Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178A741

Protein Details
Accession A0A178A741    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-40PQTEPPPKRTRAVKPPPTRRTKESVFHydrophilic
139-158KPDGKKGPSKIQRQIRNATHHydrophilic
1073-1097EETPPSTRSVPRRKAAKKSDAMVKSHydrophilic
1114-1133TDRMSPRKEKGRAGRARGSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-31KRTRAVKPPP
230-231KK
264-268KGKGK
571-592RTKGFRMPIEKIPIHNKRGKVK
1039-1058RGRPGRGATKAAPSSSTRRR
1119-1143PRKEKGRAGRARGSGRGSGRGKGRF
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 4, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPVLSRKRLPSDSPQTEPPPKRTRAVKPPPTRRTKESVFQTLDTAPKVKRTLSQTKAFLEQGSDDSELSEPESSEGDFEDVPLNGSANKDSDESAEDDWEDALGGHHPVKHDNGPAPVITGDIALTLSAAPKTAFDTKPDGKKGPSKIQRQIRNATHCMHVQFLMFHNLMRNAWIQDREVQKILVERLSSSCWDEIERYWRDAGISDGPTRVVVERPAAPKTPQQAKGKKGKWTESGSKGVQVFESPQSKRSGAEETRNRTSKGKGKETPKSDRSARDWGATSEPLEPNTPNLSAGDPLMRLLRYLSAYWKSKFRITAPGLRKRGYLSPITLEAEINAWKDSPSHPDMFGERIETLKSFRDVARECEGSRDVGEQLFTAMLRGLGIEARMIVSLQPAGFGFSQAEEGRPKNIQKLKDVIKEQAQTKTQSTPAKGRLPQRAATRNKKTPINLDTSEDSDLSSVISISSDTDQGKFVKRSPKRRNYSEELPYPTYWTEVISNLTHTPISVSPLPRVLIASASSPDKLQDFYAKGAAADKARQVLAYLIAFSSDGTAKDVTIRYLPKRQWPGRTKGFRMPIEKIPIHNKRGKVKRWEEWDWFKSLMRPYARAHDKRQPWDEVEDEGDLVPVEPEKKKEMDEEGGKETLQGYKSSSEYVLERHLRREEALKPGAKVVRQFVSGKGDNEKSEPVYRRKDIVNCKTVESWHKEGREVKEGQQPLKFVPMRAVTVTRKREIEERERDEGVKPKQGLYSRAQTDWIIPPPIEDGKIPRNAFNNIDVYVPTMVPKGAVHIPLRGTARICRKMNIEHAEACTGFEFGKQRAVPILTGVVVAAENEDTVIDAWEVEEAAKAKKEADKREKLVLGLWKKFMSGLRIVERMKFEYGDDVELPAKQFAPAPKIKSKEKNSEWEVFQNHDDFEGGFLRDDGPPERTSPRREPEHIHDGDDVAGGFFPASQEEPEHGDLTIDHGDQAIRNRTAVVEASYQTPTSLSSALQEPKPTSSSHNPDDDSIASISKATDPRLSNSPVHLLPSSSTKPTRGRPGRGATKAAPSSSTRRRRAMNDLPSSDDEQREETPPSTRSVPRRKAAKKSDAMVKSHFFADGSEAETDLTDLTDRMSPRKEKGRAGRARGSGRGSGRGKGRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.67
3 0.67
4 0.72
5 0.73
6 0.72
7 0.7
8 0.67
9 0.7
10 0.71
11 0.73
12 0.74
13 0.79
14 0.8
15 0.81
16 0.88
17 0.91
18 0.93
19 0.89
20 0.85
21 0.82
22 0.79
23 0.77
24 0.75
25 0.74
26 0.68
27 0.62
28 0.59
29 0.54
30 0.5
31 0.43
32 0.39
33 0.31
34 0.33
35 0.34
36 0.33
37 0.36
38 0.41
39 0.49
40 0.52
41 0.6
42 0.58
43 0.59
44 0.62
45 0.57
46 0.49
47 0.4
48 0.35
49 0.28
50 0.26
51 0.24
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.16
56 0.15
57 0.14
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.11
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.13
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.16
85 0.16
86 0.15
87 0.13
88 0.1
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.09
93 0.11
94 0.13
95 0.14
96 0.17
97 0.21
98 0.25
99 0.29
100 0.31
101 0.32
102 0.33
103 0.32
104 0.3
105 0.26
106 0.22
107 0.17
108 0.13
109 0.09
110 0.07
111 0.07
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.12
121 0.2
122 0.21
123 0.23
124 0.31
125 0.38
126 0.47
127 0.52
128 0.51
129 0.49
130 0.56
131 0.6
132 0.63
133 0.65
134 0.65
135 0.69
136 0.75
137 0.8
138 0.79
139 0.81
140 0.79
