FuNGI

A0A178B3J3

Protein Details

Accession

A0A178B3J3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
175-198	FTEVSRKKKNSKQGQRKDRGSAKI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
180-194	RKKKNSKQGQRKDRG
519-535	GRVKVGAGKSVNSKRSR

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12.333, nucl 11.5, cyto 10, cyto_mito 7.499, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039907 NOB1 IPR017117 Nob1_euk IPR036283 NOB1_Zf-like_sf IPR014881 NOB1_Zn-bd IPR033411 Ribonuclease_PIN
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0004521 F:RNA endonuclease activity GO:0000469 P:cleavage involved in rRNA processing GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF08772 NOB1_Zn_bind PF17146 PIN_6
CDD	cd09876 PIN_Nob1-like

Amino Acid Sequences

MAAETPQKTIHSLILDTGPLIKNAVSSSTLINSAEELFTTPAIISEIRDEATRSRVQTTLMPFLKIRTPSPASYDAVIAFSKKTGDHAVLSRQDLGILALAYEIHCERNGGPWGLRDAPKQPPKMKPGEQHKAEKTEEVDGGVEIDAQQAPNDEVKVDDEIVTNEPQQEDALGEFTEVSRKKKNSKQGQRKDRGSAKIVQNRAPQAEQETIVATEQSQVPTSGLATNESITEQTTTPVVDSSTSESALAQGQVDSEQDAGTDPNSKSEQPVMNAESEVTADAVQESHEPASQESEPAQEQINQDLSTLNISTPPSPPVTDDDDSDGDWITPSNLTSRQAADSNTTDIPAEQIDVATMTTDFAMQNVLLQMNLHLLSTNMQRIKKLVSKVLRCHACFATVKQMDKQFCPRCGGATLKRVNCSINSRGEFRLHLAKNYQFNKRGDKYSIPKPIAGTANTKWSGLGGGQGGWGRELILAEDQKEYMKKQEEDRRSKGARDLMDDDYLPGILTGDRGAGRAGGRVKVGAGKSVNSKRSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.22
3	0.2
4	0.24
5	0.2
6	0.18
7	0.18
8	0.15
9	0.15
10	0.15
11	0.17
12	0.14
13	0.14
14	0.16
15	0.17
16	0.19
17	0.17
18	0.17
19	0.16
20	0.15
21	0.14
22	0.12
23	0.12
24	0.11
25	0.11
26	0.11
27	0.1
28	0.09
29	0.1
30	0.11
31	0.1
32	0.11
33	0.13
34	0.13
35	0.14
36	0.15
37	0.16
38	0.22
39	0.25
40	0.24
41	0.26
42	0.26
43	0.27
44	0.31
45	0.34
46	0.39
47	0.36
48	0.36
49	0.34
50	0.35
51	0.39
52	0.37
53	0.33
54	0.31
55	0.34
56	0.33
57	0.39
58	0.41
59	0.36
60	0.34
61	0.34
62	0.27
63	0.24
64	0.23
65	0.18
66	0.14
67	0.13
68	0.13
69	0.12
70	0.14
71	0.15
72	0.17
73	0.2
74	0.23
75	0.3
76	0.32
77	0.34
78	0.33
79	0.29
80	0.27
81	0.23
82	0.2
83	0.14
84	0.1
85	0.08
86	0.06
87	0.07
88	0.06
89	0.08
90	0.08
91	0.08
92	0.08
93	0.1
94	0.1
95	0.16
96	0.2
97	0.21
98	0.21
99	0.22
100	0.27
101	0.31
102	0.33
103	0.29
104	0.3
105	0.38
106	0.44
107	0.5
108	0.53
109	0.55
110	0.6
111	0.66
112	0.69
113	0.68
114	0.71
115	0.73
116	0.73
117	0.74
118	0.72
119	0.69
120	0.63
121	0.57
122	0.48
123	0.42
124	0.35
125	0.27
126	0.22
127	0.16
128	0.15
129	0.12
130	0.1
131	0.06
132	0.07
133	0.07
134	0.06
135	0.06
136	0.07
137	0.08
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.08
142	0.1
143	0.11
144	0.11
145	0.1
146	0.1
147	0.11
148	0.13
149	0.14
150	0.13
151	0.13
152	0.12
153	0.12
154	0.11
155	0.1
156	0.08
157	0.07
158	0.08
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.13
164	0.14
165	0.18
166	0.24
167	0.28
168	0.36
169	0.43
170	0.54
171	0.58
172	0.68
173	0.75
174	0.79
175	0.86
176	0.88
177	0.86
178	0.84
179	0.8
180	0.74
181	0.67
182	0.64
