Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AGH1

Protein Details
Accession A0A178AGH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
434-462TQAPVVKKARPSRRMARHAKKNVNKDMTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
439-454VKKARPSRRMARHAKK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11.5, cyto_mito 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MALTCVHECALPQSLRYYFLRGNTMVPLVPADQLPFQLEGIPRQLTHRQASDEDWKFLQETNHTPVTLRLQAPTSPGTSPSEPEAKPRYLAPDHLVLKKPYASRAATPKDTPTLLSDPPASNNRKEPLRSGYRNPYPSGIVPDESKKEFCTHWIQTGSCAFVHIGCKYKHEMPAKEKLQELGFRETPWWYQQKPTVRADTWMQARLRYPDSSADESSPPPQFPNPSSWIKGPSPERDVQDKGERLISAPGQRLATKAPDKSVLNTVASLVAPETTGAQSGAFVLDLIDLHDDTDRSASLQVELGVSLGSLKISARLPPSTSQSSPIPRSTTGNTFGQGVPPRGHLRGNEGENAETDFMLPDKSYTGYSMESDVSDTKTPEAGLQFTRQCNETPELNGLVTSKHAIAPIEGSKYLPEANGESAANSTKPPAGKETQAPVVKKARPSRRMARHAKKNVNKDMTGGSGGVTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.3
3 0.31
4 0.34
5 0.29
6 0.33
7 0.38
8 0.33
9 0.34
10 0.33
11 0.33
12 0.27
13 0.24
14 0.21
15 0.17
16 0.17
17 0.15
18 0.15
19 0.14
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.17
25 0.18
26 0.19
27 0.23
28 0.23
29 0.22
30 0.26
31 0.32
32 0.33
33 0.37
34 0.38
35 0.38
36 0.38
37 0.43
38 0.49
39 0.46
40 0.44
41 0.39
42 0.36
43 0.33
44 0.33
45 0.31
46 0.26
47 0.28
48 0.3
49 0.33
50 0.32
51 0.31
52 0.32
53 0.35
54 0.36
55 0.31
56 0.28
57 0.27
58 0.28
59 0.31
60 0.3
61 0.26
62 0.2
63 0.22
64 0.25
65 0.23
66 0.24
67 0.25
68 0.3
69 0.28
70 0.34
71 0.38
72 0.35
73 0.35
74 0.35
75 0.38
76 0.33
77 0.36
78 0.32
79 0.35
80 0.37
81 0.42
82 0.45
83 0.38
84 0.39
85 0.41
86 0.39
87 0.35
88 0.36
89 0.33
90 0.34
91 0.43
92 0.47
93 0.46
94 0.46
95 0.45
96 0.43
97 0.41
98 0.36
99 0.31
100 0.29
101 0.25
102 0.25
103 0.25
104 0.23
105 0.27
106 0.33
107 0.32
108 0.31
109 0.36
110 0.39
111 0.41
112 0.41
113 0.41
114 0.42
115 0.48
116 0.51
117 0.52
118 0.57
119 0.6
120 0.62
121 0.59
122 0.52
123 0.45
124 0.41
125 0.4
126 0.31
127 0.25
128 0.24
129 0.26
130 0.28
131 0.28
132 0.27
133 0.22
134 0.23
135 0.22
136 0.24
137 0.28
138 0.26
139 0.3
140 0.33
141 0.31
142 0.32
143 0.33
144 0.3
145 0.22
146 0.2
147 0.15
148 0.13
149 0.15
150 0.14
151 0.19
152 0.18
153 0.21
154 0.24
155 0.28
156 0.33
157 0.38
158 0.42
159 0.42
160 0.51
161 0.52
162 0.5
163 0.47
164 0.42
165 0.37
166 0.35
167 0.33
168 0.29
169 0.27
170 0.25
171 0.25
172 0.24
173 0.23
174 0.24
175 0.26
176 0.2
177 0.23
178 0.29
179 0.37
180 0.41
181 0.44
182 0.44
183 0.39
184 0.41
185 0.4
186 0.39
187 0.33
188 0.33
189 0.3
190 0.25
191 0.27
192 0.27
193 0.28
194 0.23
195 0.21
196 0.2
197 0.24
198 0.26
199 0.26
200 0.24
201 0.22
202 0.23
203 0.25
204 0.21
205 0.17
206 0.15
207 0.15
208 0.16
209 0.16
210 0.2
211 0.22
212 0.24
213 0.26
214 0.26
215 0.29
216 0.27
217 0.31
218 0.3
219 0.29
220 0.31
221 0.32
222 0.33
223 0.33
224 0.34
225 0.32
226 0.35
227 0.31
228 0.27
229 0.25
230 0.23
231 0.19
232 0.19
233 0.18
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.17
239 0.17
240 0.16
241 0.2
242 0.2
243 0.2
244 0.19
245 0.23
246 0.23
247 0.24
248 0.27
249 0.23
250 0.2
251 0.19
252 0.18
253 0.14
254 0.14
255 0.12
256 0.07
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.04
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.06
299 0.07
300 0.1
301 0.13
302 0.15
303 0.17
304 0.2
305 0.26
306 0.28
307 0.28
308 0.29
309 0.31
310 0.36
311 0.38
312 0.38
313 0.35
314 0.32
315 0.35
316 0.35
317 0.34
318 0.32
319 0.3
320 0.27
321 0.26
322 0.25
323 0.27
324 0.27
325 0.25
326 0.22
327 0.25
328 0.28
329 0.27
330 0.29
331 0.24
332 0.27
333 0.32
334 0.33
335 0.33
336 0.31
337 0.3
338 0.28
339 0.29
340 0.22
341 0.15
342 0.13
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.1
352 0.11
353 0.12
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.15
364 0.15
365 0.15
366 0.16
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.23
371 0.27
372 0.29
373 0.31
374 0.29
375 0.28
376 0.3
377 0.32
378 0.28
379 0.25
380 0.26
381 0.26
382 0.25
383 0.24
384 0.2
385 0.16
386 0.15
387 0.14
388 0.12
389 0.11
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.17
394 0.19
395 0.21
396 0.21
397 0.2
398 0.19
399 0.2
400 0.2
401 0.16
402 0.15
403 0.14
404 0.15
405 0.18
406 0.17
407 0.16
408 0.17
409 0.18
410 0.17
411 0.15
412 0.15
413 0.16
414 0.18
415 0.2
416 0.25
417 0.27
418 0.32
419 0.37
420 0.41
421 0.46
422 0.51
423 0.5
424 0.51
425 0.55
426 0.55
427 0.58
428 0.62
429 0.63
430 0.66
431 0.73
432 0.77
433 0.79
434 0.85
435 0.87
436 0.88
437 0.88
438 0.91
439 0.93
440 0.92
441 0.91
442 0.91
443 0.87
444 0.77
445 0.69
446 0.62
447 0.54
448 0.47
449 0.37