Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JQG8

Protein Details
Accession J5JQG8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
286-308EDEAKPQAKKVKKEKSTKDSSDSHydrophilic
370-392ITKGKGFTKAKNKMKKGSFRGGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
378-385KAKNKMKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 9.166, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSAPPAWLFSNNSDAVAAATPTAADPKTTPDRPSTRTMGKKGGSTAVAAPAAPALLMDIVERFLKDHAFTDAHKAFRAQRKEKGLVTKDKDIVVAGPTLDEVFAWWQRAAAKIDEDSADSSDSSESSDSSDDDENDSSDEEEVTKKQEVTKSLKRKAPESDSDSSEEDSDSDLSDSSDDEEEDKEEKPQAKKQKTTITIKLGESDNKMDIDSASDSDSDSSDLDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSESDSDSDSSSSEVEKAAAVSLPSSDSSSADSSSDSDLSSSSSEDEAKPQAKKVKKEKSTKDSSDSSVTLDRASPVAEPPLPPAPVAKRKQNEPFSRIPKNIKVDARFASNEWVPMDYSQRAHEDLIITKGKGFTKAKNKMKKGSFRGGVIDITEKKAVYFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.18
4 0.15
5 0.09
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.12
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.19
14 0.28
15 0.32
16 0.34
17 0.4
18 0.47
19 0.5
20 0.56
21 0.56
22 0.57
23 0.62
24 0.65
25 0.64
26 0.6
27 0.59
28 0.55
29 0.53
30 0.44
31 0.37
32 0.33
33 0.28
34 0.26
35 0.22
36 0.19
37 0.14
38 0.13
39 0.11
40 0.08
41 0.05
42 0.04
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.16
55 0.17
56 0.18
57 0.27
58 0.3
59 0.3
60 0.3
61 0.31
62 0.35
63 0.41
64 0.51
65 0.48
66 0.51
67 0.58
68 0.63
69 0.65
70 0.67
71 0.66
72 0.66
73 0.66
74 0.65
75 0.59
76 0.55
77 0.5
78 0.4
79 0.34
80 0.25
81 0.2
82 0.12
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.1
91 0.12
92 0.11
93 0.13
94 0.14
95 0.18
96 0.19
97 0.17
98 0.18
99 0.17
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.15
104 0.14
105 0.13
106 0.1
107 0.11
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.1
117 0.12
118 0.11
119 0.13
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.12
132 0.13
133 0.16
134 0.19
135 0.25
136 0.32
137 0.41
138 0.48
139 0.54
140 0.57
141 0.55
142 0.55
143 0.57
144 0.55
145 0.52
146 0.49
147 0.45
148 0.44
149 0.45
150 0.42
151 0.36
152 0.29
153 0.22
154 0.15
155 0.12
156 0.1
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.09
172 0.13
173 0.18
174 0.2
175 0.27
176 0.36
177 0.41
178 0.45
179 0.5
180 0.56
181 0.58
182 0.62
183 0.61
184 0.57
185 0.53
186 0.49
187 0.46
188 0.39
189 0.33
190 0.28
191 0.23
192 0.18
193 0.15
194 0.14
195 0.12
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.13
275 0.17
276 0.22
277 0.22
278 0.26
279 0.34
280 0.39
281 0.48
282 0.55
283 0.61
284 0.66
285 0.75
286 0.8
287 0.81
288 0.85
289 0.81
290 0.76
291 0.69
292 0.63
293 0.58
294 0.48
295 0.41
296 0.35
297 0.3
298 0.25
299 0.22
300 0.19
301 0.15
302 0.15
303 0.12
304 0.1
305 0.14
306 0.15
307 0.15
308 0.18
309 0.22
310 0.22
311 0.21
312 0.25
313 0.29
314 0.37
315 0.42
316 0.48
317 0.48
318 0.56
319 0.66
320 0.71
321 0.72
322 0.68
323 0.73
324 0.72
325 0.75
326 0.73
327 0.71
328 0.68
329 0.67
330 0.68
331 0.66
332 0.61
333 0.59
334 0.55
335 0.54
336 0.47
337 0.41
338 0.4
339 0.33
340 0.32
341 0.27
342 0.26
343 0.21
344 0.21
345 0.24
346 0.21
347 0.22
348 0.22
349 0.24
350 0.25
351 0.24
352 0.25
353 0.24
354 0.23
355 0.28
356 0.28
357 0.26
358 0.26
359 0.3
360 0.29
361 0.35
362 0.36
363 0.39
364 0.46
365 0.57
366 0.65
367 0.71
368 0.77
369 0.78
370 0.85
371 0.86
372 0.84
373 0.83
374 0.79
375 0.71
376 0.68
377 0.61
378 0.52
379 0.44
380 0.43
381 0.35
382 0.33
383 0.32
384 0.27
385 0.25