Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AQF6

Protein Details
Accession A0A178AQF6    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-132SSPAKAPSPKPTKKTAKPKAETSKGVKRKAAPPAKKAKKRRKTDSDDDMDDHydrophilic
215-238IDESPKKKSRQKKEPAAKAKKTEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-123AKAPSPKPTKKTAKPKAETSKGVKRKAAPPAKKAKKRRK
171-179KKPVKKAKK
219-247PKKKSRQKKEPAAKAKKTEKAAPKPKPAK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037647  HIRIP3  
Amino Acid Sequences MSDSEPNMPSEAAISRKLREVVIAIHKTGKAEDLTIKRVRVRAEKELGLEDGFLKKDSVWKQKSNDIIMQAVENDCKQAPQSSPAKAPSPKPTKKTAKPKAETSKGVKRKAAPPAKKAKKRRKTDSDDDMDDLSDEAPEELSEDESDAPKKPVRRGKNLVTEDSDEDATPKKPVKKAKKPVVEDDSDEAADTPPKKAAPPAAKDDFSESEMSSLIDESPKKKSRQKKEPAAKAKKTEKAAPKPKPAKVDDDADTAEIKRLQGWLVKCGIRKVWSKDPELSACDTSKDKIRVLKNMLKDVGMDGKYSVEKAAKIKEKREFEKDLAAIQEAEAHWGTAGDNGGGRPRRRAAAAAATKPQQKIQFSDDDDESEQEQDDGDSEDDDDDDDVKGDSGSDDDDDKAESMDEDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.32
4 0.34
5 0.31
6 0.29
7 0.29
8 0.29
9 0.37
10 0.38
11 0.34
12 0.37
13 0.38
14 0.37
15 0.35
16 0.31
17 0.22
18 0.21
19 0.28
20 0.29
21 0.35
22 0.39
23 0.41
24 0.42
25 0.45
26 0.48
27 0.49
28 0.51
29 0.53
30 0.55
31 0.54
32 0.53
33 0.52
34 0.47
35 0.38
36 0.32
37 0.24
38 0.2
39 0.18
40 0.16
41 0.14
42 0.13
43 0.21
44 0.29
45 0.38
46 0.42
47 0.48
48 0.52
49 0.58
50 0.64
51 0.61
52 0.57
53 0.49
54 0.43
55 0.37
56 0.33
57 0.28
58 0.23
59 0.19
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.16
66 0.16
67 0.23
68 0.28
69 0.3
70 0.35
71 0.38
72 0.44
73 0.44
74 0.48
75 0.51
76 0.56
77 0.59
78 0.58
79 0.65
80 0.69
81 0.74
82 0.8
83 0.8
84 0.81
85 0.79
86 0.85
87 0.84
88 0.82
89 0.79
90 0.76
91 0.76
92 0.73
93 0.73
94 0.68
95 0.63
96 0.62
97 0.66
98 0.68
99 0.65
100 0.65
101 0.71
102 0.77
103 0.82
104 0.85
105 0.86
106 0.86
107 0.88
108 0.9
109 0.89
110 0.88
111 0.88
112 0.87
113 0.82
114 0.75
115 0.66
116 0.56
117 0.45
118 0.36
119 0.27
120 0.16
121 0.09
122 0.07
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.1
134 0.11
135 0.13
136 0.15
137 0.19
138 0.26
139 0.34
140 0.41
141 0.49
142 0.55
143 0.61
144 0.68
145 0.68
146 0.63
147 0.57
148 0.52
149 0.44
150 0.38
151 0.3
152 0.2
153 0.17
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.17
158 0.2
159 0.25
160 0.35
161 0.45
162 0.54
163 0.64
164 0.71
165 0.76
166 0.75
167 0.78
168 0.74
169 0.65
170 0.56
171 0.48
172 0.39
173 0.3
174 0.26
175 0.18
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.18
185 0.22
186 0.26
187 0.32
188 0.34
189 0.34
190 0.34
191 0.36
192 0.3
193 0.25
194 0.22
195 0.15
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.19
206 0.24
207 0.29
208 0.36
209 0.46
210 0.54
211 0.64
212 0.72
213 0.75
214 0.79
215 0.85
216 0.89
217 0.89
218 0.84
219 0.82
220 0.79
221 0.74
222 0.68
223 0.65
224 0.64
225 0.64
226 0.69
227 0.68
228 0.71
229 0.73
230 0.73
231 0.73
232 0.65
233 0.62
234 0.54
235 0.52
236 0.43
237 0.38
238 0.35
239 0.28
240 0.26
241 0.19
242 0.18
243 0.14
244 0.12
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.14
249 0.15
250 0.17
251 0.21
252 0.24
253 0.24
254 0.26
255 0.28
256 0.29
257 0.34
258 0.37
259 0.42
260 0.45
261 0.48
262 0.5
263 0.51
264 0.49
265 0.45
266 0.41
267 0.34
268 0.29
269 0.27
270 0.24
271 0.21
272 0.26
273 0.26
274 0.25
275 0.3
276 0.34
277 0.4
278 0.47
279 0.51
280 0.49
281 0.52
282 0.5
283 0.43
284 0.39
285 0.33
286 0.32
287 0.26
288 0.22
289 0.16
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.17
294 0.12
295 0.14
296 0.18
297 0.26
298 0.33
299 0.38
300 0.45
301 0.51
302 0.58
303 0.62
304 0.65
305 0.63
306 0.56
307 0.59
308 0.53
309 0.47
310 0.4
311 0.35
312 0.27
313 0.21
314 0.22
315 0.14
316 0.16
317 0.14
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.16
328 0.23
329 0.24
330 0.27
331 0.31
332 0.33
333 0.34
334 0.36
335 0.35
336 0.39
337 0.46
338 0.45
339 0.47
340 0.49
341 0.52
342 0.51
343 0.51
344 0.47
345 0.42
346 0.41
347 0.41
348 0.44
349 0.43
350 0.47
351 0.42
352 0.4
353 0.38
354 0.35
355 0.31
356 0.24
357 0.2
358 0.15
359 0.14
360 0.11
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.09
380 0.1
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.12
388 0.11