Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AJP4

Protein Details
Accession A0A178AJP4    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-134GAAADGKNKKRKREKKEKDPNAPKKPLTBasic
253-273PSPPAAKTPRPNKRQKTAPATHydrophilic
307-329ASEPPAKKDSKKKAKAAPAPIAPHydrophilic
342-361EGSKTSKKAKSSRSTRNAEAHydrophilic
365-391KENAATPTVEKKKEKRDRSKRKSEVASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-131GKNKKRKREKKEKDPNAPKK
311-354PAKKDSKKKAKAAPAPIAPAPASSAKEGSPEEGSKTSKKAKSSR
374-387EKKKEKRDRSKRKS
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAPRTKKEDTGELQVSIEQYTRTRDQVIMSLTNLQSGLAHVQTGLNELLRAYMQHTASILAGEDGDVEKLQLPANVTATANAALEAATTAATGISQVVNASNQVTEGAAADGKNKKRKREKKEKDPNAPKKPLTAAFLYAQTARPIVRHDLENALAPGQVLEKNAVNLEVNKRWNELADEEKEEWKASYRQSMEEYKVDLAAYLAKAGDKAADVHIDEDMSDEGEAGIEAEVATIDSDASSDDDDETPVTKAPSPPAAKTPRPNKRQKTAPATATNGTVVATPAATSTPVPIPTSTRIAAQAAASSASEPPAKKDSKKKAKAAPAPIAPAPASSAKEGSPEEGSKTSKKAKSSRSTRNAEAEVDKENAATPTVEKKKEKRDRSKRKSEVAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.28
4 0.24
5 0.16
6 0.15
7 0.2
8 0.23
9 0.24
10 0.25
11 0.26
12 0.27
13 0.31
14 0.34
15 0.3
16 0.28
17 0.33
18 0.3
19 0.3
20 0.27
21 0.21
22 0.17
23 0.16
24 0.17
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.14
31 0.13
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.13
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.12
60 0.14
61 0.16
62 0.17
63 0.16
64 0.15
65 0.16
66 0.15
67 0.13
68 0.11
69 0.09
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.03
78 0.03
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.12
98 0.18
99 0.25
100 0.34
101 0.38
102 0.47
103 0.58
104 0.68
105 0.74
106 0.79
107 0.84
108 0.86
109 0.93
110 0.94
111 0.94
112 0.95
113 0.95
114 0.93
115 0.89
116 0.78
117 0.71
118 0.65
119 0.56
120 0.48
121 0.39
122 0.31
123 0.26
124 0.26
125 0.24
126 0.2
127 0.18
128 0.15
129 0.14
130 0.12
131 0.11
132 0.12
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.18
137 0.19
138 0.19
139 0.2
140 0.18
141 0.14
142 0.12
143 0.11
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.14
156 0.18
157 0.2
158 0.2
159 0.22
160 0.21
161 0.21
162 0.2
163 0.18
164 0.18
165 0.17
166 0.2
167 0.2
168 0.21
169 0.21
170 0.2
171 0.18
172 0.16
173 0.16
174 0.14
175 0.19
176 0.19
177 0.2
178 0.23
179 0.26
180 0.26
181 0.25
182 0.25
183 0.19
184 0.18
185 0.16
186 0.12
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.13
240 0.21
241 0.23
242 0.24
243 0.31
244 0.38
245 0.41
246 0.49
247 0.57
248 0.59
249 0.66
250 0.75
251 0.75
252 0.76
253 0.8
254 0.81
255 0.8
256 0.77
257 0.75
258 0.7
259 0.65
260 0.58
261 0.49
262 0.4
263 0.31
264 0.24
265 0.17
266 0.12
267 0.08
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.08
275 0.1
276 0.12
277 0.13
278 0.14
279 0.17
280 0.2
281 0.24
282 0.22
283 0.21
284 0.21
285 0.21
286 0.21
287 0.18
288 0.15
289 0.12
290 0.12
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.1
295 0.13
296 0.13
297 0.16
298 0.23
299 0.28
300 0.34
301 0.44
302 0.53
303 0.61
304 0.71
305 0.75
306 0.77
307 0.83
308 0.85
309 0.83
310 0.8
311 0.73
312 0.68
313 0.6
314 0.54
315 0.43
316 0.34
317 0.28
318 0.23
319 0.21
320 0.18
321 0.19
322 0.16
323 0.2
324 0.21
325 0.2
326 0.21
327 0.21
328 0.23
329 0.26
330 0.3
331 0.3
332 0.36
333 0.43
334 0.42
335 0.49
336 0.54
337 0.6
338 0.67
339 0.74
340 0.79
341 0.79
342 0.82
343 0.8
344 0.79
345 0.71
346 0.65
347 0.58
348 0.49
349 0.43
350 0.38
351 0.32
352 0.24
353 0.23
354 0.19
355 0.17
356 0.15
357 0.14
358 0.22
359 0.31
360 0.38
361 0.45
362 0.53
363 0.63
364 0.73
365 0.81
366 0.82
367 0.86
368 0.89
369 0.92
370 0.95
371 0.93