Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B9E7

Protein Details
Accession A0A178B9E7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
258-282TNEIIKRPTARRKSRKGAKTQQIENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
263-275KRPTARRKSRKGA
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MDAPPSLAREISPPRALKRRRLSVPAGKDANAPKQDDVEPKLAAIEAGKAKIDDHLTYFTKRLSKASRQTAPIVARLTREDFAALYDGNDHDHGNHFVVHQHNHPRAGVHYDLRLQFSKSSSISFALPKGLPGNPNSRSIGRMAIETRVHNYWNHLIESASSKTGSLLIWDTGTYEVLPRKTASSNRNGIPSLQTTDDDSDGSDSPSPAAPTKLNNKCGGPGHENEKLIAAFQTRYIRLRLHGTRLPDNYTVILRLPTNEIIKRPTARRKSRKGAKTQQIENPSDSENEEQLQPQEQGDEEDLDTDTDEDAQTRATNAYPGSQNTIGSVHQRHWSLQLDRQNSGFVLDRSESSGSKGTWVRGRDGGGFEAFIVRGRDHERSVVTGRLAKEVESDEGVEGYVGRAGWVGIEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.58
3 0.64
4 0.67
5 0.7
6 0.73
7 0.73
8 0.76
9 0.78
10 0.78
11 0.8
12 0.79
13 0.72
14 0.62
15 0.61
16 0.59
17 0.59
18 0.53
19 0.48
20 0.39
21 0.4
22 0.44
23 0.44
24 0.44
25 0.39
26 0.34
27 0.31
28 0.3
29 0.26
30 0.22
31 0.16
32 0.17
33 0.15
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.21
39 0.23
40 0.18
41 0.18
42 0.23
43 0.25
44 0.28
45 0.29
46 0.29
47 0.32
48 0.32
49 0.36
50 0.39
51 0.46
52 0.53
53 0.61
54 0.64
55 0.62
56 0.64
57 0.64
58 0.58
59 0.53
60 0.47
61 0.38
62 0.34
63 0.33
64 0.33
65 0.27
66 0.24
67 0.2
68 0.17
69 0.16
70 0.16
71 0.13
72 0.09
73 0.11
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.13
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.13
84 0.17
85 0.21
86 0.22
87 0.26
88 0.33
89 0.36
90 0.37
91 0.37
92 0.34
93 0.32
94 0.34
95 0.31
96 0.24
97 0.23
98 0.27
99 0.28
100 0.31
101 0.3
102 0.26
103 0.25
104 0.25
105 0.26
106 0.22
107 0.21
108 0.19
109 0.19
110 0.2
111 0.19
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.18
118 0.19
119 0.2
120 0.27
121 0.25
122 0.29
123 0.3
124 0.29
125 0.28
126 0.27
127 0.28
128 0.2
129 0.21
130 0.18
131 0.21
132 0.22
133 0.22
134 0.23
135 0.21
136 0.21
137 0.19
138 0.22
139 0.22
140 0.22
141 0.22
142 0.19
143 0.18
144 0.18
145 0.21
146 0.19
147 0.15
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.11
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.06
162 0.08
163 0.1
164 0.1
165 0.12
166 0.11
167 0.13
168 0.16
169 0.23
170 0.26
171 0.3
172 0.35
173 0.36
174 0.38
175 0.36
176 0.34
177 0.3
178 0.26
179 0.21
180 0.17
181 0.15
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.12
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.13
199 0.23
200 0.28
201 0.31
202 0.33
203 0.32
204 0.34
205 0.36
206 0.37
207 0.3
208 0.27
209 0.29
210 0.31
211 0.31
212 0.28
213 0.26
214 0.21
215 0.18
216 0.16
217 0.12
218 0.08
219 0.11
220 0.15
221 0.15
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.27
227 0.26
228 0.29
229 0.3
230 0.33
231 0.37
232 0.38
233 0.4
234 0.33
235 0.31
236 0.26
237 0.24
238 0.2
239 0.15
240 0.14
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.14
245 0.18
246 0.19
247 0.2
248 0.21
249 0.25
250 0.29
251 0.33
252 0.41
253 0.47
254 0.57
255 0.65
256 0.72
257 0.79
258 0.84
259 0.85
260 0.86
261 0.86
262 0.85
263 0.83
264 0.8
265 0.76
266 0.73
267 0.67
268 0.58
269 0.49
270 0.41
271 0.33
272 0.29
273 0.23
274 0.17
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.12
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.13
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.09
302 0.08
303 0.1
304 0.1
305 0.14
306 0.17
307 0.18
308 0.23
309 0.23
310 0.22
311 0.21
312 0.22
313 0.19
314 0.22
315 0.23
316 0.2
317 0.24
318 0.25
319 0.25
320 0.29
321 0.35
322 0.33
323 0.38
324 0.44
325 0.43
326 0.43
327 0.42
328 0.39
329 0.32
330 0.3
331 0.27
332 0.19
333 0.19
334 0.19
335 0.19
336 0.21
337 0.23
338 0.21
339 0.2
340 0.25
341 0.2
342 0.25
343 0.27
344 0.29
345 0.32
346 0.34
347 0.35
348 0.34
349 0.37
350 0.34
351 0.34
352 0.32
353 0.27
354 0.25
355 0.21
356 0.2
357 0.17
358 0.16
359 0.16
360 0.13
361 0.16
362 0.21
363 0.25
364 0.25
365 0.29
366 0.28
367 0.31
368 0.34
369 0.35
370 0.33
371 0.34
372 0.33
373 0.35
374 0.33
375 0.28
376 0.28
377 0.27
378 0.26
379 0.22
380 0.22
381 0.17
382 0.17
383 0.17
384 0.13
385 0.11
386 0.09
387 0.09
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07