Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B3V4

Protein Details
Accession A0A178B3V4    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-103EEASAPKKRMGRPPKKVSTAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-34RGRPKRSAAPEPAPVANASKKRGR
50-73PKKRGRIAKAVVIEAAPKRGRRSN
86-99SAPKKRMGRPPKKV
111-146ALKKRMGRPPKKETAPVDVPAAIPKARIGRPRKIEA
153-163ATPKRRGPKSR
181-265TKSRSQPATKKAIPAPRLNPRLRAKLRTRQPPTPKVEQQVAPAPTKRRGRPPKAGPQQVAAPKQAIGRRATSKTAAKPVAPRKKR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 10.5, cyto_nucl 8.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MPPKAQATAQRGRPKRSAAPEPAPVANASKKRGRVAKTQDADEVEVADPPKKRGRIAKAVVIEAAPKRGRRSNVAPAVAPVEEEASAPKKRMGRPPKKVSTAATATIEVPALKKRMGRPPKKETAPVDVPAAIPKARIGRPRKIEAAVVEESATPKRRGPKSRTSAIGLDLSRVAGSSRVTKSRSQPATKKAIPAPRLNPRLRAKLRTRQPPTPKVEQQVAPAPTKRRGRPPKAGPQQVAAPKQAIGRRATSKTAAKPVAPRKKRGYTALHIPDKYAAQIQRYLQELVEAEVVPISAVEEALVQVEEEDAGPGAAADEVEEVDVEEPITVVEEETVITSGGGNAADEEDVLALAEQLDGAEHSSLGGDLEQGADIDPMDVAEDIVAEVAEDIAEDIVAEVANSALDTEPIQATAAVEVELGIQETAQAEQAMIDTAEALESELNDKENALDGLDTRLSSEDGTDAYIGGAAPSVADSVLFGQEILSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.7
3 0.71
4 0.71
5 0.7
6 0.71
7 0.7
8 0.68
9 0.63
10 0.55
11 0.47
12 0.42
13 0.41
14 0.39
15 0.38
16 0.4
17 0.43
18 0.5
19 0.56
20 0.57
21 0.59
22 0.63
23 0.69
24 0.67
25 0.65
26 0.62
27 0.57
28 0.54
29 0.44
30 0.36
31 0.26
32 0.23
33 0.21
34 0.21
35 0.2
36 0.23
37 0.31
38 0.31
39 0.36
40 0.43
41 0.51
42 0.57
43 0.61
44 0.64
45 0.6
46 0.59
47 0.55
48 0.46
49 0.41
50 0.32
51 0.34
52 0.3
53 0.29
54 0.33
55 0.38
56 0.42
57 0.45
58 0.51
59 0.54
60 0.59
61 0.59
62 0.54
63 0.49
64 0.47
65 0.39
66 0.32
67 0.21
68 0.14
69 0.11
70 0.1
71 0.12
72 0.14
73 0.16
74 0.17
75 0.21
76 0.26
77 0.32
78 0.43
79 0.51
80 0.57
81 0.67
82 0.77
83 0.82
84 0.81
85 0.79
86 0.72
87 0.68
88 0.61
89 0.54
90 0.45
91 0.37
92 0.31
93 0.28
94 0.25
95 0.17
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.19
101 0.25
102 0.35
103 0.46
104 0.54
105 0.6
106 0.68
107 0.76
108 0.77
109 0.78
110 0.71
111 0.69
112 0.64
113 0.56
114 0.48
115 0.39
116 0.35
117 0.29
118 0.28
119 0.18
120 0.14
121 0.14
122 0.18
123 0.22
124 0.3
125 0.35
126 0.42
127 0.48
128 0.54
129 0.55
130 0.51
131 0.49
132 0.42
133 0.41
134 0.33
135 0.27
136 0.22
137 0.18
138 0.18
139 0.2
140 0.21
141 0.17
142 0.19
143 0.28
144 0.35
145 0.44
146 0.5
147 0.57
148 0.61
149 0.67
150 0.67
151 0.62
152 0.55
153 0.49
154 0.46
155 0.35
156 0.29
157 0.22
158 0.19
159 0.14
160 0.13
161 0.11
162 0.07
163 0.08
164 0.13
165 0.16
166 0.2
167 0.23
168 0.27
169 0.33
170 0.41
171 0.47
172 0.49
173 0.52
174 0.55
175 0.62
176 0.59
177 0.59
178 0.55
179 0.55
180 0.52
181 0.52
182 0.51
183 0.52
184 0.58
185 0.54
186 0.58
187 0.55
188 0.61
189 0.59
190 0.61
191 0.59
192 0.6
193 0.67
194 0.69
195 0.69
196 0.68
197 0.73
198 0.74
199 0.73
200 0.72
201 0.68
202 0.61
203 0.59
204 0.52
205 0.46
206 0.43
207 0.4
208 0.33
209 0.33
210 0.32
211 0.35
212 0.4
213 0.4
214 0.44
215 0.52
216 0.57
217 0.64
218 0.69
219 0.73
220 0.75
221 0.78
222 0.68
223 0.6
224 0.58
225 0.53
226 0.47
227 0.37
228 0.28
229 0.23
230 0.26
231 0.26
232 0.23
233 0.19
234 0.21
235 0.24
236 0.26
237 0.27
238 0.27
239 0.3
240 0.3
241 0.35
242 0.32
243 0.3
244 0.35
245 0.44
246 0.5
247 0.49
248 0.53
249 0.54
250 0.59
251 0.61
252 0.6
253 0.57
254 0.5
255 0.57
256 0.59
257 0.57
258 0.5
259 0.47
260 0.42
261 0.35
262 0.31
263 0.26
264 0.18
265 0.14
266 0.18
267 0.18
268 0.2
269 0.21
270 0.21
271 0.17
272 0.17
273 0.16
274 0.13
275 0.13
276 0.1
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.04
294 0.03
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.08
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.05
423 0.06
424 0.05
425 0.06
426 0.05
427 0.06
428 0.08
429 0.09
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.13
435 0.13
436 0.11
437 0.11
438 0.1
439 0.14
440 0.16
441 0.15
442 0.13
443 0.14
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.11
448 0.1
449 0.12
450 0.11
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.08