Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AIT0

Protein Details
Accession A0A178AIT0    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MATDKKSSKKASGDKKSSKAAKTHydrophilic
104-128SESEAPKKKTKPAKKAIKKKAASVSHydrophilic
272-291AKPVKKAKKGGKKDASKDASBasic
396-423LIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGMIDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-19SKKASGDKKSSK
109-124PKKKTKPAKKAIKKKA
154-168SKTKKPAAAKVKKAK
273-285KPVKKAKKGGKKD
402-414KGFTKEKNKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MATDKKSSKKASGDKKSSKAAKTTARDAPTSTNVAASLASVQAFLTQKGHKDAAITLAEYEQWQASAASGGQDAPEPMDVDSSSASSSDSSSDSSSDSSSDASSESEAPKKKTKPAKKAIKKKAASVSSSSSSSSDSSSSSSDSDSDSDSDSKSKTKKPAAAKVKKAKSVSSSSASSSSSSSSDSDSDSSSSSDDEPANKPLPESDSDSSSDSSSSDSDSDSSSDSDAKKSTKSKKVAKAPSVASSSASSSSDSSDSSSDSSSSDSESEAEAKPVKKAKKGGKKDASKDASSSSSSSSDSSDSSSSDSSSESEAESAARKSASTDSSATLPAASPAPTGGKRKFEGSPSADTSVKAKKNHVENRFQRIKADTYVDPKLASNAYVSYDYADRAHQDLIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGMIDTSGGKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.84
4 0.82
5 0.77
6 0.73
7 0.7
8 0.69
9 0.66
10 0.67
11 0.65
12 0.61
13 0.57
14 0.53
15 0.51
16 0.46
17 0.44
18 0.36
19 0.29
20 0.25
21 0.25
22 0.22
23 0.16
24 0.13
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.12
30 0.14
31 0.14
32 0.17
33 0.19
34 0.22
35 0.28
36 0.29
37 0.24
38 0.25
39 0.25
40 0.27
41 0.26
42 0.23
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.16
47 0.16
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.1
91 0.11
92 0.14
93 0.19
94 0.24
95 0.28
96 0.35
97 0.39
98 0.46
99 0.54
100 0.62
101 0.66
102 0.73
103 0.8
104 0.82
105 0.9
106 0.92
107 0.92
108 0.84
109 0.8
110 0.79
111 0.73
112 0.65
113 0.58
114 0.52
115 0.44
116 0.42
117 0.36
118 0.27
119 0.23
120 0.21
121 0.18
122 0.13
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.18
140 0.22
141 0.27
142 0.33
143 0.39
144 0.45
145 0.51
146 0.61
147 0.67
148 0.71
149 0.75
150 0.77
151 0.77
152 0.76
153 0.69
154 0.62
155 0.56
156 0.52
157 0.46
158 0.4
159 0.35
160 0.3
161 0.31
162 0.29
163 0.24
164 0.19
165 0.16
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.12
183 0.14
184 0.17
185 0.18
186 0.18
187 0.17
188 0.16
189 0.17
190 0.17
191 0.2
192 0.18
193 0.18
194 0.19
195 0.2
196 0.2
197 0.18
198 0.16
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.13
215 0.14
216 0.17
217 0.24
218 0.33
219 0.38
220 0.46
221 0.54
222 0.61
223 0.69
224 0.74
225 0.71
226 0.68
227 0.61
228 0.58
229 0.51
230 0.43
231 0.34
232 0.26
233 0.23
234 0.18
235 0.16
236 0.12
237 0.1
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.11
256 0.1
257 0.12
258 0.14
259 0.15
260 0.19
261 0.25
262 0.28
263 0.3
264 0.38
265 0.46
266 0.54
267 0.62
268 0.69
269 0.72
270 0.77
271 0.78
272 0.8
273 0.75
274 0.65
275 0.57
276 0.49
277 0.42
278 0.34
279 0.3
280 0.21
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.15
285 0.14
286 0.13
287 0.14
288 0.13
289 0.12
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.12
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.11
308 0.15
309 0.16
310 0.17
311 0.18
312 0.18
313 0.2
314 0.2
315 0.18
316 0.15
317 0.13
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.08
322 0.09
323 0.13
324 0.17
325 0.24
326 0.27
327 0.31
328 0.33
329 0.36
330 0.39
331 0.38
332 0.43
333 0.41
334 0.43
335 0.41
336 0.43
337 0.4
338 0.37
339 0.38
340 0.38
341 0.4
342 0.36
343 0.37
344 0.41
345 0.51
346 0.59
347 0.63
348 0.65
349 0.67
350 0.74
351 0.77
352 0.71
353 0.64
354 0.59
355 0.55
356 0.49
357 0.46
358 0.4
359 0.37
360 0.41
361 0.38
362 0.35
363 0.31
364 0.3
365 0.25
366 0.22
367 0.17
368 0.14
369 0.16
370 0.17
371 0.16
372 0.15
373 0.16
374 0.16
375 0.16
376 0.16
377 0.16
378 0.16
379 0.17
380 0.16
381 0.16
382 0.19
383 0.23
384 0.28
385 0.27
386 0.25
387 0.3
388 0.32
389 0.38
390 0.39
391 0.44
392 0.49
393 0.59
394 0.69
395 0.75
396 0.82
397 0.84
398 0.9
399 0.91
400 0.91
401 0.91
402 0.89
403 0.87
404 0.85
405 0.79
406 0.69
407 0.59
408 0.52
409 0.42
410 0.35
411 0.28
412 0.21
413 0.17