141 0.78
142 0.73
143 0.66
144 0.61
145 0.54
146 0.48
147 0.41
148 0.33
149 0.25
150 0.23
151 0.23
152 0.24
153 0.21
154 0.2
155 0.22
156 0.22
157 0.21
158 0.22
159 0.22
160 0.19
161 0.23
162 0.24
163 0.22
164 0.27
165 0.31
166 0.33
167 0.32
168 0.3
169 0.27
170 0.29
171 0.3
172 0.27
173 0.23
174 0.2
175 0.21
176 0.23
177 0.23
178 0.21
179 0.2
180 0.17
181 0.18
182 0.19
183 0.2
184 0.26
185 0.28
186 0.27
187 0.27
188 0.27
189 0.25
190 0.24
191 0.24
192 0.22
193 0.22
194 0.21
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.21
199 0.18
200 0.14
201 0.13
202 0.15
203 0.2
204 0.23
205 0.27
206 0.28
207 0.29
208 0.33
209 0.39
210 0.45
211 0.48
212 0.54
213 0.59
214 0.64
215 0.73
216 0.73
217 0.73
218 0.71
219 0.7
220 0.67
221 0.68
222 0.68
223 0.64
224 0.65
225 0.57
226 0.55
227 0.49
228 0.42
229 0.34
230 0.27
231 0.24
232 0.23
233 0.3
234 0.26
235 0.28
236 0.32
237 0.32
238 0.32
239 0.31
240 0.34
241 0.31
242 0.4
243 0.45
244 0.49
245 0.57
246 0.59
247 0.59
248 0.53
249 0.56
250 0.53
251 0.54
252 0.57
253 0.55
254 0.61
255 0.68
256 0.73
257 0.76
258 0.72
259 0.7
260 0.65
261 0.65
262 0.61
263 0.61
264 0.55
265 0.49
266 0.46
267 0.42
268 0.4
269 0.35
270 0.3
271 0.27
272 0.26
273 0.23
274 0.23
275 0.21
276 0.2
277 0.21
278 0.2
279 0.15
280 0.15
281 0.14
282 0.13
283 0.14
284 0.13
285 0.1
286 0.1
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.18
295 0.23
296 0.28
297 0.3
298 0.35
299 0.35
300 0.37
301 0.4
302 0.37
303 0.4
304 0.4
305 0.48
306 0.51
307 0.58
308 0.59
309 0.56
310 0.55
311 0.47
312 0.48
313 0.42
314 0.37
315 0.29
316 0.27
317 0.29
318 0.3
319 0.27
320 0.22
321 0.18
322 0.16
323 0.15
324 0.13
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.1
329 0.11
330 0.16
331 0.19
332 0.2
333 0.2
334 0.22
335 0.23
336 0.24
337 0.23
338 0.19
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.22
349 0.23
350 0.27
351 0.31
352 0.3
353 0.29
354 0.31
355 0.31
356 0.24
357 0.23
358 0.2
359 0.15
360 0.13
361 0.14
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.07
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.1
391 0.1
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.16
396 0.19
397 0.2
398 0.25
399 0.3
400 0.31
401 0.32
402 0.39
403 0.44
404 0.48
405 0.49
406 0.44
407 0.45
408 0.47
409 0.46
410 0.44
411 0.4
412 0.35
413 0.35
414 0.34
415 0.34
416 0.33
417 0.34
418 0.34
419 0.38
420 0.42
421 0.45
422 0.49
423 0.52
424 0.52
425 0.54
426 0.55
427 0.58
428 0.6
429 0.65
430 0.68
431 0.66
432 0.67
433 0.66
434 0.61
435 0.59
436 0.54
437 0.51
438 0.43
439 0.39
440 0.36
441 0.33
442 0.32
443 0.24
444 0.2
445 0.13
446 0.12
447 0.08
448 0.07
449 0.05
450 0.03
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.05
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.11
459 0.12
460 0.17
461 0.18
462 0.21
463 0.29
464 0.36
465 0.46
466 0.56
467 0.65
468 0.68
469 0.74
470 0.77
471 0.75
472 0.76
473 0.72
474 0.67
475 0.62
476 0.57
477 0.5
478 0.44
