Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178A7V4

Protein Details
Accession A0A178A7V4    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSSRSKPKPRRAYDGDGSAFHydrophilic
65-84SPIGRKSSSRKQKPVGIVSSHydrophilic
183-208RKAMAAKKAKASKKRKPKTVSSESDSHydrophilic
216-242VAPTSKPKSKATKKKAKPTKKHATSEGHydrophilic
570-590IAEKKEARKARKTANEANVSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-141RK
183-200RKAMAAKKAKASKKRKPK
221-237KPKSKATKKKAKPTKKH
277-284ERAERRAR
571-581AEKKEARKARK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSSRSKPKPRRAYDGDGSAFDSDESHYIANMKASAYSNKHTSGKLASHHSAKQLVTSEEEDEGDSPIGRKSSSRKQKPVGIVSSNNSVTQRKSTTTKRRLTDCNSSDARSTHKRRRYSLSTNVTGPDSKHASGKPPSSHRKAKKVTTSEESSEEDSDAEHIVTEEDALDVFLRQTAAANIATRKAMAAKKAKASKKRKPKTVSSESDSPDISDVPVAPTSKPKSKATKKKAKPTKKHATSEGPDTSLDEAVLSTATERQRKRSEAIAVEARAALKAERAERRARAAEAAKQANAPKAEPQTIEAMEAHIRESTKKLEKMKVEKQTQKDFLAMKKGTTLDLSRGNIIPTTFATKVKTGAPPTMQPNGKTTSTPELQELQDIKAALASTAKHADLPPTGFGAESEGDKVVFGHIYGARKGCQLGLCKAPFLFPNGQCQKGLACPHRHAWPTLKQMEYLASQPDEAARQAFRTFCATKYAIWRDNWERFYKNTVRDEPVPKAMYVRALANTRTRNIQQPIEAEDASFMEERKEAQQGWDGYPAGNMHGSDAPRQANLESSSEDEEIKALRRLIAEKKEARKARKTANEANVSSTEGGVKLENGPAVPGPTVKKEKDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.72
3 0.63
4 0.57
5 0.47
6 0.39
7 0.29
8 0.22
9 0.14
10 0.13
11 0.13
12 0.11
13 0.11
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.15
18 0.14
19 0.16
20 0.18
21 0.25
22 0.28
23 0.32
24 0.35
25 0.39
26 0.42
27 0.39
28 0.4
29 0.39
30 0.39
31 0.4
32 0.43
33 0.43
34 0.46
35 0.48
36 0.49
37 0.48
38 0.43
39 0.41
40 0.38
41 0.34
42 0.32
43 0.31
44 0.28
45 0.24
46 0.24
47 0.21
48 0.17
49 0.17
50 0.14
51 0.13
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.16
57 0.22
58 0.32
59 0.43
60 0.53
61 0.6
62 0.66
63 0.74
64 0.79
65 0.8
66 0.77
67 0.72
68 0.66
69 0.6
70 0.6
71 0.53
72 0.46
73 0.4
74 0.35
75 0.31
76 0.32
77 0.32
78 0.3
79 0.36
80 0.44
81 0.53
82 0.61
83 0.67
84 0.67
85 0.71
86 0.75
87 0.75
88 0.75
89 0.67
90 0.65
91 0.59
92 0.55
93 0.51
94 0.43
95 0.43
96 0.43
97 0.49
98 0.51
99 0.56
100 0.62
101 0.64
102 0.72
103 0.74
104 0.72
105 0.74
106 0.73
107 0.69
108 0.63
109 0.59
110 0.52
111 0.45
112 0.37
113 0.33
114 0.28
115 0.24
116 0.27
117 0.26
118 0.31
119 0.36
120 0.42
121 0.43
122 0.48
123 0.57
124 0.61
125 0.7
126 0.72
127 0.76
128 0.77
129 0.78
130 0.78
131 0.76
132 0.74
133 0.71
134 0.68
135 0.6
136 0.56
137 0.5
138 0.42
139 0.35
140 0.29
141 0.22
142 0.16
143 0.14
144 0.12
145 0.09
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.09
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.16
172 0.17
173 0.22
174 0.29
175 0.32
176 0.4
177 0.49
178 0.56
179 0.61
180 0.69
181 0.71
182 0.75
183 0.8
184 0.82
185 0.8
186 0.83
187 0.83
188 0.83
189 0.8
190 0.76
191 0.73
192 0.66
193 0.61
194 0.5
195 0.4
196 0.31
197 0.24
198 0.17
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.17
206 0.22
207 0.28
208 0.32
209 0.37
210 0.45
211 0.55
212 0.66
213 0.7
214 0.76
215 0.78
216 0.85
217 0.89
218 0.9
219 0.89
220 0.89
221 0.89
222 0.88
223 0.84
224 0.79
225 0.77
226 0.69
227 0.66
228 0.57
229 0.47
230 0.38
231 0.34
232 0.28
233 0.19
234 0.16
235 0.09
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.04
