Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B7T5

Protein Details
Accession A0A178B7T5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-39PPSSIAPVVKRKRRASCLGEQERRERKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-25RKRR
34-40RRERKRA
Subcellular Location(s) mito_nucl 13.333, nucl 13, mito 12.5, cyto_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046347  bZIP_sf  
IPR021833  DUF3425  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11905  DUF3425  
CDD cd14688  bZIP_YAP  
Amino Acid Sequences MVTRRASDAAPPPSSIAPVVKRKRRASCLGEQERRERKRAIDREAQRSLREKTKTHIAELERTIQILRDQDRNGATASLLSEIDVLRAENERLRDVIDSVKSVIGCDLLPRSTGTNNGAGNDVGQEHSPAASSVGQRSPKPRTVSFANDTKPALPTPIESHNPFDYQDAMSTSSRPLDLDGMTIMTGSEMPEAPDPNIGMDLDPVAESPEQEAEELPWGNDPATATWAPMMAEIFGPNWRCPSPVVLHIGNPESPAPSTSNALCPIWKKSNELFGKVFSYRSSSGTGSLTNLPRSEAGLLYLGIQKGWDKTSNEWMQSPALQILKQVDELLFCHLPNMERLAVAYKSLKLLKYYLNATKEELDKVPEWLRPSHAQSSTKHPVAVDFFAWPTLRDRLVQNHEEIFKNGDLSRCYSEYLRFDWPFSFEDAFFYDERADHHYPSPLFERYHRDLKYWTVDPKFYQRFPEMKSDIEGDRRRFCEVEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.32
3 0.29
4 0.3
5 0.38
6 0.48
7 0.54
8 0.63
9 0.7
10 0.78
11 0.8
12 0.81
13 0.79
14 0.79
15 0.81
16 0.82
17 0.82
18 0.78
19 0.8
20 0.81
21 0.78
22 0.73
23 0.66
24 0.64
25 0.67
26 0.7
27 0.68
28 0.68
29 0.71
30 0.75
31 0.8
32 0.74
33 0.68
34 0.66
35 0.64
36 0.62
37 0.6
38 0.52
39 0.49
40 0.56
41 0.53
42 0.5
43 0.52
44 0.47
45 0.49
46 0.5
47 0.5
48 0.4
49 0.38
50 0.34
51 0.29
52 0.28
53 0.26
54 0.26
55 0.27
56 0.27
57 0.32
58 0.33
59 0.33
60 0.31
61 0.25
62 0.21
63 0.16
64 0.16
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.17
82 0.16
83 0.21
84 0.19
85 0.18
86 0.18
87 0.2
88 0.18
89 0.18
90 0.17
91 0.12
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.14
99 0.14
100 0.17
101 0.18
102 0.2
103 0.21
104 0.21
105 0.21
106 0.19
107 0.18
108 0.15
109 0.13
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.1
119 0.11
120 0.15
121 0.2
122 0.24
123 0.26
124 0.32
125 0.37
126 0.4
127 0.45
128 0.42
129 0.42
130 0.44
131 0.49
132 0.49
133 0.49
134 0.44
135 0.41
136 0.41
137 0.37
138 0.33
139 0.25
140 0.22
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.21
145 0.24
146 0.24
147 0.28
148 0.28
149 0.28
150 0.27
151 0.24
152 0.2
153 0.16
154 0.16
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.06
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.14
230 0.14
231 0.16
232 0.2
233 0.19
234 0.19
235 0.2
236 0.21
237 0.18
238 0.16
239 0.13
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.19
253 0.24
254 0.25
255 0.26
256 0.26
257 0.36
258 0.36
259 0.38
260 0.34
261 0.29
262 0.31
263 0.28
264 0.27
265 0.18
266 0.2
267 0.17
268 0.18
269 0.19
270 0.16
271 0.17
272 0.18
273 0.18
274 0.15
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.18
279 0.17
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.11
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.15
296 0.15
297 0.18
298 0.28
299 0.31
300 0.32
301 0.31
302 0.31
303 0.27
304 0.26
305 0.25
306 0.18
307 0.16
308 0.14
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.15
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.13
322 0.13
323 0.14
324 0.17
325 0.12
326 0.11
327 0.12
328 0.15
329 0.14
330 0.15
331 0.16
332 0.13
333 0.16
334 0.19
335 0.2
336 0.18
337 0.21
338 0.23
339 0.25
340 0.3
341 0.33
342 0.33
343 0.33
344 0.33
345 0.35
346 0.32
347 0.31
348 0.27
349 0.24
350 0.22
351 0.25
352 0.26
353 0.25
354 0.25
355 0.24
356 0.28
357 0.3
358 0.34
359 0.38
360 0.41
361 0.43
362 0.42
363 0.5
364 0.53
365 0.5
366 0.45
367 0.38
368 0.35
369 0.34
370 0.34
371 0.26
372 0.19
373 0.18
374 0.19
375 0.2
376 0.17
377 0.17
378 0.18
379 0.18
380 0.19
381 0.22
382 0.28
383 0.36
384 0.38
385 0.37
386 0.39
387 0.41
388 0.41
389 0.39
390 0.34
391 0.27
392 0.27
393 0.25
394 0.24
395 0.23
396 0.25
397 0.29
398 0.26
399 0.27
400 0.27
401 0.31
402 0.3
403 0.32
404 0.37
405 0.33
406 0.34
407 0.33
408 0.34
409 0.3
410 0.31
411 0.29
412 0.2
413 0.22
414 0.22
415 0.23
416 0.2
417 0.19
418 0.17
419 0.15
420 0.17
421 0.22
422 0.23
423 0.23
424 0.26
425 0.32
426 0.31
427 0.34
428 0.37
429 0.34
430 0.35
431 0.37
432 0.43
433 0.43
434 0.52
435 0.49
436 0.47
437 0.45
438 0.49
439 0.52
440 0.49
441 0.51
442 0.47
443 0.5
444 0.51
445 0.59
446 0.6
447 0.55
448 0.55
449 0.54
450 0.55
451 0.55
452 0.61
453 0.53
454 0.47
455 0.48
456 0.45
457 0.42
458 0.46
459 0.5
460 0.46
461 0.51
462 0.51
463 0.52