Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AVS8

Protein Details
Accession A0A178AVS8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-351ELPFGRPVTRGKKPEKQPSPAVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-242KPRKAGASRQSKRKA
323-343RPPPKRELPFGRPVTRGKKPE
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.333, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Amino Acid Sequences MADRHIICVEPASGRGELVVVQVQQDEHGTRPLDLHLVGCEGENPYVTTIQERNLAKLKHKFKGTDDEWAAVLSHFLLQQPAKDQPSILHGVRLVYTLKDSLTLSLRQDVQGIKVTLGEIVLPQDDSYEFNPFEWAQASAKAHSQTLQELADLRARSKSGQDTIAKLNAQLDDFIKTKDETETAMLQQFMVLLNEKKRKIRDQSRLLATAKVDSSVAPAVQSTRNVTKPRKAGASRQSKRKAPAQPAEADVKSEEDSDQMEIDQAKEGEQDSDEATAATPEPSDDETDEEESVAPPTRAKSSETLRASSVAKASKDEPPTDGRPPPKRELPFGRPVTRGKKPEKQPSPAVDDDEDTEDEEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.14
4 0.12
5 0.13
6 0.15
7 0.11
8 0.12
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.16
13 0.15
14 0.13
15 0.18
16 0.19
17 0.18
18 0.19
19 0.2
20 0.2
21 0.18
22 0.18
23 0.13
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.13
35 0.16
36 0.16
37 0.18
38 0.24
39 0.24
40 0.27
41 0.33
42 0.36
43 0.39
44 0.48
45 0.53
46 0.53
47 0.58
48 0.57
49 0.54
50 0.62
51 0.56
52 0.57
53 0.51
54 0.45
55 0.39
56 0.36
57 0.32
58 0.21
59 0.19
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.16
68 0.21
69 0.22
70 0.22
71 0.22
72 0.19
73 0.24
74 0.28
75 0.25
76 0.21
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.21
81 0.16
82 0.11
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.19
93 0.2
94 0.19
95 0.21
96 0.19
97 0.18
98 0.22
99 0.21
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.14
104 0.13
105 0.11
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.08
114 0.09
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.14
119 0.13
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.1
124 0.13
125 0.14
126 0.13
127 0.16
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.17
132 0.14
133 0.15
134 0.14
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.15
145 0.17
146 0.16
147 0.21
148 0.22
149 0.24
150 0.26
151 0.28
152 0.25
153 0.22
154 0.21
155 0.16
156 0.15
157 0.13
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.09
168 0.1
169 0.12
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.14
181 0.2
182 0.22
183 0.26
184 0.3
185 0.36
186 0.45
187 0.53
188 0.57
189 0.6
190 0.66
191 0.66
192 0.67
193 0.61
194 0.53
195 0.43
196 0.35
197 0.27
198 0.19
199 0.15
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.17
211 0.22
212 0.29
213 0.33
214 0.37
215 0.41
216 0.43
217 0.48
218 0.47
219 0.5
220 0.53
221 0.61
222 0.61
223 0.67
224 0.7
225 0.67
226 0.68
227 0.68
228 0.66
229 0.64
230 0.65
231 0.59
232 0.55
233 0.53
234 0.54
235 0.46
236 0.39
237 0.3
238 0.24
239 0.19
240 0.17
241 0.14
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.09
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.05
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.12
273 0.14
274 0.16
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.13
279 0.14
280 0.14
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.17
285 0.18
286 0.21
287 0.25
288 0.29
289 0.39
290 0.4
291 0.41
292 0.38
293 0.39
294 0.38
295 0.34
296 0.33
297 0.29
298 0.26
299 0.27
300 0.29
301 0.33
302 0.36
303 0.36
304 0.34
305 0.35
306 0.4
307 0.43
308 0.48
309 0.5
310 0.55
311 0.6
312 0.65
313 0.67
314 0.66
315 0.69
316 0.72
317 0.7
318 0.71
319 0.72
320 0.7
321 0.66
322 0.7
323 0.69
324 0.69
325 0.7
326 0.69
327 0.7
328 0.74
329 0.81
330 0.82
331 0.81
332 0.81
333 0.79
334 0.78
335 0.71
336 0.66
337 0.56
338 0.49
339 0.44
340 0.38
341 0.32