479 0.36
480 0.29
481 0.21
482 0.16
483 0.12
484 0.1
485 0.12
486 0.1
487 0.12
488 0.11
489 0.12
490 0.11
491 0.09
492 0.1
493 0.08
494 0.11
495 0.13
496 0.14
497 0.14
498 0.16
499 0.16
500 0.15
501 0.15
502 0.12
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.11
515 0.12
516 0.13
517 0.14
518 0.14
519 0.13
520 0.14
521 0.15
522 0.12
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.1
529 0.09
530 0.09
531 0.08
532 0.07
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.05
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.12
547 0.15
548 0.17
549 0.23
550 0.25
551 0.3
552 0.39
553 0.43
554 0.5
555 0.53
556 0.58
557 0.61
558 0.66
559 0.63
560 0.6
561 0.63
562 0.57
563 0.55
564 0.51
565 0.45
566 0.46
567 0.43
568 0.39
569 0.4
570 0.42
571 0.44
572 0.44
573 0.44
574 0.47
575 0.54
576 0.58
577 0.59
578 0.6
579 0.61
580 0.64
581 0.65
582 0.63
583 0.62
584 0.57
585 0.5
586 0.45
587 0.39
588 0.35
589 0.31
590 0.3
591 0.23
592 0.25
593 0.23
594 0.32
595 0.4
596 0.4
597 0.44
598 0.46
599 0.51
600 0.54
601 0.57
602 0.51
603 0.44
604 0.42
605 0.38
606 0.31
607 0.26
608 0.19
609 0.15
610 0.12
611 0.1
612 0.07
613 0.06
614 0.05
615 0.04
616 0.06
617 0.07
618 0.09
619 0.11
620 0.13
621 0.13
622 0.15
623 0.18
624 0.21
625 0.24
626 0.26
627 0.26
628 0.25
629 0.24
630 0.22
631 0.2
632 0.17
633 0.14
634 0.12
635 0.1
636 0.12
637 0.12
638 0.13
639 0.13
640 0.11
641 0.11
642 0.12
643 0.17
644 0.22
645 0.22
646 0.25
647 0.27
648 0.26
649 0.26
650 0.3
651 0.26
652 0.27
653 0.32
654 0.3
655 0.28
656 0.32
657 0.33
658 0.3
659 0.28
660 0.24
661 0.21
662 0.22
663 0.22
664 0.2
665 0.25
666 0.26
667 0.26
668 0.27
669 0.27
670 0.25
671 0.26
672 0.25
673 0.2
674 0.25
675 0.29
676 0.31
677 0.36
678 0.37
679 0.38
680 0.41
681 0.46
682 0.5
683 0.53
684 0.53
685 0.48
686 0.48
687 0.46
688 0.45
689 0.44
690 0.4
691 0.38
692 0.36
693 0.36
694 0.38
695 0.42
696 0.44
697 0.44
698 0.4
699 0.38
700 0.4
701 0.42
702 0.41
703 0.38
704 0.34
705 0.28
706 0.34
707 0.31
708 0.23
709 0.26
710 0.25
711 0.24
712 0.25
713 0.29
714 0.26
715 0.34
716 0.38
717 0.36
718 0.35
719 0.35
720 0.4
721 0.42
722 0.46
723 0.47
724 0.49
725 0.5
726 0.5
727 0.49
728 0.46
729 0.47
730 0.41
731 0.37
732 0.32
733 0.3
734 0.33
735 0.35
736 0.37
737 0.33
738 0.38
739 0.34
740 0.34
741 0.34
742 0.3
743 0.3
744 0.3
745 0.28
746 0.21
747 0.18
748 0.18
749 0.19
750 0.2
751 0.17
752 0.14
753 0.15
754 0.2
755 0.27
756 0.28
757 0.28
758 0.3
759 0.32
760 0.33
761 0.32
762 0.28
763 0.22
764 0.22
765 0.18
766 0.17
767 0.15
768 0.13
769 0.11
770 0.09
771 0.08
772 0.08
773 0.08
774 0.1
775 0.11
776 0.16
777 0.16
778 0.18
779 0.19
780 0.23
781 0.25
782 0.23
783 0.22
784 0.24
785 0.33
786 0.39
787 0.39
788 0.38
789 0.4
790 0.43
791 0.5
792 0.49
793 0.43
794 0.37
795 0.37
796 0.37
797 0.33
798 0.29
799 0.21
800 0.16
801 0.12
802 0.12
803 0.13
804 0.11
805 0.18
806 0.18
807 0.18
808 0.21
809 0.22
810 0.19
811 0.18
812 0.18