183	0.62
184	0.59
185	0.57
186	0.54
187	0.51
188	0.49
189	0.47
190	0.4
191	0.31
192	0.28
193	0.27
194	0.21
195	0.17
196	0.15
197	0.13
198	0.12
199	0.11
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.09
212	0.09
213	0.08
214	0.09
215	0.09
216	0.08
217	0.07
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.09
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.09
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.04
244	0.04
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.1
249	0.09
250	0.12
251	0.14
252	0.14
253	0.14
254	0.19
255	0.2
256	0.16
257	0.19
258	0.18
259	0.17
260	0.17
261	0.16
262	0.12
263	0.1
264	0.09
265	0.06
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.12
286	0.12
287	0.14
288	0.16
289	0.14
290	0.14
291	0.13
292	0.12
293	0.1
294	0.1
295	0.07
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.1
300	0.12
301	0.12
302	0.12
303	0.13
304	0.15
305	0.2
306	0.2
307	0.19
308	0.21
309	0.2
310	0.2
311	0.19
312	0.16
313	0.1
314	0.09
315	0.08
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.08
320	0.09
321	0.11
322	0.12
323	0.14
324	0.15
325	0.17
326	0.17
327	0.18
328	0.18
329	0.2
330	0.18
331	0.17
332	0.15
333	0.13
334	0.13
335	0.1
336	0.09
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.04
345	0.04
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.05
351	0.06
352	0.07
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.08
358	0.08
359	0.07
360	0.06
361	0.06
362	0.09
363	0.11
364	0.17
365	0.2
366	0.21
367	0.21
368	0.23
369	0.28
370	0.32
371	0.33
372	0.35
373	0.4
374	0.47
375	0.52
376	0.6
377	0.61
378	0.57
379	0.57
380	0.5
381	0.46
382	0.4
383	0.36
384	0.38
385	0.35
386	0.36
387	0.36
388	0.42
389	0.4
390	0.42
391	0.5
392	0.46
393	0.45
394	0.48
395	0.43
396	0.39
397	0.4
398	0.44
399	0.4
400	0.43
401	0.48
402	0.47
403	0.49
404	0.47
405	0.45
406	0.42
407	0.42
408	0.38
409	0.39
410	0.38
411	0.39
412	0.4
413	0.41
414	0.38
415	0.35
416	0.4
417	0.32
418	0.33
419	0.35
420	0.38
421	0.44
422	0.49
423	0.54
424	0.51
425	0.54
426	0.6
427	0.6
428	0.6
429	0.56
430	0.59
431	0.58
432	0.6
433	0.66
434	0.58
435	0.55
436	0.51
437	0.52
438	0.48
439	0.43
440	0.4
441	0.32
442	0.39
443	0.37
444	0.36
445	0.29
446	0.25
447	0.24
448	0.18
449	0.19
450	0.11
451	0.1
452	0.12
453	0.14
454	0.14
455	0.13
456	0.13
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.09
461	0.14
462	0.15
463	0.16
464	0.18
465	0.18
466	0.2
467	0.22
468	0.22
469	0.24
470	0.31
471	0.33
472	0.42
473	0.52
474	0.59
475	0.67
476	0.71
477	0.73
478	0.69
479	0.69
480	0.66
481	0.63
482	0.55
483	0.52
484	0.51
485	0.44
486	0.44
487	0.4
488	0.34
489	0.28
490	0.24
491	0.17
492	0.13
493	0.1
494	0.07
495	0.08
496	0.07
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.11
501	0.13
502	0.13
503	0.18
504	0.21
505	0.2
506	0.21
507	0.21
508	0.22
509	0.26
510	0.26
511	0.27
512	0.26
513	0.27
514	0.36
515	0.44

A0A178B3J3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer