Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178BCD0

Protein Details
Accession A0A178BCD0    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-62STNFDGEKDRPPKRQRTGDSPKKPPPTPRKFANREVPDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-53KDRPPKRQRTGDSPKKPPPTPRK
278-279KK
283-284KA
286-286R
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033315  Fan1-like  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR014883  VRR_NUC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004528  F:phosphodiesterase I activity  
GO:0036297  P:interstrand cross-link repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF08774  VRR_NUC  
CDD cd22326  FAN1-like  
Amino Acid Sequences MALNPQSTSKHNQMITRFIKHPKSTNFDGEKDRPPKRQRTGDSPKKPPPTPRKFANREVPDSDAEDDDEDVKTEHKDEAERKTDLESALPVIKVDDEAIEAYEAFKASQEDNTDEAGERLEKRAWVRGKSSLYVDAFNLALDTVLEDESHLFDEAETDLFRVWRELNYEAQYLYVRLFLRKTSTWHRIKNLGYHSDISDLDAAVETLQQTHELPASSAEVESHPGELEPPPGTTLGLSFTFADRSEEEITTLEEASSLLKLDELKALAKDAKVQGKNKKDLLKALRRTSRKQTGLGHVGLKRSDSEVSRRSSASAPGSRAVTPENEASPGPVEDLSDDANRDSHFRRKIMNETGPCIRLSLPTLKLFERVHLVFYRSTEWTEKSLTTIILAKIARWNFPEYIVSRSANIFASRSLLLEYEASIRTQFRIDNILEFNGRPTEKDYDEIMDTFDEVYPRWQLLCEEEQRKEDSIYHSGEGSYLRRLSPAWVYTRIIHKALYVLGRRKEHKREHELLTELLGQRLFHHSRRGAWYQRKALLEEHYMAALTDHEKRNEDQQKKHWKRISLATCEEGLQDRFVHIIHHYDLQKRVTKLEKSLSIPRRLQHDFGHVRLTKPVEVTMEGTRIERDRPSLPRRNSSPHPNSGKRGGKTIWIDPREDGECSVEAMCLSHYRNQGWKGYHSEGGIVRTLFAYLFFDVLFSYIPNVFQTPYQTCPLDLHTDAFYPSRISEINARLNEISNGDAPSIMQRVYDDHHERRTCVVGLDWSFDIIDLVEIARCFDGEALATVCKVMAQEYGQRGGGVPDLFLWKVADEDGSEGEVKFAEVKSENDRLSDTQRLWLHVLSGAGVKVELCAAVAKEVRVVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.58
3 0.58
4 0.57
5 0.58
6 0.64
7 0.64
8 0.69
9 0.67
10 0.68
11 0.67
12 0.71
13 0.69
14 0.65
15 0.68
16 0.65
17 0.66
18 0.68
19 0.69
20 0.69
21 0.72
22 0.78
23 0.79
24 0.83
25 0.8
26 0.82
27 0.86
28 0.87
29 0.88
30 0.87
31 0.87
32 0.86
33 0.84
34 0.83
35 0.83
36 0.83
37 0.81
38 0.81
39 0.82
40 0.81
41 0.84
42 0.84
43 0.81
44 0.78
45 0.73
46 0.67
47 0.58
48 0.54
49 0.46
50 0.36
51 0.29
52 0.23
53 0.2
54 0.17
55 0.15
56 0.13
57 0.11
58 0.12
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.22
64 0.27
65 0.36
66 0.41
67 0.41
68 0.4
69 0.41
70 0.42
71 0.35
72 0.31
73 0.23
74 0.2
75 0.22
76 0.21
77 0.18
78 0.16
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.1
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.15
96 0.17
97 0.19
98 0.2
99 0.22
100 0.22
101 0.2
102 0.19
103 0.17
104 0.17
105 0.16
106 0.17
107 0.18
108 0.2
109 0.22
110 0.31
111 0.35
112 0.37
113 0.39
114 0.44
115 0.47
116 0.46
117 0.47
118 0.45
119 0.41
120 0.37
121 0.34
122 0.27
123 0.23
124 0.19
125 0.16
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.07
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.15
152 0.17
153 0.22
154 0.25
155 0.26
156 0.23
157 0.24
158 0.22
159 0.19
160 0.17
161 0.16
162 0.14
163 0.15