813 0.11
814 0.11
815 0.1
816 0.07
817 0.06
818 0.06
819 0.05
820 0.04
821 0.04
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.04
826 0.05
827 0.04
828 0.04
829 0.04
830 0.05
831 0.05
832 0.05
833 0.06
834 0.07
835 0.09
836 0.1
837 0.1
838 0.13
839 0.18
840 0.25
841 0.34
842 0.43
843 0.51
844 0.53
845 0.6
846 0.59
847 0.54
848 0.52
849 0.51
850 0.48
851 0.43
852 0.42
853 0.35
854 0.33
855 0.35
856 0.32
857 0.27
858 0.24
859 0.26
860 0.27
861 0.33
862 0.34
863 0.35
864 0.36
865 0.34
866 0.31
867 0.27
868 0.23
869 0.22
870 0.23
871 0.22
872 0.19
873 0.18
874 0.17
875 0.18
876 0.18
877 0.14
878 0.13
879 0.11
880 0.14
881 0.15
882 0.22
883 0.26
884 0.32
885 0.38
886 0.43
887 0.51
888 0.58
889 0.63
890 0.66
891 0.67
892 0.7
893 0.69
894 0.7
895 0.65
896 0.62
897 0.56
898 0.48
899 0.44
900 0.36
901 0.31
902 0.24
903 0.22
904 0.15
905 0.14
906 0.13
907 0.12
908 0.1
909 0.1
910 0.12
911 0.12
912 0.14
913 0.15
914 0.16
915 0.16
916 0.2
917 0.26
918 0.3
919 0.37
920 0.44
921 0.5
922 0.54
923 0.57
924 0.61
925 0.62
926 0.67
927 0.6
928 0.54
929 0.47
930 0.4
931 0.36
932 0.29
933 0.21
934 0.11
935 0.1
936 0.07
937 0.06
938 0.05
939 0.05
940 0.06
941 0.07
942 0.07
943 0.09
944 0.11
945 0.15
946 0.17
947 0.18
948 0.16
949 0.15
950 0.14
951 0.17
952 0.18
953 0.14
954 0.12
955 0.12
956 0.12
957 0.14
958 0.21
959 0.24
960 0.22
961 0.22
962 0.23
963 0.22
964 0.24
965 0.23
966 0.2
967 0.16
968 0.17
969 0.19
970 0.2
971 0.2
972 0.18
973 0.17
974 0.15
975 0.13
976 0.13
977 0.1
978 0.12
979 0.18
980 0.22
981 0.24
982 0.27
983 0.27
984 0.29
985 0.31
986 0.3
987 0.31
988 0.36
989 0.42
990 0.43
991 0.48
992 0.46
993 0.45
994 0.47
995 0.4
996 0.33
997 0.26
998 0.22
999 0.16
1000 0.15
1001 0.14
1002 0.17
1003 0.18
1004 0.18
1005 0.24
1006 0.26
1007 0.3
1008 0.36
1009 0.39
1010 0.36
1011 0.37
1012 0.4
1013 0.34
1014 0.36
1015 0.32
1016 0.27
1017 0.24
1018 0.3
1019 0.3
1020 0.3
1021 0.32
1022 0.35
1023 0.41
1024 0.47
1025 0.57
1026 0.58
1027 0.62
1028 0.65
1029 0.73
1030 0.77
1031 0.75
1032 0.74
1033 0.66
1034 0.66
1035 0.62
1036 0.54
1037 0.47
1038 0.41
1039 0.45
1040 0.5
1041 0.57
1042 0.54
1043 0.57
1044 0.63
1045 0.65
1046 0.71
1047 0.72
1048 0.72
1049 0.71
1050 0.67
1051 0.66
1052 0.64
1053 0.63
1054 0.56
1055 0.48
1056 0.4
1057 0.34
1058 0.34
1059 0.31
1060 0.31
1061 0.28
1062 0.29
1063 0.29
1064 0.31
1065 0.33
1066 0.38
1067 0.45
1068 0.53
1069 0.6
1070 0.64
1071 0.73
1072 0.77
1073 0.82
1074 0.85
1075 0.85
1076 0.81
1077 0.79
1078 0.81
1079 0.76
1080 0.72
1081 0.67
1082 0.6
1083 0.52
1084 0.45
1085 0.39
1086 0.29
1087 0.23
1088 0.23
1089 0.18
1090 0.18
1091 0.16
1092 0.15
1093 0.15
1094 0.15
1095 0.14
1096 0.1
1097 0.09
1098 0.07
1099 0.07
1100 0.08
1101 0.13
1102 0.14
1103 0.19
1104 0.27
1105 0.32
1106 0.39
1107 0.5
1108 0.54
1109 0.6
1110 0.69
1111 0.74
1112 0.76
1113 0.8
1114 0.81
1115 0.79
1116 0.78
1117 0.74
1118 0.69
1119 0.65
1120 0.59
1121 0.6
1122 0.53
1123 0.51