Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178BCF5

Protein Details
Accession A0A178BCF5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-43TTASHAGVKRKRDPSKPERRQSKSKTRRKSPSEDGNDPQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-34VKRKRDPSKPERRQSKSKTRRKS
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPGQTTASHAGVKRKRDPSKPERRQSKSKTRRKSPSEDGNDPQTEILRLEAQIVESRKHYNNIATLLKTARQPEAENEAPILAVVALCRVFSRLLATGDMVKSKGMAEAEAVIAAWLKERYKEYLDILMKDFLQSEHPPKQSVALTLLMRLVKEESTAQKDYNVKNGPLPKLVETLLFLPTDDLNRDEFAEKYFKQFDDIRYYTFQTIQKVMKLELEMPTRHLVASNCLSLLSSLEEAPKSTADIQNFYTQSQTKSPISSVRAYKEKAQEAWLATMRCGLTKEQRKSVLMAFSNQIAPWFQQPEMLMDFLTDSYNVGGATSLLALSGLYFLISEKNLDYPSFYIKLYSLLDEGLLHSKHRSRFFRLLDTFMSSTHLPAALVASFIKRLSRLALHGPPAGIVVVIPWVYNMFKRHPACTYMMHRDIRDPSLQDTLEEEGMDDPFDMAESDPMLSNAIESSVWELEALQTHYHPNVATLAKIISEQFTKRSYNLEDFLDHSYTALLDVELNRDLKKDPEVEFEIPKRIFTAEEGLNPLGQLFMQVVEAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.67
3 0.72
4 0.79
5 0.8
6 0.85
7 0.88
8 0.89
9 0.9
10 0.89
11 0.91
12 0.91
13 0.91
14 0.91
15 0.9
16 0.91
17 0.9
18 0.93
19 0.91
20 0.9
21 0.88
22 0.88
23 0.87
24 0.83
25 0.77
26 0.75
27 0.68
28 0.59
29 0.49
30 0.4
31 0.32
32 0.25
33 0.22
34 0.15
35 0.14
36 0.16
37 0.15
38 0.15
39 0.2
40 0.22
41 0.22
42 0.22
43 0.28
44 0.29
45 0.32
46 0.33
47 0.32
48 0.35
49 0.39
50 0.41
51 0.36
52 0.36
53 0.35
54 0.35
55 0.34
56 0.32
57 0.3
58 0.28
59 0.29
60 0.31
61 0.36
62 0.36
63 0.33
64 0.3
65 0.26
66 0.23
67 0.21
68 0.16
69 0.08
70 0.06
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.12
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.17
84 0.2
85 0.21
86 0.22
87 0.19
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.12
106 0.15
107 0.19
108 0.22
109 0.25
110 0.25
111 0.32
112 0.35
113 0.34
114 0.34
115 0.32
116 0.28
117 0.26
118 0.24
119 0.15
120 0.17
121 0.19
122 0.23
123 0.29
124 0.31
125 0.32
126 0.32
127 0.35
128 0.32
129 0.3
130 0.26
131 0.23
132 0.21
133 0.21
134 0.23
135 0.2
136 0.18
137 0.17
138 0.15
139 0.11
140 0.12
141 0.14
142 0.16
143 0.22
144 0.24
145 0.23
146 0.27
147 0.33
148 0.33
149 0.39
150 0.38
151 0.33
152 0.36
153 0.42
154 0.4
155 0.37
156 0.38
157 0.3
158 0.28
159 0.28
160 0.23
161 0.18
162 0.17
163 0.15
164 0.13
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.18
178 0.17
179 0.2
180 0.23
181 0.21
182 0.24
183 0.27
184 0.29
185 0.33
186 0.33
187 0.32
188 0.31
189 0.33
190 0.31
191 0.32
192 0.31
193 0.24
194 0.27
195 0.26
196 0.26
197 0.25
198 0.25
199 0.21
200 0.2
201 0.19
202 0.19
203 0.22
204 0.19
205 0.2
206 0.21
207 0.19
208 0.18
209 0.19
210 0.15
211 0.15
212 0.17
213 0.15
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.11
218 0.11
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.1
229 0.13
230 0.13
231 0.15
232 0.16
233 0.21
234 0.21
235 0.2
236 0.21
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.23
241 0.18
242 0.19
243 0.2
244 0.21
245 0.23
246 0.26
247 0.27
248 0.27
249 0.3
250 0.31
251 0.35
252 0.36
253 0.36
254 0.32
255 0.31
256 0.3
257 0.27
258 0.28
259 0.25
260 0.2
261 0.17
262 0.19
263 0.16
264 0.14
265 0.14
266 0.13
267 0.19
268 0.28
269 0.31
270 0.33
271 0.36
272 0.37
273 0.37
274 0.38
275 0.35
276 0.27
277 0.25
278 0.21
279 0.19
280 0.19
281 0.17
282 0.15
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.11
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.06
299 0.05
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.11
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.13
344 0.18
345 0.24
346 0.32
347 0.35
348 0.38
349 0.47
350 0.5
351 0.57
352 0.54
353 0.52
354 0.45
355 0.45
356 0.38
357 0.3
358 0.29
359 0.19
360 0.17
361 0.15
362 0.13
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.12
376 0.13
377 0.16
378 0.21
379 0.25
380 0.28
381 0.28
382 0.28
383 0.25
384 0.23
385 0.2
386 0.13
387 0.08
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.07
395 0.11
396 0.14
397 0.16
398 0.25
399 0.27
400 0.3
401 0.32
402 0.35
403 0.35
404 0.39
405 0.43
406 0.43
407 0.48
408 0.48
409 0.46
410 0.47
411 0.48
412 0.44
413 0.4
414 0.33
415 0.29
416 0.31
417 0.31
418 0.26
419 0.24
420 0.23
421 0.2
422 0.18
423 0.16
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.09
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.06
444 0.06
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.13
452 0.15
453 0.12
454 0.13
455 0.16
456 0.16
457 0.18
458 0.16
459 0.14
460 0.18
461 0.17
462 0.17
463 0.15
464 0.15
465 0.14
466 0.15
467 0.15
468 0.13
469 0.16
470 0.17
471 0.2
472 0.24
473 0.26
474 0.26
475 0.31
476 0.34
477 0.36
478 0.37
479 0.36
480 0.33
481 0.33
482 0.36
483 0.32
484 0.26
485 0.2
486 0.17
487 0.15
488 0.14
489 0.12
490 0.07
491 0.08
492 0.1
493 0.12
494 0.15
495 0.17
496 0.17
497 0.18
498 0.19
499 0.2
500 0.25
501 0.27
502 0.26
503 0.32
504 0.38
505 0.41
506 0.47
507 0.47
508 0.5
509 0.45
510 0.43
511 0.37
512 0.31
513 0.29
514 0.24
515 0.27
516 0.22
517 0.26
518 0.3
519 0.29
520 0.28
521 0.27
522 0.24
523 0.18
524 0.14
525 0.11
526 0.07
527 0.07