240 0.04
241 0.08
242 0.12
243 0.18
244 0.19
245 0.26
246 0.31
247 0.34
248 0.36
249 0.37
250 0.39
251 0.35
252 0.39
253 0.36
254 0.31
255 0.29
256 0.27
257 0.22
258 0.16
259 0.14
260 0.1
261 0.07
262 0.09
263 0.14
264 0.17
265 0.21
266 0.25
267 0.26
268 0.3
269 0.3
270 0.28
271 0.28
272 0.26
273 0.28
274 0.3
275 0.3
276 0.26
277 0.26
278 0.27
279 0.26
280 0.24
281 0.19
282 0.17
283 0.18
284 0.19
285 0.18
286 0.18
287 0.17
288 0.17
289 0.17
290 0.13
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.08
296 0.09
297 0.08
298 0.1
299 0.15
300 0.19
301 0.24
302 0.28
303 0.33
304 0.39
305 0.46
306 0.53
307 0.56
308 0.59
309 0.61
310 0.62
311 0.64
312 0.61
313 0.54
314 0.5
315 0.43
316 0.37
317 0.39
318 0.33
319 0.26
320 0.25
321 0.24
322 0.21
323 0.2
324 0.19
325 0.14
326 0.18
327 0.18
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.16
332 0.15
333 0.13
334 0.09
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.15
340 0.17
341 0.19
342 0.22
343 0.2
344 0.22
345 0.22
346 0.24
347 0.28
348 0.33
349 0.32
350 0.29
351 0.3
352 0.31
353 0.3
354 0.26
355 0.25
356 0.24
357 0.24
358 0.24
359 0.23
360 0.22
361 0.21
362 0.24
363 0.23
364 0.18
365 0.18
366 0.17
367 0.15
368 0.13
369 0.13
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.13
379 0.14
380 0.15
381 0.13
382 0.13
383 0.13
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.06
396 0.05
397 0.08
398 0.11
399 0.13
400 0.15
401 0.17
402 0.17
403 0.18
404 0.18
405 0.17
406 0.18
407 0.2
408 0.22
409 0.28
410 0.27
411 0.28
412 0.27
413 0.27
414 0.23
415 0.25
416 0.29
417 0.22
418 0.33
419 0.36
420 0.37
421 0.36
422 0.36
423 0.32
424 0.29
425 0.35
426 0.32
427 0.34
428 0.36
429 0.39
430 0.45
431 0.46
432 0.44
433 0.43
434 0.44
435 0.47
436 0.5
437 0.47
438 0.41
439 0.4
440 0.39
441 0.34
442 0.27
443 0.21
444 0.16
445 0.15
446 0.15
447 0.15
448 0.14
449 0.13
450 0.13
451 0.1
452 0.12
453 0.14
454 0.14
455 0.15
456 0.2
457 0.21
458 0.2
459 0.26
460 0.25
461 0.26
462 0.35
463 0.41
464 0.4
465 0.4
466 0.47
467 0.48
468 0.55
469 0.56
470 0.52
471 0.47
472 0.43
473 0.51
474 0.51
475 0.5
476 0.51
477 0.52
478 0.53
479 0.57
480 0.61
481 0.57
482 0.57
483 0.51
484 0.43
485 0.4
486 0.35
487 0.32
488 0.28
489 0.26
490 0.22
491 0.24
492 0.26
493 0.32
494 0.34
495 0.33
496 0.37
497 0.37
498 0.41
499 0.43
500 0.44
501 0.41
502 0.39
503 0.42
504 0.4
505 0.38
506 0.29
507 0.25
508 0.21
509 0.2
510 0.18
511 0.13
512 0.1
513 0.11
514 0.13
515 0.15
516 0.18
517 0.16
518 0.18
519 0.25
520 0.27
521 0.29
522 0.32
523 0.3
524 0.26
525 0.28
526 0.26
527 0.2
528 0.19
529 0.16
530 0.14
531 0.17
532 0.19
533 0.2
534 0.24
535 0.24
536 0.23
537 0.24
538 0.22
539 0.23
540 0.24
541 0.24
542 0.21
543 0.22
544 0.25
545 0.24
546 0.24
547 0.19
548 0.18
549 0.17
550 0.19
551 0.2
552 0.17
553 0.19
554 0.21
555 0.26
556 0.34
557 0.41
558 0.47
559 0.52
560 0.59
561 0.67
562 0.72
563 0.75
564 0.76
565 0.76
566 0.77
567 0.78
568 0.79
569 0.79
570 0.81
571 0.81
572 0.72
573 0.69
574 0.6
575 0.52
576 0.44
577 0.35
578 0.26
579 0.17
580 0.17
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.14
585 0.15
586 0.14
587 0.15
588 0.15
589 0.17
590 0.16
591 0.18
592 0.2
593 0.27
594 0.35