164 0.16
165 0.17
166 0.22
167 0.23
168 0.29
169 0.33
170 0.43
171 0.49
172 0.55
173 0.58
174 0.6
175 0.61
176 0.62
177 0.61
178 0.55
179 0.5
180 0.45
181 0.41
182 0.36
183 0.33
184 0.27
185 0.21
186 0.15
187 0.12
188 0.11
189 0.1
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.1
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.12
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.13
230 0.11
231 0.15
232 0.17
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.16
237 0.15
238 0.14
239 0.1
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.17
257 0.2
258 0.28
259 0.32
260 0.39
261 0.45
262 0.52
263 0.58
264 0.59
265 0.61
266 0.55
267 0.58
268 0.61
269 0.62
270 0.61
271 0.65
272 0.67
273 0.66
274 0.69
275 0.7
276 0.71
277 0.64
278 0.61
279 0.58
280 0.58
281 0.58
282 0.54
283 0.5
284 0.42
285 0.4
286 0.35
287 0.3
288 0.23
289 0.19
290 0.2
291 0.16
292 0.21
293 0.24
294 0.28
295 0.29
296 0.29
297 0.29
298 0.28
299 0.3
300 0.3
301 0.29
302 0.27
303 0.27
304 0.28
305 0.26
306 0.26
307 0.23
308 0.17
309 0.15
310 0.15
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.09
323 0.08
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.12
329 0.14
330 0.2
331 0.24
332 0.25
333 0.29
334 0.32
335 0.39
336 0.44
337 0.49
338 0.43
339 0.42
340 0.44
341 0.4
342 0.36
343 0.3
344 0.23
345 0.16
346 0.17
347 0.19
348 0.19
349 0.21
350 0.23
351 0.22
352 0.27
353 0.26
354 0.24
355 0.23
356 0.2
357 0.2
358 0.2
359 0.21
360 0.17
361 0.18
362 0.2
363 0.16
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.18
369 0.17
370 0.15
371 0.15
372 0.13
373 0.12
374 0.14
375 0.12
376 0.14
377 0.14
378 0.13
379 0.17
380 0.18
381 0.19
382 0.17
383 0.2
384 0.16
385 0.17
386 0.2
387 0.16
388 0.19
389 0.2
390 0.19
391 0.17
392 0.17
393 0.17
394 0.15
395 0.14
396 0.11
397 0.08
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.14
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.12
424 0.12
425 0.1
426 0.13
427 0.15
428 0.15
429 0.17
430 0.17
431 0.15
432 0.16
433 0.16
434 0.13
435 0.1
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.1
448 0.15
449 0.2
450 0.24
451 0.25
452 0.27
453 0.29
454 0.29
455 0.26
456 0.24
457 0.21
458 0.21
459 0.21
460 0.19
461 0.18
462 0.17
463 0.17
464 0.16
465 0.13
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.11
471 0.13
472 0.15
473 0.17
474 0.18
475 0.2
476 0.21
477 0.23
478 0.28
479 0.29
480 0.26
481 0.23
482 0.19
483 0.18
484 0.18
485 0.21
486 0.2
487 0.24
488 0.28
489 0.33
490 0.37
491 0.43
492 0.5
493 0.54
494 0.59
495 0.62
496 0.63
497 0.63
498 0.63
499 0.58
500 0.49
501 0.42
502 0.36
503 0.27
504 0.22
505 0.18
506 0.13
507 0.12
508 0.19
509 0.2
510 0.18
511 0.24
512 0.25
513 0.29
514 0.35
515 0.4
516 0.43
517 0.48
518 0.54
519 0.54
520 0.58
521 0.55
522 0.5
523 0.47
524 0.41
525 0.35
526 0.29
527 0.24
528 0.18
529 0.17
530 0.15
