILAIIFRKRFCWVIVMASAWETAAFVLRALGARNQQNQTLAIASQLFFLLAPLWINAFVYMTAGRLIYMLHPDKKIWGFKAMSLGKWFVWLDVFSFIVQGTGGSMLNPGNDANTQDAGKKIYMGGVGVQEAFILLFLGLIVKFHIDALRLDRQGLLVGTGMSRRAGMWKWVTYSLYAVLLLITMRIIFRLAEFSGGMEPEHNKLPFEEGYALGLDAVPMLLAIFILAAIHPGLVLKGEGSEFPSRKVRKAEKKAIKAEKKEAKRMKKEGKSNVEMNVMYTGTRESGDGLIHGGRHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.25
4 0.26
5 0.27
6 0.28
7 0.27
8 0.3
9 0.26
10 0.27
11 0.26
12 0.24
13 0.22
14 0.14
15 0.12
16 0.09
17 0.09
18 0.07
19 0.07
20 0.05
21 0.03
22 0.04
23 0.03
24 0.04
25 0.04
26 0.04
27 0.04
28 0.04
29 0.04
30 0.05
31 0.07
32 0.08
33 0.12
34 0.14
35 0.14
36 0.16
37 0.19
38 0.2
39 0.19
40 0.21
41 0.19
42 0.22
43 0.23
44 0.23
45 0.2
46 0.19
47 0.18
48 0.14
49 0.12
50 0.08
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.08
58 0.09
59 0.12
60 0.16
61 0.22
62 0.28
63 0.3
64 0.31
65 0.32
66 0.31
67 0.29
68 0.25
69 0.19
70 0.14
71 0.13
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.13
98 0.16
99 0.19
100 0.2
101 0.2
102 0.24
103 0.28
104 0.31
105 0.26
106 0.28
107 0.26
108 0.26
109 0.35
110 0.33
111 0.3
112 0.28
113 0.28
114 0.21
115 0.23
116 0.22
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.02
164 0.02
165 0.02
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.11
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.16
182 0.16
183 0.15
184 0.11
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.08
194 0.09
195 0.13
196 0.16
197 0.18
198 0.2
199 0.22
200 0.22
201 0.2
202 0.2
203 0.16
204 0.13
205 0.11
206 0.09
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.1
228 0.11
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.15
233 0.18
234 0.17
235 0.18
236 0.18
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.14
241 0.1
242 0.1
243 0.07
244 0.05
245 0.04
246 0.03
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.11
269 0.19
270 0.19
271 0.23
272 0.32
273 0.34
274 0.39
275 0.49
276 0.55
277 0.58
278 0.68
279 0.75
280 0.77
281 0.84
282 0.89
283 0.9
284 0.89
285 0.85
286 0.85
287 0.84
288 0.82
289 0.83
290 0.83
291 0.82
292 0.83
293 0.86
294 0.87
295 0.86
296 0.88
297 0.87
298 0.87
299 0.83
300 0.77
301 0.71
302 0.65
303 0.56
304 0.48
305 0.4
306 0.3
307 0.23
308 0.2
309 0.17
310 0.12
311 0.13
312 0.11
313 0.1
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.13
318 0.14