Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AY88

Protein Details
Accession A0A178AY88    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34IPTSADPRSKRPTKKRALTPRDAHASHydrophilic
117-151LEKKDREKTEKNRLKREKARQRKERAKQGKKGDASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-24KRPTKKR
109-148AAKERKEELEKKDREKTEKNRLKREKARQRKERAKQGKKG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEPIPESIPTSADPRSKRPTKKRALTPRDAHASSVEALFAKPDRDINLPSSAVAKPLSAPPEIVANVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLRMMDEEVQREEDEKAAKERKEELEKKDREKTEKNRLKREKARQRKERAKQGKKGDASDKEGTPVADDSGKRKLAPRANGLAVNTEDDSANNEGGEVKNVEEIGLVIEDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.36
3 0.45
4 0.53
5 0.62
6 0.7
7 0.75
8 0.79
9 0.86
10 0.89
11 0.9
12 0.9
13 0.9
14 0.85
15 0.82
16 0.8
17 0.7
18 0.61
19 0.5
20 0.43
21 0.34
22 0.28
23 0.2
24 0.12
25 0.11
26 0.12
27 0.12
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.14
32 0.17
33 0.19
34 0.21
35 0.23
36 0.23
37 0.22
38 0.23
39 0.2
40 0.19
41 0.17
42 0.14
43 0.11
44 0.14
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.13
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.13
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.04
61 0.03
62 0.03
63 0.04
64 0.04
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.07
69 0.08
70 0.13
71 0.2
72 0.27
73 0.32
74 0.36
75 0.42
76 0.51
77 0.58
78 0.63
79 0.63
80 0.58
81 0.54
82 0.51
83 0.46
84 0.42
85 0.36
86 0.29
87 0.21
88 0.2
89 0.17
90 0.18
91 0.16
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.15
96 0.19
97 0.2
98 0.2
99 0.24
100 0.28
101 0.37
102 0.41
103 0.44
104 0.49
105 0.53
106 0.57
107 0.61
108 0.59
109 0.56
110 0.6
111 0.62
112 0.63
113 0.67
114 0.69
115 0.72
116 0.77
117 0.81
118 0.81
119 0.83
120 0.83
121 0.86
122 0.89
123 0.88
124 0.9
125 0.91
126 0.9
127 0.9
128 0.9
129 0.89
130 0.87
131 0.86
132 0.85
133 0.78
134 0.74
135 0.71
136 0.65
137 0.62
138 0.57
139 0.48
140 0.41
141 0.38
142 0.33
143 0.26
144 0.21
145 0.15
146 0.16
147 0.16
148 0.17
149 0.23
150 0.25
151 0.24
152 0.28
153 0.35
154 0.39
155 0.45
156 0.49
157 0.48
158 0.5
159 0.52
160 0.48
161 0.43
162 0.36
163 0.32
164 0.25
165 0.2
166 0.17
167 0.14
168 0.17
169 0.15
170 0.15
171 0.11
172 0.11
173 0.13
174 0.13
175 0.16
176 0.13
177 0.12
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.09