FuNGI

A0A178AAQ1

Protein Details

Accession

A0A178AAQ1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
650-688	SSQPQHSPPAKSKNKNRKQRAREKKEKEREQQQQQAQQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
433-437	KAKKR
520-541	MRGRGAWGDRGRGFRGRGGFGG
658-677	PAKSKNKNRKQRAREKKEKE

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MSDSLEPPAKRARLDGDADASLYGASLDAPGSPVDDMDDDFYDTTPVKPAALPMAEGSAPVYAAAAAAASGPASFQLPGLGGSLGETPATQPTPQSGAKADAQSPPEASEDGEVSDSEVFYHEQTAEVRVAAGQAQAPDASAQRGELSHPSLNPVSPTHAQDAAPVHVAAPEAGLVEAVAEGGASAQDESDGDDLALAITNGLAEEDGKTEFLQAAEANKNNKDAEWQLDSDASESGSSSDSSSDDSSDEEGSDDGELLDPEEQVRLLMAESLDEPGATKAKVKTLNEQEEQYEKPDITVTSETKITELGKVESVVDNIVVVKGKVSGDLQVLESGSALCLHNRTVIGKISEQIGRVEDPRYALGFNDATEITTLGIAKDTPIYYVDDHSTFVFTEPLRAQKHTDASNLHDEETNEVDFSDDEKEAEYKREQKAKKRARQDDDQEPAPVAKKIPTGPKGHVDVPNYYQPMEYQGGGLKYSDDEDEDLGMYKPLARPDHFEQIVGHGAPLEDRSHVRRGMMRGRGAWGDRGRGFRGRGGFGGRGDFAGGQADRGGHGGGRGDRGGHSGRGDQGNRGGAQGGRTDRTCYACGQVGHQKRECPTLKPQLDRGRQQNQGGQQQDNRQNNGPYQDQRSATSASPNRNQRGQSQQSSQPQHSPPAKSKNKNRKQRAREKKEKEREQQQQQAQQQQQQQQQQQQQQQQPQQHASPAPSGPIAPANTNAYANNSTAGWPQQYSHSPQPAAAYAPPPPPAAAASYAPQMPYAQPAAPVPAQAAAPAQQQANWAAWAQWIQVVQTMQQQQQAATAPPPPPQAPQPQAPPQPQYPYQYQQYAQPPQPPANPHQQPDAQSAQSLQDILRALGGAGQR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.42
3	0.38
4	0.36
5	0.35
6	0.31
7	0.25
8	0.18
9	0.14
10	0.1
11	0.05
12	0.05
13	0.05
14	0.05
15	0.05
16	0.06
17	0.06
18	0.08
19	0.08
20	0.08
21	0.09
22	0.1
23	0.1
24	0.12
25	0.13
26	0.13
27	0.14
28	0.14
29	0.14
30	0.14
31	0.14
32	0.16
33	0.15
34	0.15
35	0.15
36	0.17
37	0.21
38	0.21
39	0.22
40	0.18
41	0.2
42	0.19
43	0.19
44	0.18
45	0.11
46	0.1
47	0.09
48	0.09
49	0.05
50	0.05
51	0.05
52	0.04
53	0.04
54	0.04
55	0.04
56	0.04
57	0.04
58	0.04
59	0.04
60	0.06
61	0.06
62	0.06
63	0.07
64	0.07
65	0.08
66	0.09
67	0.09
68	0.08
69	0.09
70	0.1
71	0.09
72	0.09
73	0.08
74	0.08
75	0.12
76	0.14
77	0.13
78	0.12
79	0.15
80	0.21
81	0.22
82	0.23
83	0.22
84	0.24
85	0.29
86	0.32
87	0.31
88	0.31
89	0.33
90	0.32
91	0.31
92	0.28
93	0.25
94	0.21
95	0.19
96	0.16
97	0.14
98	0.13
99	0.13
100	0.11
101	0.11
102	0.11
103	0.1
104	0.09
105	0.1
106	0.09
107	0.09
108	0.11
109	0.1
110	0.11
111	0.12
112	0.15
113	0.14
114	0.13
115	0.13
116	0.11
117	0.11
118	0.1
119	0.1
120	0.09
121	0.09
122	0.1
123	0.1
124	0.1
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.11
132	0.12
133	0.15
134	0.19
135	0.2
136	0.2
137	0.24
138	0.24
139	0.25
140	0.25
141	0.22
142	0.24
143	0.24
144	0.27
145	0.26
146	0.27
147	0.27
148	0.28
149	0.3
150	0.26
151	0.24
152	0.21
153	0.17
154	0.15
155	0.16
156	0.12
157	0.09
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.05
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.03
167	0.02
168	0.02
169	0.03
170	0.03
171	0.03
172	0.03
173	0.03
174	0.03
175	0.04
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.04
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.04
193	0.05
194	0.06
195	0.07
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.08
202	0.12
203	0.17
204	0.2
205	0.23
206	0.24
207	0.26
208	0.25
209	0.25
210	0.24
211	0.22
212	0.23
213	0.23
214	0.23
215	0.21
216	0.22
217	0.22
218	0.19
219	0.17
220	0.12
221	0.09
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.08
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.09
233	0.1
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.07
241	0.07
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.05
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.04
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.07
263	0.07
264	0.09
265	0.08
266	0.12
267	0.12
268	0.18
269	0.24
270	0.26
271	0.33
272	0.41
273	0.49
274	0.47
275	0.47
276	0.43
277	0.41
278	0.4
279	0.33
280	0.25
281	0.18
282	0.16
283	0.16
284	0.14
285	0.15
286	0.18
287	0.16
288	0.16
289	0.18
290	0.18
291	0.16
292	0.18
293	0.15
294	0.13
295	0.14
296	0.13
297	0.13
298	0.13
299	0.14
300	0.13
301	0.12
302	0.1
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.07
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.08
313	0.08
314	0.09
315	0.1
316	0.11
317	0.11
318	0.1
319	0.1
320	0.09
321	0.09
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.07
329	0.09
330	0.09
331	0.1
332	0.11
333	0.14
334	0.15
335	0.15
336	0.15
337	0.16
338	0.17
339	0.17
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.14
344	0.14
345	0.12
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.11
350	0.1
351	0.11
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.09
371	0.09
372	0.11
373	0.12
374	0.11
375	0.12
376	0.11
377	0.11
378	0.1
379	0.09
380	0.1
381	0.08
382	0.11
383	0.12
384	0.18
385	0.19
386	0.2
387	0.22
388	0.23
389	0.27
390	0.25
391	0.27
392	0.22
393	0.24
394	0.3
395	0.28
396	0.25
397	0.23
398	0.21
399	0.2
400	0.2
401	0.17
402	0.1
403	0.09
404	0.09
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.09
412	0.09
413	0.12
414	0.13
415	0.18
416	0.23
417	0.31
418	0.35
419	0.43
420	0.53
421	0.61
422	0.66
423	0.7
424	0.75
425	0.72
426	0.77
427	0.74
428	0.71
429	0.65
430	0.59
431	0.48
432	0.4
433	0.34
434	0.27
435	0.21
436	0.13
437	0.1
438	0.11
439	0.14
440	0.21
441	0.26
442	0.28
443	0.3
444	0.34
445	0.35
446	0.37
447	0.38
448	0.33
449	0.3
450	0.29
451	0.32
452	0.28
453	0.25
454	0.21
455	0.17
456	0.19
457	0.18
458	0.14
459	0.11
460	0.12
461	0.12
462	0.12
463	0.12
464	0.08
465	0.07
466	0.08
467	0.08
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.07
478	0.08
479	0.12
480	0.15
481	0.15
482	0.2
483	0.25
484	0.33
485	0.32
486	0.31
487	0.27
488	0.27
489	0.28
490	0.22
491	0.17
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.09
496	0.08
497	0.07
498	0.09
499	0.12
500	0.16
501	0.17
502	0.18
503	0.2
504	0.25
505	0.31
506	0.35
507	0.34
508	0.31
509	0.33
510	0.34
511	0.31
512	0.32
513	0.25
514	0.25
515	0.26
516	0.28
517	0.28
518	0.29
519	0.3
520	0.27
521	0.29
522	0.25
523	0.24
524	0.24
525	0.24
526	0.2
527	0.21
528	0.18
529	0.15
530	0.14
531	0.12
532	0.09
533	0.1
534	0.09
535	0.07
536	0.08
537	0.08
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.05
542	0.06
543	0.08
544	0.09
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.11
549	0.14
550	0.15
551	0.14
552	0.15
553	0.15
554	0.18
555	0.23
556	0.24
557	0.22
558	0.23
559	0.24
560	0.23
561	0.22
562	0.19
563	0.14
564	0.15
565	0.18
566	0.17
567	0.17
568	0.17
569	0.2
570	0.21
571	0.24
572	0.23
573	0.2
574	0.21
575	0.22
576	0.22
577	0.24
578	0.31
579	0.35
580	0.4
581	0.41
582	0.42
583	0.4
584	0.49
585	0.47
586	0.42
587	0.43
588	0.47
589	0.51
590	0.51
591	0.58
592	0.59
593	0.64
594	0.66
595	0.66
596	0.63
597	0.62
598	0.61
599	0.57
600	0.54
601	0.54
602	0.5
603	0.46
604	0.43
605	0.46
606	0.53
607	0.53
608	0.5
609	0.46
610	0.45
611	0.44
612	0.44
613	0.41
614	0.36
615	0.37
616	0.39
617	0.37
618	0.37
619	0.37
620	0.35
621	0.3
622	0.35
623	0.34
624	0.34
625	0.41
626	0.46
627	0.48
628	0.5
629	0.51
630	0.48
631	0.54
632	0.56
633	0.54
634	0.52
635	0.56
636	0.6
637	0.64
638	0.6
639	0.56
640	0.51
641	0.53
642	0.54
643	0.51
644	0.5
645	0.56
646	0.63
647	0.65
648	0.74
649	0.77
650	0.81
651	0.87
652	0.9
653	0.9
654	0.91
655	0.93
656	0.93
657	0.93
658	0.94
659	0.93
660	0.94
661	0.94
662	0.93
663	0.91
664	0.9
665	0.89
666	0.88
667	0.87
668	0.83
669	0.81
670	0.77
671	0.77
672	0.71
673	0.67
674	0.64
675	0.63
676	0.63
677	0.62
678	0.62
679	0.61
680	0.65
681	0.66
682	0.67
683	0.68
684	0.69
685	0.69
686	0.69
687	0.67
688	0.65
689	0.62
690	0.56
691	0.51
692	0.46
693	0.4
694	0.38
695	0.32
696	0.27
697	0.23
698	0.21
699	0.18
700	0.2
701	0.19
702	0.16
703	0.18
704	0.2
705	0.21
706	0.22
707	0.21
708	0.21
709	0.21
710	0.2
711	0.18
712	0.16
713	0.15
714	0.17
715	0.19
716	0.16
717	0.15
718	0.16
719	0.21
720	0.24
721	0.3
722	0.36
723	0.4
724	0.38
725	0.39
726	0.41
727	0.36
728	0.35
729	0.3
730	0.24
731	0.23
732	0.25
733	0.26
734	0.24
735	0.23
736	0.21
737	0.2
738	0.2
739	0.18
740	0.17
741	0.16
742	0.19
743	0.19
744	0.18
745	0.18
746	0.17
747	0.15
748	0.17
749	0.18
750	0.15
751	0.16
752	0.17
753	0.21
754	0.2
755	0.2
756	0.17
757	0.16
758	0.15
759	0.14
760	0.15
761	0.12
762	0.14
763	0.16
764	0.16
765	0.15
766	0.17
767	0.18
768	0.18
769	0.17
770	0.15
771	0.13
772	0.15
773	0.15
774	0.13
775	0.14
776	0.13
777	0.12
778	0.16
779	0.16
780	0.16
781	0.22
782	0.26
783	0.26
784	0.3
785	0.3
786	0.27
787	0.3
788	0.31
789	0.25
790	0.22
791	0.25
792	0.23
793	0.26
794	0.31
795	0.29
796	0.31
797	0.35
798	0.43
799	0.43
800	0.48
801	0.52
802	0.57
803	0.63
804	0.65
805	0.65
806	0.61
807	0.63
808	0.61
809	0.59
810	0.57
811	0.56
812	0.56
813	0.56
814	0.51
815	0.52
816	0.56
817	0.58
818	0.56
819	0.56
820	0.55
821	0.55
822	0.6
823	0.57
824	0.53
825	0.56
826	0.58
827	0.53
828	0.56
829	0.55
830	0.53
831	0.54
832	0.55
833	0.44
834	0.39
835	0.37
836	0.32
837	0.28
838	0.26
839	0.19
840	0.17
841	0.18
842	0.17
843	0.16
844	0.13
845	0.12

A0A178AAQ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer