Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178A969

Protein Details
Accession A0A178A969    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-324GDIKRKLGQERENKPRQRFRGDWBasic
334-355KQQGGRYKGKWGRKSHIENETPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-347KRKLGQERENKPRQRFRGDWEADTKKGRIKQQGGRYKGKWGRK
Subcellular Location(s) cyto 14, pero 4, cysk 4, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MEQPHGEVLEGVFAVAKPAFVSSADVLLKLQATFAPSKLFAPLLQSQPKRPSKSDDQVFKMGHGGTLDPLAAGVLIVGIGRGTKHLNRYLACTKTYETVVLFGASTDTYDCTGVVDERASYEHVTKELVEARLAQFRGSISQMPPLYSALKIDGIKACEYAREGKVLPRELEAREMMVDECTLLEWHSGGEHDFGPHEDKALAQAPAARIRLTVSSGFYVRSFAHDLGLACASRSHMASLLRTRQADYTVEETGASEELIAAITYEDLEFGEEIWSAKLTPQLLAWVAANPILTGHVNGRSGDIKRKLGQERENKPRQRFRGDWEADTKKGRIKQQGGRYKGKWGRKSHIENETPCAAEPEVTNRVDGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.07
5 0.08
6 0.09
7 0.09
8 0.13
9 0.12
10 0.17
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.14
17 0.14
18 0.09
19 0.13
20 0.14
21 0.15
22 0.18
23 0.18
24 0.18
25 0.2
26 0.2
27 0.16
28 0.21
29 0.25
30 0.29
31 0.38
32 0.4
33 0.45
34 0.54
35 0.63
36 0.63
37 0.6
38 0.61
39 0.62
40 0.69
41 0.71
42 0.7
43 0.67
44 0.69
45 0.66
46 0.58
47 0.51
48 0.41
49 0.33
50 0.25
51 0.19
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.08
56 0.08
57 0.06
58 0.05
59 0.04
60 0.03
61 0.02
62 0.02
63 0.02
64 0.02
65 0.02
66 0.03
67 0.03
68 0.05
69 0.09
70 0.12
71 0.18
72 0.24
73 0.29
74 0.29
75 0.37
76 0.42
77 0.42
78 0.4
79 0.37
80 0.33
81 0.31
82 0.31
83 0.26
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.14
88 0.12
89 0.09
90 0.09
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.11
113 0.13
114 0.16
115 0.16
116 0.14
117 0.15
118 0.16
119 0.21
120 0.21
121 0.18
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.16
127 0.12
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.1
137 0.13
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.12
146 0.14
147 0.16
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.17
152 0.22
153 0.24
154 0.23
155 0.21
156 0.22
157 0.21
158 0.23
159 0.2
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.11
164 0.08
165 0.08
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.11
188 0.13
189 0.12
190 0.09
191 0.11
192 0.12
193 0.16
194 0.17
195 0.14
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.12
206 0.13
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.12
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.08
223 0.1
224 0.12
225 0.15
226 0.21
227 0.25
228 0.28
229 0.28
230 0.29
231 0.27
232 0.28
233 0.26
234 0.23
235 0.2
236 0.17
237 0.17
238 0.16
239 0.15
240 0.13
241 0.12
242 0.09
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.05
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.1
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.1
283 0.13
284 0.15
285 0.15
286 0.17
287 0.2
288 0.23
289 0.31
290 0.34
291 0.36
292 0.39
293 0.47
294 0.52
295 0.56
296 0.63
297 0.64
298 0.68
299 0.74
300 0.8
301 0.8
302 0.82
303 0.83
304 0.82
305 0.81
306 0.75
307 0.72
308 0.73
309 0.69
310 0.65
311 0.64
312 0.62
313 0.56
314 0.57
315 0.52
316 0.47
317 0.49
318 0.52
319 0.52
320 0.56
321 0.61
322 0.67
323 0.75
324 0.75
325 0.78
326 0.72
327 0.73
328 0.73
329 0.74
330 0.72
331 0.7
332 0.72
333 0.73
334 0.8
335 0.78
336 0.8
337 0.78
338 0.72
339 0.7
340 0.65
341 0.56
342 0.47
343 0.41
344 0.31
345 0.25
346 0.23
347 0.25
348 0.27
349 0.26