531 0.12
532 0.09
533 0.09
534 0.13
535 0.15
536 0.17
537 0.19
538 0.2
539 0.3
540 0.38
541 0.43
542 0.44
543 0.51
544 0.61
545 0.66
546 0.75
547 0.69
548 0.65
549 0.63
550 0.66
551 0.64
552 0.6
553 0.56
554 0.49
555 0.44
556 0.4
557 0.36
558 0.28
559 0.21
560 0.15
561 0.12
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.09
567 0.11
568 0.11
569 0.17
570 0.19
571 0.23
572 0.27
573 0.3
574 0.35
575 0.33
576 0.36
577 0.38
578 0.38
579 0.39
580 0.41
581 0.42
582 0.41
583 0.5
584 0.53
585 0.53
586 0.53
587 0.51
588 0.52
589 0.5
590 0.48
591 0.41
592 0.44
593 0.4
594 0.39
595 0.45
596 0.38
597 0.37
598 0.38
599 0.38
600 0.29
601 0.26
602 0.26
603 0.19
604 0.19
605 0.21
606 0.19
607 0.18
608 0.17
609 0.16
610 0.17
611 0.16
612 0.17
613 0.16
614 0.18
615 0.22
616 0.3
617 0.39
618 0.47
619 0.51
620 0.57
621 0.61
622 0.65
623 0.66
624 0.68
625 0.66
626 0.66
627 0.7
628 0.67
629 0.67
630 0.69
631 0.7
632 0.6
633 0.58
634 0.49
635 0.47
636 0.46
637 0.49
638 0.48
639 0.43
640 0.43
641 0.38
642 0.42
643 0.36
644 0.33
645 0.26
646 0.19
647 0.17
648 0.17
649 0.16
650 0.12
651 0.1
652 0.1
653 0.1
654 0.11
655 0.12
656 0.17
657 0.2
658 0.22
659 0.28
660 0.32
661 0.37
662 0.37
663 0.39
664 0.4
665 0.41
666 0.41
667 0.35
668 0.36
669 0.31
670 0.3
671 0.29
672 0.22
673 0.18
674 0.16
675 0.16
676 0.12
677 0.1
678 0.1
679 0.08
680 0.09
681 0.08
682 0.08
683 0.07
684 0.08
685 0.08
686 0.06
687 0.08
688 0.08
689 0.08
690 0.09
691 0.11
692 0.11
693 0.12
694 0.18
695 0.19
696 0.22
697 0.25
698 0.25
699 0.24
700 0.25
701 0.27
702 0.27
703 0.25
704 0.23
705 0.21
706 0.21
707 0.22
708 0.21
709 0.18
710 0.14
711 0.13
712 0.14
713 0.13
714 0.14
715 0.2
716 0.26
717 0.34
718 0.33
719 0.36
720 0.34
721 0.35
722 0.34
723 0.28
724 0.23
725 0.17
726 0.17
727 0.14
728 0.14
729 0.12
730 0.14
731 0.15
732 0.13
733 0.11
734 0.11
735 0.13
736 0.16
737 0.25
738 0.3
739 0.34
740 0.43
741 0.45
742 0.46
743 0.47
744 0.48
745 0.39
746 0.33
747 0.29
748 0.27
749 0.26
750 0.28
751 0.25
752 0.21
753 0.2
754 0.19
755 0.17
756 0.1
757 0.09
758 0.05
759 0.06
760 0.07
761 0.07
762 0.08
763 0.08
764 0.08
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.07
769 0.09
770 0.1
771 0.1
772 0.1
773 0.1
774 0.09
775 0.09
776 0.09
777 0.08
778 0.09
779 0.11
780 0.19
781 0.22
782 0.26
783 0.25
784 0.25
785 0.25
786 0.23
787 0.25
788 0.18
789 0.14
790 0.13
791 0.16
792 0.16
793 0.17
794 0.16
795 0.12
796 0.13
797 0.13
798 0.12
799 0.09
800 0.11
801 0.11
802 0.12
803 0.13
804 0.12
805 0.12
806 0.11
807 0.11
808 0.12
809 0.11
810 0.14
811 0.15
812 0.19
813 0.25
814 0.32
815 0.32
816 0.31
817 0.34
818 0.33
819 0.36
820 0.4
821 0.35
822 0.36
823 0.38
824 0.4
825 0.4
826 0.37
827 0.32
828 0.27
829 0.26
830 0.19
831 0.19
832 0.16
833 0.13
834 0.13
835 0.11
836 0.09
837 0.09
838 0.08
839 0.06
840 0.08
841 0.09
842 0.13
843 0.16
844 0.15